More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3598 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3598  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
278 aa  569  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0123942  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  55.19 
 
 
291 aa  310  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5002  MCP methyltransferase, CheR-type  57.62 
 
 
274 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  56.51 
 
 
276 aa  303  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  54.91 
 
 
276 aa  290  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1788  MCP methyltransferase, CheR-type  55.15 
 
 
316 aa  289  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.275448  normal  0.703081 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  54.65 
 
 
272 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1529  MCP methyltransferase, CheR-type  47.06 
 
 
273 aa  259  5.0000000000000005e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  49.62 
 
 
289 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  46.56 
 
 
292 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  46.56 
 
 
294 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  46.18 
 
 
291 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  45.04 
 
 
291 aa  242  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  48.11 
 
 
289 aa  242  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  45.79 
 
 
285 aa  241  9e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  45.79 
 
 
285 aa  241  9e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  48.4 
 
 
285 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  47.53 
 
 
292 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  45.56 
 
 
287 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  46.21 
 
 
288 aa  235  8e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  45.8 
 
 
292 aa  234  8e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  46.21 
 
 
288 aa  234  9e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0524  MCP methyltransferase, CheR-type  42.8 
 
 
280 aa  233  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4228  MCP methyltransferase, CheR-type  41.67 
 
 
274 aa  232  6e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1912  Protein-glutamate O-methyltransferase  43.87 
 
 
278 aa  230  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0842494  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  45.25 
 
 
296 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  44.28 
 
 
290 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1695  MCP methyltransferase, CheR-type  46.39 
 
 
289 aa  225  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  42.49 
 
 
289 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  43.51 
 
 
292 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  43.12 
 
 
278 aa  217  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  43.12 
 
 
274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  42.75 
 
 
274 aa  212  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  40 
 
 
275 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  40 
 
 
275 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  40 
 
 
275 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  39.27 
 
 
282 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  39.64 
 
 
275 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.64 
 
 
275 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3485  protein-glutamate O-methyltransferase  38.18 
 
 
280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405571  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1928  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.55 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  36.13 
 
 
414 aa  192  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1069  protein-glutamate O-methyltransferase  37.59 
 
 
278 aa  190  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0178115  normal  0.0152511 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  40.32 
 
 
267 aa  186  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  38.93 
 
 
275 aa  185  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0521  protein-glutamate O-methyltransferase  39.19 
 
 
275 aa  181  9.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.644079  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0095  MCP methyltransferase, CheR-type  41.04 
 
 
275 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3582  MCP methyltransferase, CheR-type  36.59 
 
 
302 aa  179  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3101  MCP methyltransferase, CheR-type  36.8 
 
 
278 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0448745  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  36.86 
 
 
275 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.23 
 
 
275 aa  176  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0925  MCP methyltransferase, CheR-type  39.22 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2214  MCP methyltransferase, CheR-type  36.4 
 
 
285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.67 
 
 
276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1793  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.35 
 
 
275 aa  171  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  36.12 
 
 
280 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1339  MCP methyltransferase, CheR-type  37.45 
 
 
277 aa  170  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  34.94 
 
 
275 aa  169  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  37.36 
 
 
275 aa  168  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1344  MCP methyltransferase, CheR-type  37.55 
 
 
277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.841955  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3251  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.02 
 
 
279 aa  166  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1476  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.66 
 
 
276 aa  166  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  37.78 
 
 
275 aa  166  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0215  MCP methyltransferase, CheR-type  40.46 
 
 
294 aa  165  8e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.177352  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3088  protein-glutamate O-methyltransferase  38.2 
 
 
277 aa  165  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  38.64 
 
 
279 aa  165  9e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2963  protein-glutamate O-methyltransferase  38.49 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.643676  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3101  protein-glutamate O-methyltransferase  38.49 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2948  protein-glutamate O-methyltransferase  38.49 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  38.49 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1258  MCP methyltransferase, CheR-type  38.64 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1328  MCP methyltransferase, CheR-type  38.64 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  37.96 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2598  protein-glutamate O-methyltransferase  38.26 
 
 
279 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2339  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.67 
 
 
275 aa  163  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2319  protein-glutamate O-methyltransferase  37.97 
 
 
277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.945432  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1160  MCP methyltransferase, CheR-type  37.88 
 
 
277 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  34.85 
 
 
280 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1302  protein-glutamate O-methyltransferase  37.36 
 
 
279 aa  160  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  36.11 
 
 
273 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  36.61 
 
 
288 aa  155  8e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0069  MCP methyltransferase, CheR-type  33.86 
 
 
280 aa  155  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1528  MCP methyltransferase, CheR-type  38.49 
 
 
266 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.168715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  32.05 
 
 
285 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2434  putative MCP methyltransferase, CheR1  33.45 
 
 
305 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3546  MCP methyltransferase, CheR-type  36.47 
 
 
267 aa  142  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  0.882443 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1736  MCP methyltransferase, CheR-type  30.53 
 
 
290 aa  142  8e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0460074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  37.55 
 
 
269 aa  142  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711153  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1098  protein-glutamate O-methyltransferase  34.14 
 
 
305 aa  142  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0645  protein-glutamate O-methyltransferase  38.17 
 
 
302 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0464454  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  36.55 
 
 
298 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2146  MCP methyltransferase, CheR-type  34.85 
 
 
271 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0910  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.14 
 
 
269 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0875  MCP methyltransferase, CheR-type  32.41 
 
 
271 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  32.8 
 
 
309 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0614  MCP methyltransferase, CheR-type  29.78 
 
 
275 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3469  MCP methyltransferase, CheR-type  35.39 
 
 
280 aa  138  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.912759  normal  0.640591 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  29.45 
 
 
297 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1796  protein-glutamate O-methyltransferase  36.47 
 
 
294 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  29.1 
 
 
283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>