129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2980 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  100 
 
 		 466 aa  950    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4286  hypothetical protein  53.72 
 
 		 480 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4372  hypothetical protein  53.72 
 
 		 480 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0578425  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5641  hypothetical protein  47.37 
 
 		 465 aa  425  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.617076 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3918  protein of unknown function DUF1214  34.73 
 
 		 512 aa  250  4e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3037  hypothetical protein  34.54 
 
 		 496 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.533722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2579  hypothetical protein  31.26 
 
 		 512 aa  225  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04201  hypothetical protein  31.87 
 
 		 507 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0604  hypothetical protein  32.66 
 
 		 457 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6665  protein of unknown function DUF1214  31.42 
 
 		 512 aa  206  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110382  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02425  hypothetical protein  30.87 
 
 		 518 aa  205  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4999  hypothetical protein  30.17 
 
 		 506 aa  203  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0433305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3030  hypothetical protein  30.28 
 
 		 495 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756301 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0264  hypothetical protein  31.13 
 
 		 538 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.11203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0910  hypothetical protein  32.74 
 
 		 517 aa  190  4e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.190364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0592  hypothetical protein  31.01 
 
 		 511 aa  184  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.930976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3839  protein of unknown function DUF1254  28.57 
 
 		 476 aa  177  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190359  normal  0.11168 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04191  hypothetical protein  29.35 
 
 		 515 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3377  putative lipoprotein  30.35 
 
 		 499 aa  170  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0593  hypothetical protein  29.61 
 
 		 499 aa  170  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5971  hypothetical protein  29.24 
 
 		 491 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.346043 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3284  hypothetical protein  31.51 
 
 		 493 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.133196  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  28.32 
 
 		 473 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  26.12 
 
 		 461 aa  117  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  27.46 
 
 		 465 aa  114  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  25.36 
 
 		 445 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  24.23 
 
 		 467 aa  97.4  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  24.34 
 
 		 476 aa  91.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  27.45 
 
 		 480 aa  91.3  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  27.03 
 
 		 479 aa  89.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  24.88 
 
 		 476 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  25.36 
 
 		 480 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  23.83 
 
 		 445 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  24.51 
 
 		 462 aa  87  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  25.74 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  25.43 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  25.06 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  26.42 
 
 		 435 aa  83.2  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  27.75 
 
 		 477 aa  83.2  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  25 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  27.31 
 
 		 481 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  23.55 
 
 		 478 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  23.55 
 
 		 470 aa  81.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  24.18 
 
 		 488 aa  81.3  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  25.89 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  24.85 
 
 		 798 aa  80.9  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  25.41 
 
 		 482 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  24.56 
 
 		 472 aa  80.5  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  25.4 
 
 		 491 aa  80.1  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  22.86 
 
 		 482 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  24.48 
 
 		 470 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  32.62 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  25.59 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  25.59 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  25.06 
 
 		 487 aa  77.4  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  32.21 
 
 		 452 aa  76.6  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  24.04 
 
 		 490 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  25.24 
 
 		 488 aa  76.6  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  23.97 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  26.55 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  25.57 
 
 		 479 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  25.05 
 
 		 480 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  25.84 
 
 		 512 aa  74.7  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  24.49 
 
 		 437 aa  72.4  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  34.06 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  34.06 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  34.06 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  22.84 
 
 		 482 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  33.64 
 
 		 485 aa  70.1  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  23.4 
 
 		 469 aa  69.7  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  30.81 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  24.05 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  26.14 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  35.21 
 
 		 493 aa  67.8  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  23.83 
 
 		 482 aa  67.8  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  23.39 
 
 		 473 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  31.88 
 
 		 478 aa  67  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  23.18 
 
 		 432 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  25.62 
 
 		 470 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  23.18 
 
 		 473 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  31.16 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1209  hypothetical protein  22.9 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.376745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  31.16 
 
 		 479 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  23.35 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  31.93 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  23.35 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  32.77 
 
 		 465 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  27.14 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  22.96 
 
 		 473 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  32.48 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  30.4 
 
 		 200 aa  63.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  22.96 
 
 		 473 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  22.96 
 
 		 473 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  22.96 
 
 		 473 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  25.44 
 
 		 475 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  25.31 
 
 		 488 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  24.26 
 
 		 490 aa  63.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  31.39 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  31.67 
 
 		 492 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  21.67 
 
 		 473 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>