More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3351 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3351  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 444 aa  883    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0813627  normal  0.0585989 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3956  major facilitator transporter  69.79 
 
 		 445 aa  614  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00119872  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0408  major facilitator superfamily MFS_1  69.79 
 
 		 464 aa  603  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  45.89 
 
 		 461 aa  350  4e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  42.33 
 
 		 450 aa  325  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  45.97 
 
 		 430 aa  317  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  44.12 
 
 		 446 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  39.77 
 
 		 468 aa  303  6.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  44.47 
 
 		 437 aa  301  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  42.53 
 
 		 441 aa  301  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  42.43 
 
 		 447 aa  298  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  41.02 
 
 		 430 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  40.14 
 
 		 461 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  44.02 
 
 		 440 aa  294  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  44.09 
 
 		 439 aa  289  7e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  42.86 
 
 		 446 aa  288  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  44.3 
 
 		 432 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  44.3 
 
 		 432 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  44.3 
 
 		 432 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  43.26 
 
 		 439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  40.56 
 
 		 442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  39.85 
 
 		 437 aa  282  9e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  41.05 
 
 		 439 aa  282  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  40.26 
 
 		 439 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 442 aa  280  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.1 
 
 		 437 aa  280  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  40.26 
 
 		 439 aa  280  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  40.26 
 
 		 439 aa  279  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  40.26 
 
 		 439 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  40.26 
 
 		 439 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  40.26 
 
 		 439 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  38.37 
 
 		 438 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  37.12 
 
 		 482 aa  277  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  43.2 
 
 		 450 aa  276  5e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  39.57 
 
 		 465 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 445 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.74 
 
 		 438 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  40.36 
 
 		 437 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 442 aa  272  9e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  40.52 
 
 		 439 aa  272  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  38.97 
 
 		 433 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  40.72 
 
 		 437 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  40 
 
 		 463 aa  270  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  39.07 
 
 		 452 aa  270  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  38.97 
 
 		 433 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  40.25 
 
 		 433 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  41.28 
 
 		 433 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  40 
 
 		 433 aa  269  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  36.83 
 
 		 435 aa  269  8e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  38.34 
 
 		 439 aa  269  8e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  42.02 
 
 		 452 aa  269  8.999999999999999e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  38.34 
 
 		 439 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  40.24 
 
 		 433 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  39.52 
 
 		 445 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 433 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  39.52 
 
 		 445 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  38.34 
 
 		 439 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  38.14 
 
 		 452 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  36.96 
 
 		 441 aa  268  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 458 aa  266  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  39.32 
 
 		 445 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  39.34 
 
 		 430 aa  266  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  40.81 
 
 		 432 aa  266  5.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  38.97 
 
 		 445 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  39.75 
 
 		 433 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  40.14 
 
 		 435 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  41.34 
 
 		 435 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  39.37 
 
 		 460 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  39.86 
 
 		 435 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  39.42 
 
 		 435 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  39.86 
 
 		 435 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  39.42 
 
 		 435 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 435 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 435 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 458 aa  264  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  39.42 
 
 		 434 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 435 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  36.48 
 
 		 456 aa  263  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  40.46 
 
 		 435 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  39.13 
 
 		 460 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 444 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 457 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  40.16 
 
 		 445 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  36.66 
 
 		 436 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 457 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  40.19 
 
 		 442 aa  261  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 457 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  38.57 
 
 		 438 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  41.12 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4783  major facilitator superfamily MFS_1  36.55 
 
 		 474 aa  260  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  40.15 
 
 		 431 aa  260  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  39.95 
 
 		 439 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  38.73 
 
 		 460 aa  259  6e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  40.54 
 
 		 437 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  36.47 
 
 		 459 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2262  major facilitator family transporter  38.43 
 
 		 443 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445444  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1753  major facilitator family transporter  38.43 
 
 		 443 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1534  major facilitator family transporter  38.43 
 
 		 443 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3057  major facilitator family transporter  38.43 
 
 		 443 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.758675  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  40.18 
 
 		 438 aa  257  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>