More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0707 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0707  response regulator receiver protein  100 
 
 		 216 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0251  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 126 aa  99.8  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1619  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 116 aa  90.9  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0452  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 130 aa  88.2  9e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000249276 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0376  response regulator receiver protein  49.38 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  41.98 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  38.75 
 
 		 119 aa  72  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3532  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.46 
 
 		 370 aa  72  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.998897  normal  0.150916 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0465  response regulator receiver protein  31.73 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000462355 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  38.27 
 
 		 120 aa  71.2  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2331  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 142 aa  70.9  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000425244  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2314  sporulation transcriptional activator Spo0A  30.58 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.453721  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  33.75 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1980  response regulator receiver  33.64 
 
 		 126 aa  67.8  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  40 
 
 		 122 aa  67  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 121 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  38.75 
 
 		 120 aa  67  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 122 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0727  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.77 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.941174  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  37.33 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1197  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0485473 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6788  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.19 
 
 		 343 aa  65.5  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322604  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  35 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.56 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2272  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 382 aa  65.1  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275022  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0656  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.3 
 
 		 346 aa  65.5  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000622897 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2262  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.24 
 
 		 379 aa  65.1  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00869886 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4062  response regulator receiver protein  44.05 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.259152  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0256  sporulation transcriptional activator Spo0A  29.66 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  42.86 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  39.51 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0985  chemotaxis protein-glutamate methylesterase  40.74 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  37.33 
 
 		 119 aa  64.3  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  36.71 
 
 		 120 aa  64.3  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 120 aa  64.7  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1649  response regulator receiver protein  40.51 
 
 		 118 aa  64.3  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.831857  normal  0.0382738 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  40.26 
 
 		 119 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  33.06 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0470  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.67 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0887137  normal  0.635476 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1392  sporulation transcriptional activator Spo0A  31.58 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.664762  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0613  response regulator receiver protein  45.33 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  38 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1342  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.51 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.900228  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  33.75 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  48.98 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  33.75 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1835  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.51 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395601 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  37.66 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  36 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1115  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 225 aa  62  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0541844  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5323  transcriptional regulator two component heavy metal regulatory response ZniR  33.64 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.844748 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 391 aa  62  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  35.8 
 
 		 268 aa  62  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0034  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.77 
 
 		 382 aa  62  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2739  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 451 aa  61.6  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.693002  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  35 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2877  response regulator receiver protein  38.67 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.412079  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1179  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.27 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.564706  normal  0.289977 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3314  response regulator receiver protein  33.78 
 
 		 124 aa  61.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3166  response regulator receiver domain-containing protein  44 
 
 		 136 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0764134 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4208  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.51 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.112955 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1058  response regulator receiver domain-containing protein  36.21 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000718409  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 548 aa  61.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1114  LytTR family two component transcriptional regulator  31.46 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.677936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  37.18 
 
 		 117 aa  60.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0989  chemotaxis-specific methylesterase  37.04 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699013 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2025  chemotaxis-specific methylesterase  40 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1971  chemotaxis-specific methylesterase  37.04 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0811  response regulator receiver protein  37.18 
 
 		 117 aa  61.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1387  chemotaxis-specific methylesterase  38.27 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.925745  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  35.06 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1767  sporulation transcriptional activator Spo0A  39.51 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.943443  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.98 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0248  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.96 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.185703  normal  0.030578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  40.24 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0743  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  43.04 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1909  response regulator receiver protein  42.42 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.631594  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.47 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2865  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2445  response regulator receiver  30.7 
 
 		 125 aa  60.5  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.942791  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  39.33 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0444  response regulator receiver protein  32.85 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 120 aa  60.5  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  33.57 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 118 aa  60.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2668  two component LuxR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3200  two component transcriptional regulator, LytTR family  40.74 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000259787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  30.36 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2688  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.46 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000112566  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.03 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  30.36 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2371  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1034  response regulator receiver domain-containing protein  29.06 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.114962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>