More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4509 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  100 
 
 		 438 aa  858    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  63.21 
 
 		 430 aa  521  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  46.04 
 
 		 439 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  46.93 
 
 		 445 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  47.97 
 
 		 440 aa  368  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4279  major facilitator transporter  49.27 
 
 		 435 aa  364  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0810486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 439 aa  363  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  45.8 
 
 		 439 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 439 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 439 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 439 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  45.91 
 
 		 439 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  46.39 
 
 		 431 aa  361  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  43.16 
 
 		 450 aa  353  5e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  45.83 
 
 		 437 aa  352  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  42.41 
 
 		 437 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  44.12 
 
 		 434 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  45.86 
 
 		 446 aa  345  7e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  45.28 
 
 		 439 aa  345  1e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  41.8 
 
 		 436 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.5 
 
 		 437 aa  343  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  44.92 
 
 		 441 aa  342  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  44.08 
 
 		 439 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  44.12 
 
 		 441 aa  338  8e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  44.75 
 
 		 447 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  44.68 
 
 		 461 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  44.07 
 
 		 427 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5243  major facilitator transporter  46.19 
 
 		 439 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4875  major facilitator transporter  46.19 
 
 		 439 aa  333  4e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4964  major facilitator superfamily transporter  46.19 
 
 		 439 aa  333  4e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  41.39 
 
 		 436 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  41.19 
 
 		 437 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  41.15 
 
 		 436 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  41.63 
 
 		 436 aa  331  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  41.15 
 
 		 436 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 439 aa  331  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 436 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 436 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  43.39 
 
 		 432 aa  330  4e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  40.63 
 
 		 433 aa  329  7e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  44.29 
 
 		 442 aa  328  8e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  47.04 
 
 		 452 aa  328  8e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  40.52 
 
 		 444 aa  328  9e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  45.6 
 
 		 432 aa  328  9e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  45.6 
 
 		 432 aa  328  9e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  42.24 
 
 		 455 aa  328  9e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  45.6 
 
 		 432 aa  328  9e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  40.98 
 
 		 444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  40.98 
 
 		 444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  41.97 
 
 		 437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  40.98 
 
 		 444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  40.98 
 
 		 444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  40.98 
 
 		 444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  40.67 
 
 		 436 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1438  major facilitator superfamily MFS_1  42.57 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  46.1 
 
 		 460 aa  323  5e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6220  major facilitator transporter  43.49 
 
 		 434 aa  323  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  44.03 
 
 		 437 aa  322  7e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  44.7 
 
 		 460 aa  322  7e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  45.82 
 
 		 438 aa  322  7e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4212  major facilitator superfamily MFS_1  45.58 
 
 		 458 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  41.4 
 
 		 433 aa  320  3e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  43.92 
 
 		 445 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  42.96 
 
 		 438 aa  319  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  43.92 
 
 		 445 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  42.19 
 
 		 439 aa  319  6e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  43.67 
 
 		 445 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  40.74 
 
 		 458 aa  319  7e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_003296  RS02317  transporter transmembrane protein  43.61 
 
 		 409 aa  318  9e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.14358 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  41.44 
 
 		 459 aa  318  9e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  40.57 
 
 		 468 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  41.93 
 
 		 450 aa  317  3e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1753  major facilitator family transporter  41.39 
 
 		 443 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1534  major facilitator family transporter  41.39 
 
 		 443 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2262  major facilitator family transporter  41.39 
 
 		 443 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445444  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3057  major facilitator family transporter  41.39 
 
 		 443 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.758675  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2779  major facilitator family transporter  41.39 
 
 		 443 aa  316  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  41.96 
 
 		 439 aa  316  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  40.52 
 
 		 435 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  40.52 
 
 		 435 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  43.17 
 
 		 461 aa  316  7e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  40.52 
 
 		 435 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 460 aa  315  8e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 450 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  42.01 
 
 		 430 aa  315  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1782  major facilitator superfamily MFS_1  42.12 
 
 		 457 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  39.45 
 
 		 465 aa  315  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0365  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 441 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.77 
 
 		 438 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2645  major facilitator superfamily permease  41.15 
 
 		 443 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142533  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 459 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0241  major facilitator family transporter  40.24 
 
 		 524 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5174  major facilitator transporter  40.85 
 
 		 441 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  40.59 
 
 		 446 aa  313  4.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3435  major facilitator transporter  39.82 
 
 		 446 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0701144  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  41.55 
 
 		 456 aa  312  7.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4378  major facilitator superfamily MFS_1  43.29 
 
 		 436 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.940021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  42.43 
 
 		 460 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2701  major facilitator family transporter  40.91 
 
 		 443 aa  312  9e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>