More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3279 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3279  PfkB domain protein  100 
 
 		 321 aa  615  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1005  PfkB domain protein  65.91 
 
 		 320 aa  360  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10782 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07150  sugar kinase, ribokinase  57.14 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.218801  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  31.68 
 
 		 313 aa  129  9.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  35.62 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  36.79 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  36.1 
 
 		 316 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  36.33 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  36.33 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  36.09 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  36.36 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  34.98 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  35.83 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  35.35 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  30.93 
 
 		 317 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  34.19 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  34.19 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.55 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  34.32 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  34.43 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  35.33 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  35.02 
 
 		 308 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  34.2 
 
 		 314 aa  96.7  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  37.58 
 
 		 308 aa  95.9  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  32.55 
 
 		 312 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  29.23 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  32.98 
 
 		 340 aa  94.4  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  32.6 
 
 		 327 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  26.1 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  26.1 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  26.1 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  25.4 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  30.88 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  33.77 
 
 		 329 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  32.35 
 
 		 345 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  32.37 
 
 		 322 aa  90.1  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  33.77 
 
 		 329 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.25 
 
 		 329 aa  90.1  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.29 
 
 		 296 aa  90.1  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  29.35 
 
 		 317 aa  89.7  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  26.25 
 
 		 313 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  33.77 
 
 		 329 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  25.62 
 
 		 322 aa  89.7  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2840  PfkB domain protein  33.71 
 
 		 306 aa  89  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  33.77 
 
 		 320 aa  89  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  32.9 
 
 		 311 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  33.44 
 
 		 329 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  25 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  31.63 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  31.43 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  27.48 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  29 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  26.6 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  31.15 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  31.07 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  37.67 
 
 		 308 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 312 aa  86.3  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  31.43 
 
 		 327 aa  86.3  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  32.26 
 
 		 316 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  37.67 
 
 		 308 aa  85.9  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  37.67 
 
 		 308 aa  85.9  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  32.97 
 
 		 329 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2321  ribokinase-like domain-containing protein  33.45 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  32.97 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06349  hypothetical protein  26.69 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0700  ribokinase-like domain-containing protein  33.22 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.503063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  31.21 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  25.93 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1317  carbohydrate kinase  37.33 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1806  carbohydrate kinase  37.33 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.26213  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  27.67 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  37.33 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  28.83 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1077  carbohydrate kinase  37.33 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  33.76 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  33.76 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3657  PfkB  27.81 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  29.87 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  32.58 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  32.79 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2574  2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.16 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.751635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0388  PfkB domain protein  24.58 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  30.42 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  31.21 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  26.2 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  31.97 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  29.97 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  29.97 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  32.86 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  26.54 
 
 		 645 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.31 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413281  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  28.87 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  26.43 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  32.42 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  31.25 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  31.6 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  33.57 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  30.61 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2513  ribokinase-like domain-containing protein  31.27 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  31.71 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>