More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4799 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4799  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 233 aa  450  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0092  GntR family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0178  transcriptional regulator, GntR family  52.94 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2173  hypothetical protein  45.37 
 
 		 222 aa  151  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421026  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3560  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2681  transcriptional regulator, GntR family  46.6 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5735  GntR family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419462 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2447  GntR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 222 aa  148  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0874  GntR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 226 aa  148  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3515  GntR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 226 aa  148  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal  0.6161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6997  transcriptional regulator, GntR family  43.11 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  43.15 
 
 		 232 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0048  GntR family transcriptional regulator  48.86 
 
 		 194 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0495  transcriptional regulator GntR  41.71 
 
 		 249 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5027  transcriptional regulator, GntR family  40.28 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0318  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 218 aa  128  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5376  transcriptional regulator, GntR family  41.04 
 
 		 221 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0423654  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6353  transcriptional regulator, GntR family  40.69 
 
 		 232 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5853  transcriptional regulator GntR family  42 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110749  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4225  transcriptional regulator, GntR family  43.35 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625874  normal  0.700845 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3518  transcriptional regulator, GntR family  43.23 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2798  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3314  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19230  transcriptional regulator  36.6 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  37.57 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0537  transcriptional regulator, GntR family  41.62 
 
 		 245 aa  97.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0745569  normal  0.0258493 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4086  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  95.1  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00430  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 227 aa  95.1  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4450  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3986  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.126753 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  31.46 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  32.09 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6333  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1313  regulatory protein GntR, HTH  33.99 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.568761  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0665  transcriptional regulator, GntR family  31.5 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3443  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0659534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4119  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 258 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3147  transcriptional regulator, GntR family  28 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3474  transcriptional regulator, GntR family  28 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  30.15 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  30.41 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5667  transcriptional regulator, GntR family  32.11 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2643  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.577807 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  29.19 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 229 aa  72  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 222 aa  72  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 222 aa  72  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  32.28 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  37.41 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  32.38 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3933  GntR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.903638  decreased coverage  0.00636181 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2481  GntR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0899  transcriptional regulator, GntR family  28.27 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1881  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2775  GntR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  36.13 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2514  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00436634  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0982  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2921  transcriptional regulator, GntR family  32.53 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0576  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3548  transcriptional regulator  31.47 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  35.33 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0680  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231512  normal  0.107075 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3717  transcriptional regulator  31.47 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  0.297823 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0334  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.389251  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3549  transcriptional regulator  31.47 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>