More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_A0015 on replicon NC_007483
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007483  Noc_A0015  Phage integrase  100 
 
 		 310 aa  641    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.230922  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0687  Phage integrase  91.61 
 
 		 310 aa  593  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.004827  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.68 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.68 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.68 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.68 
 
 		 296 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.68 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.68 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.35 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.35 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.35 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.35 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.68 
 
 		 296 aa  149  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2654  tyrosine recombinase XerD  32.13 
 
 		 306 aa  149  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.71 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.31 
 
 		 308 aa  146  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.88 
 
 		 300 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.31 
 
 		 299 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.15 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.15 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.82 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  36.48 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  34 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.15 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.82 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.15 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.82 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.99 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.49 
 
 		 299 aa  143  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  34.22 
 
 		 295 aa  142  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.15 
 
 		 305 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.16 
 
 		 299 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  32.59 
 
 		 319 aa  142  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.49 
 
 		 299 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.79 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  33 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  30.29 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  32.46 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  33.55 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  31.27 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  34.19 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  30.92 
 
 		 294 aa  139  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  33.22 
 
 		 309 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  32.34 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  34.68 
 
 		 373 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3191  tyrosine recombinase XerD subunit  31.11 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  31.38 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  32.12 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  35.07 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  29.7 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  32.68 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.49 
 
 		 298 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  31.46 
 
 		 296 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  30.82 
 
 		 303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  30.82 
 
 		 303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  28.24 
 
 		 305 aa  135  6.0000000000000005e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.55 
 
 		 298 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  32.45 
 
 		 309 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1313  tyrosine recombinase XerD  30.94 
 
 		 309 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.87 
 
 		 308 aa  135  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.55 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  33.56 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  32.45 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.55 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5117  tyrosine recombinase XerD  31.72 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1488  tyrosine recombinase XerD  33.44 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  32.12 
 
 		 309 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  33.66 
 
 		 343 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  33 
 
 		 298 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  31.54 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0750  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.12 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  32.15 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  32.78 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  30.33 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  32.58 
 
 		 303 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  30.07 
 
 		 295 aa  132  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  29.83 
 
 		 309 aa  132  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  30.07 
 
 		 295 aa  132  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  33.88 
 
 		 343 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  29.84 
 
 		 295 aa  132  9e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1174  tyrosine recombinase XerD  30.99 
 
 		 300 aa  132  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.784052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0319  tyrosine recombinase XerD  34.24 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.944891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0523  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.67 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.67 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  30.69 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.67 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  32.79 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  31.39 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.91 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0840  integrase family protein  28.43 
 
 		 294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.67 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  32.03 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  28.48 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  31.92 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.21 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  31.19 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  31.21 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  28.76 
 
 		 301 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>