More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1614 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1614  ATPase domain-containing protein  100 
 
 
455 aa  887    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.959517  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 
490 aa  278  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.56 
 
 
447 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.82 
 
 
457 aa  249  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0702  histidine kinase  40.12 
 
 
523 aa  246  8e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 
464 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2314  histidine kinase  37.34 
 
 
450 aa  234  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.697892  normal  0.500466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1325  ATP-binding region ATPase domain protein  40.26 
 
 
505 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1611  ATPase domain-containing protein  38.27 
 
 
452 aa  226  9e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.584949  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1359  histidine kinase  37.97 
 
 
469 aa  225  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  37.53 
 
 
454 aa  222  8e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4533  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 
484 aa  218  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.66 
 
 
475 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  0.0334865 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  49.09 
 
 
420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1599  ATPase domain-containing protein  38.9 
 
 
453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0461  histidine kinase  41.11 
 
 
453 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 
586 aa  203  5e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1595  ATPase domain-containing protein  41.34 
 
 
481 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.147276  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  36.41 
 
 
490 aa  195  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0101  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.62 
 
 
472 aa  190  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1555  histidine kinase  41.73 
 
 
442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2105  histidine kinase  33.48 
 
 
480 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.922613 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01700  signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 
492 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.560312  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  34.49 
 
 
476 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 
352 aa  178  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
465 aa  177  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0838031  hitchhiker  0.00424045 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5469  histidine kinase  44.37 
 
 
456 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3372  histidine kinase  37.81 
 
 
465 aa  171  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 
471 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  29.22 
 
 
477 aa  167  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
504 aa  167  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
469 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0845  histidine kinase  37.31 
 
 
456 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000238884  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 
470 aa  160  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
509 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4843  histidine kinase  30.49 
 
 
405 aa  156  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 
438 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  33.09 
 
 
471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  34.81 
 
 
486 aa  153  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 
455 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.03 
 
 
469 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
452 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 
469 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
477 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  36.71 
 
 
469 aa  150  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  32.48 
 
 
466 aa  149  9e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  38.91 
 
 
508 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0988  sensor histidine kinase ArlS  27.11 
 
 
456 aa  147  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101467  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
495 aa  147  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
459 aa  147  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  39.07 
 
 
555 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  35.71 
 
 
490 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  26.18 
 
 
471 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1475  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 
451 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1504  ATPase domain-containing protein  30.35 
 
 
451 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
478 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.66 
 
 
504 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 
524 aa  144  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 
515 aa  144  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  29.13 
 
 
477 aa  143  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
532 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
532 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
517 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4440  histidine kinase  34.67 
 
 
480 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.91 
 
 
466 aa  141  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 
551 aa  140  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0818729  normal  0.0245433 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
534 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  36.17 
 
 
566 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2297  histidine kinase  34.88 
 
 
467 aa  140  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.465362 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  35.71 
 
 
469 aa  139  8.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
465 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  31.39 
 
 
461 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  29.66 
 
 
469 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 
469 aa  139  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  26.96 
 
 
472 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 
563 aa  138  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
460 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
477 aa  137  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 
513 aa  136  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  35.67 
 
 
475 aa  136  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
474 aa  136  8e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 
491 aa  136  9e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0255402  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 
477 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 
513 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
479 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  32.99 
 
 
460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  26.23 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  34.68 
 
 
463 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1872  histidine kinase  26.42 
 
 
482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
524 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  32.84 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 
498 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 
476 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296973  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.81 
 
 
469 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2324  histidine kinase  37.5 
 
 
561 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00982982  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
377 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5705  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 
494 aa  134  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205358  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>