154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1048 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1048  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 477 aa  904    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137816  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4929  major facilitator superfamily MFS_1  59.75 
 
 		 395 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127537  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0291  major facilitator superfamily MFS_1  48.83 
 
 		 411 aa  283  4.0000000000000003e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1826  major facilitator superfamily MFS_1  40.45 
 
 		 415 aa  249  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1426  major facilitator superfamily MFS_1  40.35 
 
 		 415 aa  249  6e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3208  major facilitator transporter  42.64 
 
 		 415 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4972  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 425 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.702579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1618  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 412 aa  186  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2309  major facilitator transporter  36.15 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.559549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4586  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 426 aa  178  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101779  decreased coverage  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2602  major facilitator superfamily MFS_1  38.01 
 
 		 422 aa  169  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4237  major facilitator superfamily MFS_1  37.92 
 
 		 422 aa  168  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4559  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 421 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1445  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 419 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1463  major facilitator superfamily transporter  34.1 
 
 		 419 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0911464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5855  major facilitator superfamily transporter  34.97 
 
 		 420 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4715  major facilitator superfamily MFS_1  35.91 
 
 		 413 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4198  major facilitator transporter  36 
 
 		 418 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4264  major facilitator superfamily transporter  36 
 
 		 418 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4425  major facilitator transporter  36 
 
 		 418 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.226942  normal  0.426578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0900  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 420 aa  156  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10866  integral membrane transport protein  34.86 
 
 		 419 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.25313  hitchhiker  0.00190628 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1234  multidrug resistance protein MdtH  30.56 
 
 		 402 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1263  multidrug resistance protein MdtH  30.56 
 
 		 402 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1278  multidrug resistance protein MdtH  30.56 
 
 		 402 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.742422 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2022  multidrug resistance protein MdtH  30.56 
 
 		 402 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2206  multidrug resistance protein MdtH  30.56 
 
 		 402 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.151391 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1579  multidrug resistance protein MdtH  31.27 
 
 		 402 aa  138  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01061  predicted drug efflux system  30.29 
 
 		 402 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2581  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 402 aa  137  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01069  hypothetical protein  30.29 
 
 		 402 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1188  multidrug resistance protein MdtH  30.29 
 
 		 402 aa  137  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2064  multidrug resistance protein MdtH  30.29 
 
 		 402 aa  137  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182289 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2261  multidrug resistance protein MdtH  30.29 
 
 		 402 aa  137  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1444  multidrug resistance protein MdtH  30.29 
 
 		 402 aa  137  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723421  hitchhiker  0.006681 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  30.19 
 
 		 401 aa  136  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1188  multidrug resistance protein MdtH  30.29 
 
 		 402 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.812353  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2535  multidrug resistance protein MdtH  30.29 
 
 		 402 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  normal  0.203452 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2050  multidrug resistance protein MdtH  29.97 
 
 		 401 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2796  multidrug resistance protein MdtH  30.54 
 
 		 401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2443  multidrug resistance protein MdtH  29.97 
 
 		 401 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.313716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2162  multidrug resistance protein MdtH  29.97 
 
 		 401 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.976846  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1802  multidrug resistance protein MdtH  29.91 
 
 		 401 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2079  multidrug resistance protein MdtH  30.21 
 
 		 401 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0994516  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2276  multidrug resistance protein MdtH  31.64 
 
 		 398 aa  120  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0239  multidrug resistance protein MdtH  27.88 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  33.14 
 
 		 406 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 414 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 408 aa  106  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4228  hypothetical protein  31.3 
 
 		 443 aa  97.8  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.06951 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2132  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  25.91 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  25.1 
 
 		 393 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  25.93 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  25.91 
 
 		 393 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  25.91 
 
 		 393 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  25.93 
 
 		 398 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  25.1 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  25.51 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  23.93 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  24.58 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5044  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  29.75 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 419 aa  57  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 426 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 469 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 408 aa  54.3  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0485  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 485 aa  54.3  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.165691  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.56 
 
 		 504 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 476 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 476 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  34.93 
 
 		 476 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  22.1 
 
 		 423 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  22.1 
 
 		 423 aa  52.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  22.1 
 
 		 423 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  22.1 
 
 		 423 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 424 aa  52.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 403 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  21.43 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.69 
 
 		 461 aa  51.2  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  22.38 
 
 		 424 aa  51.2  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  23.26 
 
 		 424 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  22.1 
 
 		 423 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  23.45 
 
 		 423 aa  50.1  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.72 
 
 		 444 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  21.65 
 
 		 423 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0277  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 594 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491572  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1452  hypothetical protein  25.53 
 
 		 604 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 439 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4365  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  25.19 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.19 
 
 		 429 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175256  normal  0.467375 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 		 455 aa  49.3  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  22.1 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  24.04 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  22.87 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 483 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>