More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2810 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2810  inner-membrane translocator  100 
 
 		 291 aa  556  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144743  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1753  inner-membrane translocator  58.8 
 
 		 291 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3674  putative urea/short-chain amide transport system permease protein  52.46 
 
 		 291 aa  276  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.473884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  46.48 
 
 		 290 aa  238  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  45.71 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  45.71 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0548  inner-membrane translocator  46.79 
 
 		 296 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 299 aa  219  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2024  inner-membrane translocator  45.74 
 
 		 296 aa  215  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3557  inner-membrane translocator  46.07 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  40.71 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  39.39 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  43.82 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  40.36 
 
 		 290 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  41.39 
 
 		 306 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  38.21 
 
 		 308 aa  188  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  40 
 
 		 285 aa  185  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  39.29 
 
 		 285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 287 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  37.32 
 
 		 287 aa  183  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  39.36 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  39.15 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  40.83 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  42.35 
 
 		 297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  38.01 
 
 		 293 aa  178  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 286 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  40.64 
 
 		 286 aa  178  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  38.6 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  39.37 
 
 		 315 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  36.03 
 
 		 305 aa  175  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  38.36 
 
 		 293 aa  175  7e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  42.14 
 
 		 286 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  39.3 
 
 		 290 aa  172  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  42.14 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  37.94 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  42.14 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  38.43 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3642  inner-membrane translocator  38.74 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  36.09 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3912  inner-membrane translocator  38.16 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 286 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3341  transmembrane ABC transporter protein  38.16 
 
 		 313 aa  169  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0020  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.52 
 
 		 294 aa  169  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4819  putative ABC transporter, permease protein  36.73 
 
 		 336 aa  168  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3046  inner-membrane translocator  37.81 
 
 		 294 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0053  inner-membrane translocator  39.15 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6024  inner-membrane translocator  40.36 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0086  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 294 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  37.8 
 
 		 306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  36.64 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0088  inner-membrane translocator  38.16 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0104  inner-membrane translocator  37.1 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  39.15 
 
 		 286 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2969  inner-membrane translocator  37.1 
 
 		 320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968698  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  36.2 
 
 		 652 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 628 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0077  inner-membrane translocator  38.16 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981824  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0086  inner-membrane translocator  37.1 
 
 		 320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.285698  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2565  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  41.43 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3426  inner-membrane translocator  41.84 
 
 		 300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3268  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.1 
 
 		 294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3088  inner-membrane translocator  37.19 
 
 		 288 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0176  inner-membrane translocator  36.51 
 
 		 306 aa  162  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6573  inner-membrane translocator  41.43 
 
 		 286 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0445304  hitchhiker  0.00930416 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8565  inner-membrane translocator  40.57 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0330607  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  33 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  40.15 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3374  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1606  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2937  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 		 287 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3989  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0197  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4063  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3536  inner-membrane translocator  37.1 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0293486 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2996  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3210  inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1382  inner-membrane translocator  36.64 
 
 		 343 aa  159  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0563263 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 288 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3757  putative branched-chain amino acid transport permease  34.93 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3328  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 		 294 aa  159  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1051  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 289 aa  158  8e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3459  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 289 aa  158  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.411869  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5096  inner-membrane translocator  36.79 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681438  normal  0.989251 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0429  inner-membrane translocator  38.43 
 
 		 293 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.220728 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0897  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0956  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  37.99 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0499  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.27 
 
 		 286 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 305 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4907  inner-membrane translocator  40 
 
 		 285 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3830  inner-membrane translocator  40 
 
 		 285 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.84807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6574  inner-membrane translocator  41.43 
 
 		 286 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0310358  normal  0.0403201 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 288 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2459  inner-membrane translocator  35.88 
 
 		 308 aa  155  9e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3368  inner-membrane translocator  38.16 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3829  inner-membrane translocator  36.31 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.956576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>