129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3806 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  100 
 
 		 170 aa  344  3e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  68.15 
 
 		 155 aa  208  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6579  transposase IS3/IS911 family protein  43.33 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  0.0213341 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6838  transposase IS3/IS911 family protein  41.33 
 
 		 159 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7466  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0080  putative ISPpu14, transposase Orf1  41.57 
 
 		 174 aa  94  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.195214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2548  putative transposase, ISPpu14 Orf1 like  40.96 
 
 		 160 aa  93.6  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3738  putative transposase  40.96 
 
 		 160 aa  93.6  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0063  putative transposase  41.21 
 
 		 155 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6339  transposase IS3/IS911  41.03 
 
 		 167 aa  91.3  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6377  helix-turn-helix, Fis-type  41.45 
 
 		 146 aa  84.7  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6181  hypothetical protein  38.41 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1729  transposase  36.81 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4917  transposase IS3/IS911 family protein  60 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2291  transposase IS3/IS911 family protein  34.15 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112265  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2523  transposase IS3/IS911 family protein  32.93 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1410  transposase IS3/IS911 family protein  41.11 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3090  transposase IS3/IS911 family protein  41.11 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.234179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  47.95 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  47.95 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  47.95 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  47.95 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  47.95 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  47.95 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  47.95 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  47.95 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  47.95 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  47.95 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7615  transposase IS3/IS911 family protein  33.55 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.557321  normal  0.767348 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  47.95 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  47.95 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  47.95 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  47.95 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  47.95 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  47.95 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0340  transposase IS3/IS911  58.33 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394046  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4532  transposase IS3/IS911 family protein  46.38 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  42.03 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  43.94 
 
 		 113 aa  62  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0570  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0784738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2457  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.528659  normal  0.919358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2918  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2709  transposase IS3/IS911  33.02 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2417a  hypothetical protein  40.48 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2099  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1867  hypothetical protein  40.48 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859913  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  34.62 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  31.13 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  31.13 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  45.59 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59560  putative transposase  42.86 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451913  hitchhiker  4.3260500000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6937  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  40.3 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  41.54 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3966  ISPpu14, transposase Orf1  41.27 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2471  transposase IS3/IS911 family protein  38.96 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3499  ISPpu14, transposase Orf1  38.71 
 
 		 106 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3979  ISPpu14, transposase Orf1  38.71 
 
 		 106 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.061856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4437  ISPpu14, transposase Orf1  38.71 
 
 		 106 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4441  ISPpu14, transposase Orf1  38.71 
 
 		 106 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5398  ISPpu14, transposase Orf1  38.71 
 
 		 106 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180898  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5581  hypothetical protein  39.34 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0039  transposase IS3/IS911 family protein  38.71 
 
 		 106 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.251766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4330  hypothetical protein  36.25 
 
 		 79 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6372  transposase ISRme19  40.58 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092485 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2667  transposase IS3/IS911 family protein  37.68 
 
 		 123 aa  51.6  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2977  transposase IS3/IS911 family protein  37.68 
 
 		 123 aa  51.6  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0835  transposase IS3/IS911 family protein  37.68 
 
 		 123 aa  51.6  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.333335 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1168  transposase IS3/IS911 family protein  37.68 
 
 		 123 aa  51.6  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.375824  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  32.18 
 
 		 135 aa  51.6  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  32.18 
 
 		 135 aa  51.6  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  32.18 
 
 		 135 aa  51.6  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 128 aa  51.6  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5984  transposase IS3/IS911 family protein  53.49 
 
 		 115 aa  51.6  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  34.65 
 
 		 131 aa  51.2  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1192  transposase IS3/IS911 family protein  37.31 
 
 		 112 aa  51.2  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2521  transposase IS3/IS911 family protein  37.31 
 
 		 112 aa  51.2  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0524  hypothetical protein  48.89 
 
 		 331 aa  51.2  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.104385  hitchhiker  0.00639859 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  37.31 
 
 		 112 aa  51.2  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  37.31 
 
 		 112 aa  51.2  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  32.18 
 
 		 135 aa  50.8  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3972  transposase IS3/IS911 family protein  40.96 
 
 		 283 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4842  transposase IS3/IS911 family protein  34.65 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.926413  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2252  transposase IS3/IS911 family protein  33.07 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367013  normal  0.015617 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0424  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 		 136 aa  48.5  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  45.83 
 
 		 125 aa  48.1  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0077  hypothetical protein  35.9 
 
 		 135 aa  47.8  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1101  hypothetical protein  35.9 
 
 		 135 aa  47.8  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0229521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1441  hypothetical protein  35.9 
 
 		 135 aa  47.8  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1445  hypothetical protein  35.9 
 
 		 135 aa  47.8  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1452  hypothetical protein  35.9 
 
 		 135 aa  47.8  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2690  hypothetical protein  35.9 
 
 		 135 aa  47.8  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2737  hypothetical protein  35.9 
 
 		 135 aa  47.8  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0586218  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2889  hypothetical protein  35.9 
 
 		 135 aa  47.8  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3089  hypothetical protein  35.9 
 
 		 135 aa  47.8  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000589591  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3142  hypothetical protein  35.9 
 
 		 135 aa  47.8  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6859  transposase IS3/IS911 family protein  36.9 
 
 		 131 aa  47.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643706  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9620  hypothetical protein  36.96 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.754847  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4721  transposase  38.46 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5995  hypothetical protein  46.03 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>