More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2366 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  100 
 
 
353 aa  689    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  44.03 
 
 
337 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  45.94 
 
 
355 aa  279  6e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  48.24 
 
 
363 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  48.76 
 
 
363 aa  270  2e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  46.86 
 
 
330 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  43.18 
 
 
330 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  49.38 
 
 
345 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  40.29 
 
 
346 aa  257  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  46.71 
 
 
315 aa  251  1e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  50 
 
 
334 aa  246  3e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  50 
 
 
334 aa  246  3e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  41.74 
 
 
356 aa  241  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2134  transport system permease protein  47.88 
 
 
357 aa  237  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0133047 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  40.11 
 
 
361 aa  236  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  44.17 
 
 
387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  46.03 
 
 
380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  37.43 
 
 
350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  44.21 
 
 
315 aa  230  3e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  40.18 
 
 
359 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  45.86 
 
 
338 aa  227  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  43.08 
 
 
348 aa  226  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0603  transport system permease protein  47.37 
 
 
316 aa  226  6e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.39796  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  39.89 
 
 
371 aa  226  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3104  iron compound ABC transporter, permease protein  48.47 
 
 
359 aa  222  7e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  38.29 
 
 
350 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1711  transport system permease protein  48.08 
 
 
335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  41.29 
 
 
370 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  44.48 
 
 
350 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  42.72 
 
 
358 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  42.42 
 
 
367 aa  217  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2493  corrinoid ABC transporter permease  46.88 
 
 
373 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2311  transport system permease protein  46.74 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  40.83 
 
 
333 aa  212  7e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  37.43 
 
 
362 aa  211  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  37.54 
 
 
334 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  37.32 
 
 
367 aa  210  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  40.47 
 
 
336 aa  209  7e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  38.6 
 
 
352 aa  208  9e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  42.41 
 
 
347 aa  208  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  39.46 
 
 
369 aa  207  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  41.03 
 
 
336 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  40.14 
 
 
366 aa  206  4e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  34 
 
 
343 aa  206  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0417  transport system permease protein  42.68 
 
 
344 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  33.71 
 
 
343 aa  206  5e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  40.73 
 
 
354 aa  206  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  38.33 
 
 
343 aa  205  8e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  37.92 
 
 
347 aa  204  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  42.16 
 
 
370 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4500  transport system permease protein  42.33 
 
 
363 aa  203  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.744299  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4080  transport system permease protein  42.3 
 
 
362 aa  203  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.812252  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0259  transport system permease protein  42.07 
 
 
321 aa  202  7e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.950369  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  38.66 
 
 
341 aa  202  9e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  38.31 
 
 
344 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1268  transport system permease protein  43.49 
 
 
345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  42.57 
 
 
356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2792  corrinoid ABC transporter permease  47.54 
 
 
362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.525724  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0754  FecCD transport family protein  42.66 
 
 
345 aa  200  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.671626  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1070  transport system permease protein  42.86 
 
 
342 aa  200  3e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  35.28 
 
 
368 aa  200  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  38.93 
 
 
345 aa  200  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5563  hemin ABC transporter, permease protein, putative  37.67 
 
 
346 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  41.55 
 
 
351 aa  199  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  37.79 
 
 
331 aa  199  7.999999999999999e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  38.04 
 
 
340 aa  199  9e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  35.96 
 
 
355 aa  198  9e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  38.57 
 
 
340 aa  199  9e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0657  ABC-type transporter, permease component  39.94 
 
 
346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_28  iron ion transport system, inner membrane component  34.46 
 
 
347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1266  transport system permease protein  40.75 
 
 
344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6328  transport system permease protein  43 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  35.28 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  33.62 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  37.83 
 
 
356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  42.07 
 
 
357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  38.69 
 
 
340 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  41 
 
 
340 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0845  transport system permease protein  39.37 
 
 
322 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  37.2 
 
 
332 aa  196  5.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3883  transport system permease protein  41.67 
 
 
353 aa  196  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.807545  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  40.14 
 
 
337 aa  196  7e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0605  transport system permease protein  41.98 
 
 
340 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0868  transport system permease protein  39.37 
 
 
322 aa  195  9e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2167  transport system permease protein  42.41 
 
 
341 aa  195  9e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0116294  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  36.23 
 
 
336 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  40.41 
 
 
336 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  39.46 
 
 
367 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  37.23 
 
 
369 aa  194  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  37.69 
 
 
334 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  37.69 
 
 
334 aa  194  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  37.05 
 
 
332 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  37.29 
 
 
383 aa  193  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  36.42 
 
 
345 aa  194  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  37.69 
 
 
334 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  38.36 
 
 
329 aa  194  3e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.03 
 
 
678 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.03 
 
 
678 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.03 
 
 
678 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  37.95 
 
 
372 aa  193  4e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>