More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0275 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0275  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 213 aa  423  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.68494  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3539  uracil phosphoribosyltransferase  79.25 
 
 		 212 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.434465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8568  uracil phosphoribosyltransferase  76.08 
 
 		 217 aa  319  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0766288  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9322  Uracil phosphoribosyltransferase  76.42 
 
 		 212 aa  318  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26040  uracil phosphoribosyltransferase  73.58 
 
 		 212 aa  318  3e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4937  uracil phosphoribosyltransferase  74.06 
 
 		 215 aa  309  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4832  uracil phosphoribosyltransferase  75.35 
 
 		 217 aa  308  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0647  uracil phosphoribosyltransferase  72.3 
 
 		 211 aa  303  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0800  uracil phosphoribosyltransferase  71.36 
 
 		 211 aa  299  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0482  uracil phosphoribosyltransferase  70.75 
 
 		 211 aa  296  1e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.715144 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0515  uracil phosphoribosyltransferase  75 
 
 		 211 aa  296  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00743886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0471  uracil phosphoribosyltransferase  75 
 
 		 211 aa  296  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.09301  normal  0.0581273 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03330  uracil phosphoribosyltransferase  66.51 
 
 		 212 aa  287  1e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0356  uracil phosphoribosyltransferase  69.81 
 
 		 212 aa  284  5.999999999999999e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.925277 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04490  uracil phosphoribosyltransferase  71.7 
 
 		 212 aa  283  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.14716 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03340  uracil phosphoribosyltransferase  68.25 
 
 		 218 aa  282  2.0000000000000002e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.594912  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0079  uracil phosphoribosyltransferase  64.15 
 
 		 212 aa  268  4e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000379157 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1589  uracil phosphoribosyltransferase  62.44 
 
 		 213 aa  264  5.999999999999999e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0207  uracil phosphoribosyltransferase  66.51 
 
 		 211 aa  260  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1350  uracil phosphoribosyltransferase  56.19 
 
 		 219 aa  221  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.51348 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 		 209 aa  218  7e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 		 209 aa  217  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 		 209 aa  216  1e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05530  uracil phosphoribosyltransferase  54.85 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6429  uracil phosphoribosyltransferase  53.77 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  50.72 
 
 		 209 aa  215  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 		 209 aa  212  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 		 209 aa  212  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  49.29 
 
 		 211 aa  210  1e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 		 209 aa  210  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  50.73 
 
 		 203 aa  210  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 		 209 aa  209  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4386  uracil phosphoribosyltransferase  52.83 
 
 		 207 aa  209  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 		 209 aa  208  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 		 370 aa  208  6e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 		 209 aa  207  8e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  51.67 
 
 		 216 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  48.33 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  48.33 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  48.33 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  48.33 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  48.33 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  48.33 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  48.33 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  48.33 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  48.33 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0829  uracil phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0684126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 		 216 aa  206  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 		 216 aa  206  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 		 209 aa  205  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  50.72 
 
 		 211 aa  204  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1267  uracil phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 		 207 aa  204  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 210 aa  204  7e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1257  uracil phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 		 207 aa  204  7e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0480  uracil phosphoribosyltransferase  48.34 
 
 		 209 aa  204  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000100882 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  49.03 
 
 		 209 aa  204  9e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1240  uracil phosphoribosyltransferase  53.88 
 
 		 205 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0689  uracil phosphoribosyltransferase  50.71 
 
 		 212 aa  202  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  49.27 
 
 		 209 aa  202  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2002  uracil phosphoribosyltransferase  49.51 
 
 		 220 aa  202  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1303  uracil phosphoribosyltransferase  46.86 
 
 		 208 aa  202  3e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0773  uracil phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 		 210 aa  202  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.236088 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13338  uracil phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 		 207 aa  201  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  46.45 
 
 		 211 aa  201  7e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  51.94 
 
 		 210 aa  201  8e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  48.78 
 
 		 209 aa  201  9e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  48.57 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4197  uracil phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 		 211 aa  200  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0551495  normal  0.563023 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1559  uracil phosphoribosyltransferase  48.56 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0188638  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0465  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.309204  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1478  uracil phosphoribosyltransferase  46.38 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  48.06 
 
 		 207 aa  199  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0980  uracil phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 		 209 aa  199  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5922  uracil phosphoribosyltransferase  51.89 
 
 		 207 aa  198  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.152418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1600  uracil phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 		 207 aa  198  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398813  normal  0.0838365 
 
 
-
 
NC_002620  TC0833  uracil phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 		 303 aa  197  9e-50  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00074745  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0208  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0463  uracil phosphoribosyltransferase  47.39 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0206  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1787  uracil phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.823416  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4836  uracil phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3987  uracil phosphoribosyltransferase  51.46 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0371905  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  46.6 
 
 		 209 aa  196  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0240  uracil phosphoribosyltransferase  45.89 
 
 		 208 aa  195  4.0000000000000005e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  46.38 
 
 		 209 aa  194  7e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  49.03 
 
 		 210 aa  194  7e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0546  uracil phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 		 208 aa  194  7e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0666714  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3025  uracil phosphoribosyltransferase  50.49 
 
 		 216 aa  194  8.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0316309 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  46.19 
 
 		 208 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2983  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 210 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19059  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1979  uracil phosphoribosyltransferase  47.39 
 
 		 212 aa  193  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.267185  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1968  uracil phosphoribosyltransferase  48.57 
 
 		 208 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.657111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 		 213 aa  193  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0076  uracil phosphoribosyltransferase  47.57 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1036  uracil phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 		 211 aa  192  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0997591 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4570  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 205 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000263054  normal  0.0155857 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1316  uracil phosphoribosyltransferase  49.05 
 
 		 208 aa  191  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.58002  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0615  uracil phosphoribosyltransferase  45.37 
 
 		 207 aa  191  5e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.587001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>