More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1713 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  100 
 
 		 867 aa  1669    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  54.05 
 
 		 873 aa  807    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  54.26 
 
 		 907 aa  835    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  49.28 
 
 		 906 aa  717    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  53.75 
 
 		 950 aa  821    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  50.97 
 
 		 971 aa  631  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  48.51 
 
 		 826 aa  626  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  46.23 
 
 		 821 aa  572  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  35.33 
 
 		 891 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32.05 
 
 		 887 aa  444  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  32.89 
 
 		 868 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  32.89 
 
 		 868 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  32.6 
 
 		 868 aa  430  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  40.51 
 
 		 886 aa  431  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  39.86 
 
 		 842 aa  429  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  32.15 
 
 		 869 aa  424  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  31.57 
 
 		 868 aa  422  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  32.13 
 
 		 869 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  32.31 
 
 		 868 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  32.12 
 
 		 868 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  32.49 
 
 		 890 aa  415  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  31.98 
 
 		 868 aa  413  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  31.93 
 
 		 868 aa  415  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  37.51 
 
 		 865 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  33 
 
 		 871 aa  396  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  32.09 
 
 		 874 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  34.83 
 
 		 870 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  37.6 
 
 		 903 aa  385  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  32.71 
 
 		 866 aa  383  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  34.62 
 
 		 837 aa  364  5.0000000000000005e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.8 
 
 		 891 aa  318  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0704  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  31.38 
 
 		 797 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  31.93 
 
 		 791 aa  243  9e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  49.69 
 
 		 840 aa  241  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  50.79 
 
 		 835 aa  240  8e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  40.94 
 
 		 782 aa  234  6e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  42.82 
 
 		 869 aa  232  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  38.41 
 
 		 887 aa  233  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  45.98 
 
 		 892 aa  231  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1949  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  24.81 
 
 		 868 aa  231  6e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  45.13 
 
 		 902 aa  226  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  40.13 
 
 		 781 aa  223  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  38.59 
 
 		 825 aa  211  3e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  39.63 
 
 		 824 aa  212  3e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  41.75 
 
 		 302 aa  211  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  47.4 
 
 		 760 aa  210  9e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  40.62 
 
 		 769 aa  209  2e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  41.21 
 
 		 762 aa  207  9e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2101  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  42.02 
 
 		 382 aa  206  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  42.49 
 
 		 364 aa  206  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  38.56 
 
 		 754 aa  206  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  38.19 
 
 		 758 aa  205  4e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  38.98 
 
 		 852 aa  204  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  42.95 
 
 		 788 aa  204  5e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  34.64 
 
 		 764 aa  204  7e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  38.02 
 
 		 758 aa  201  6e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  41.44 
 
 		 805 aa  200  9e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  41.9 
 
 		 799 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  44.81 
 
 		 810 aa  199  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  37.66 
 
 		 761 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  33.85 
 
 		 794 aa  198  3e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.28 
 
 		 971 aa  198  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  38.85 
 
 		 761 aa  198  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  42.54 
 
 		 760 aa  198  4.0000000000000005e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.4 
 
 		 971 aa  198  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  39.55 
 
 		 758 aa  197  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  37.86 
 
 		 758 aa  197  7e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  42.04 
 
 		 780 aa  196  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  40.58 
 
 		 785 aa  195  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  35.76 
 
 		 779 aa  195  3e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  40.89 
 
 		 785 aa  194  6e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  40.06 
 
 		 803 aa  194  7e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  40.88 
 
 		 810 aa  194  7e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  39.35 
 
 		 359 aa  194  9e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  41.61 
 
 		 786 aa  193  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  39.68 
 
 		 762 aa  191  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  38.58 
 
 		 798 aa  191  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  36.17 
 
 		 758 aa  189  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  41.23 
 
 		 809 aa  188  3e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1185  pyruvate, water dikinase  43.9 
 
 		 275 aa  188  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  38.36 
 
 		 809 aa  189  3e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0803  phosphoenolpyruvate synthase  40.68 
 
 		 805 aa  188  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2043  PEP-utilising protein mobile region  29.95 
 
 		 725 aa  188  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.80006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  37.14 
 
 		 758 aa  187  8e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  36.28 
 
 		 757 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  39.27 
 
 		 789 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  36.51 
 
 		 758 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2757  phosphoenolpyruvate synthase  40.29 
 
 		 825 aa  185  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3417  phosphoenolpyruvate synthase  40.25 
 
 		 798 aa  184  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0963728  normal  0.277431 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  36.68 
 
 		 812 aa  184  7e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3406  phosphoenolpyruvate synthase  40.25 
 
 		 798 aa  184  7e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568849  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3469  phosphoenolpyruvate synthase  40.25 
 
 		 798 aa  184  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  37.78 
 
 		 805 aa  184  7e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  41.48 
 
 		 366 aa  184  8.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3841  phosphoenolpyruvate synthase  39.58 
 
 		 819 aa  183  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4569  phosphoenolpyruvate synthase  37.54 
 
 		 821 aa  182  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4209  phosphoenolpyruvate synthase  37.17 
 
 		 825 aa  182  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.390448 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2412  phosphoenolpyruvate-utilizing enzyme mobile domain protein  29.86 
 
 		 708 aa  182  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4390  phosphoenolpyruvate synthase  38.87 
 
 		 799 aa  181  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4522  phosphoenolpyruvate synthase  38.87 
 
 		 799 aa  181  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.31692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>