78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5130 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5130    100 
 
 		 2379 bp  4716    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  88.73 
 
 		 2277 bp  77.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2658  MMPL domain protein  91.53 
 
 		 2526 bp  77.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  89.83 
 
 		 2157 bp  69.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  93.62 
 
 		 2136 bp  69.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  90.74 
 
 		 2202 bp  67.9  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  87.14 
 
 		 2529 bp  67.9  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  83.17 
 
 		 2199 bp  65.9  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  89.47 
 
 		 2253 bp  65.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  97.3 
 
 		 4149 bp  65.9  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  86.11 
 
 		 2148 bp  63.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1244    89.09 
 
 		 2171 bp  61.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  89.09 
 
 		 2268 bp  61.9  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  88.14 
 
 		 2283 bp  61.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  91.49 
 
 		 2223 bp  61.9  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  88.89 
 
 		 2196 bp  60  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  86.36 
 
 		 2154 bp  60  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  97.06 
 
 		 2250 bp  60  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0204  MMPL domain protein  81.82 
 
 		 2331 bp  60  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  90 
 
 		 2286 bp  60  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  91.11 
 
 		 2541 bp  58  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  88.68 
 
 		 2259 bp  58  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  100 
 
 		 3009 bp  58  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  86.15 
 
 		 2391 bp  58  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  82.18 
 
 		 2631 bp  58  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  92.68 
 
 		 2217 bp  58  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  86.89 
 
 		 2763 bp  58  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  92.5 
 
 		 3288 bp  56  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  90.91 
 
 		 2223 bp  56  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  88.46 
 
 		 2247 bp  56  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  94.44 
 
 		 2304 bp  56  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  88.46 
 
 		 2265 bp  56  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  94.44 
 
 		 2232 bp  56  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  94.44 
 
 		 2304 bp  56  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  92.5 
 
 		 2208 bp  56  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  94.44 
 
 		 2304 bp  56  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2369    88.46 
 
 		 3548 bp  56  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182688  normal  0.675739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  87.27 
 
 		 2205 bp  54  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  94.29 
 
 		 2187 bp  54  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2350  triosephosphate isomerase  89.36 
 
 		 753 bp  54  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  92.31 
 
 		 2256 bp  54  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  89.36 
 
 		 2145 bp  54  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4184  hypothetical protein  100 
 
 		 1071 bp  54  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  96.67 
 
 		 2100 bp  52  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  90.48 
 
 		 2952 bp  52  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  88 
 
 		 2301 bp  52  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  92.11 
 
 		 2154 bp  52  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  90.48 
 
 		 2952 bp  52  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  88 
 
 		 2337 bp  52  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  90.48 
 
 		 2181 bp  52  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  87.04 
 
 		 2205 bp  52  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  90.48 
 
 		 2940 bp  52  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  85.48 
 
 		 2229 bp  52  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  90.48 
 
 		 2181 bp  52  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0502  TrkA-C domain protein  96.55 
 
 		 1863 bp  50.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  87.76 
 
 		 2418 bp  50.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  96.55 
 
 		 2754 bp  50.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  85.25 
 
 		 2232 bp  50.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0586    100 
 
 		 2171 bp  50.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.022528 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2276  putative signal peptide protein  100 
 
 		 2847 bp  50.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806007  normal  0.316994 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2404  hypothetical protein  93.94 
 
 		 654 bp  50.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267711  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1523  hypothetical protein  93.94 
 
 		 654 bp  50.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171341  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2548  hypothetical protein  93.94 
 
 		 1644 bp  50.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.480417  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  91.89 
 
 		 2310 bp  50.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  86.79 
 
 		 2277 bp  50.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  91.89 
 
 		 2310 bp  50.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  96.55 
 
 		 2907 bp  50.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2023  hypothetical protein  93.94 
 
 		 654 bp  50.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.425891  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3288  hypothetical protein  93.94 
 
 		 654 bp  50.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0072457  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  91.89 
 
 		 2256 bp  50.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2456  hypothetical protein  93.94 
 
 		 654 bp  50.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351573  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  91.89 
 
 		 2256 bp  50.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1294  hypothetical protein  93.94 
 
 		 654 bp  50.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  93.94 
 
 		 2232 bp  50.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  96.55 
 
 		 2205 bp  50.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  96.55 
 
 		 2382 bp  50.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  96.55 
 
 		 2340 bp  50.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7301  MmpL domain-containing protein  87.76 
 
 		 2115 bp  50.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.573175  normal  0.0728725 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>