More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2151 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 253 aa  507  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  53.17 
 
 		 253 aa  272  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  56.05 
 
 		 251 aa  265  7e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 252 aa  262  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  52.82 
 
 		 252 aa  257  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  52.96 
 
 		 253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  57.94 
 
 		 254 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  49.4 
 
 		 258 aa  235  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  50.81 
 
 		 259 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  49.59 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  46.37 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 257 aa  205  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  43.68 
 
 		 270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  41.3 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  44 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  34.16 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  37.96 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 258 aa  149  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  35.32 
 
 		 243 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  35.27 
 
 		 243 aa  149  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  38.27 
 
 		 272 aa  149  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  35.27 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  34.92 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  35.27 
 
 		 243 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  34.88 
 
 		 243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  34.88 
 
 		 243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  34.92 
 
 		 243 aa  145  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  34.11 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  34.15 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  39 
 
 		 252 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  36.05 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  34.76 
 
 		 244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  32.26 
 
 		 254 aa  125  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  30.24 
 
 		 254 aa  122  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 238 aa  122  5e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  32.93 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  36.47 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 377 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  29.03 
 
 		 254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  31.33 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  51.24 
 
 		 429 aa  112  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  30.47 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  34.15 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  30.85 
 
 		 250 aa  99.4  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  32.18 
 
 		 249 aa  99  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  29.88 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 253 aa  90.1  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1629  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  33.33 
 
 		 148 aa  89.4  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651813  normal  0.0608845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6769  transcriptional regulator, MerR family  37.6 
 
 		 254 aa  89  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.220453  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  32.93 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5021  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5003  transcriptional regulator, MerR family  25.2 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  27.34 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  48.45 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  29.49 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  27.86 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  36.89 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  33.07 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  38.38 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2414  MerR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2462  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  26.62 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  29.92 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  35.92 
 
 		 315 aa  75.1  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  38.38 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2840  MerR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  47.76 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  39.36 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  39.36 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  23.31 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1664  MerR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 342 aa  72  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  36.54 
 
 		 252 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  41.94 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 157 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  37.61 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>