More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1191 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1191  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 400 aa  805    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  42.65 
 
 		 397 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  38.87 
 
 		 423 aa  231  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  36.39 
 
 		 369 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  36.39 
 
 		 369 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  36.39 
 
 		 369 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  37.32 
 
 		 362 aa  229  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  38.52 
 
 		 390 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6555  alpha/beta hydrolase fold protein  39.08 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381661  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  36.9 
 
 		 362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4266  alpha/beta hydrolase fold protein  38.53 
 
 		 364 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  35.32 
 
 		 373 aa  206  6e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04600  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.44 
 
 		 330 aa  206  8e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.374511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  39.63 
 
 		 421 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  38.27 
 
 		 350 aa  202  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.38332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0901  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 		 360 aa  192  8e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  32.87 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 336 aa  179  9e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0879  alpha/beta hydrolase fold protein  37.22 
 
 		 349 aa  175  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  34.95 
 
 		 364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1497  alpha/beta hydrolase fold protein  34.39 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  34.66 
 
 		 344 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  35.31 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4246  alpha/beta hydrolase fold  34.28 
 
 		 364 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  hitchhiker  0.00549727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0991  alpha/beta hydrolase fold protein  32.21 
 
 		 389 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  hitchhiker  0.00638838 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  34.35 
 
 		 348 aa  152  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  33.75 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  33.12 
 
 		 306 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6786  alpha/beta hydrolase fold  41.9 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.41 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  28.49 
 
 		 318 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  28.49 
 
 		 318 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  28.49 
 
 		 318 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5476  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 333 aa  106  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294136  normal  0.797092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1865  alpha/beta hydrolase fold  30.09 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0853648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 347 aa  100  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  31.64 
 
 		 312 aa  99.8  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4502  alpha/beta hydrolase fold  26.7 
 
 		 353 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  29.85 
 
 		 352 aa  94  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13192  non-heme haloperoxidase hpx  26.57 
 
 		 299 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.305997 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0457  alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  32.17 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  29.96 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  29.11 
 
 		 256 aa  75.5  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  29.22 
 
 		 256 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  26.42 
 
 		 267 aa  69.3  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 		 317 aa  69.3  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  29.54 
 
 		 260 aa  68.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  28.81 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  26.33 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  28.38 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  25.67 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 		 270 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1360  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4742  alpha/beta hydrolase fold  25.23 
 
 		 278 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.15 
 
 		 270 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  25.96 
 
 		 268 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.37 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  28.39 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  27.87 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1087  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0532953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  28.33 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  28.33 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  25.62 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  28.33 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  28.99 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  25.85 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.18 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  29.55 
 
 		 275 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 		 254 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 		 259 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  23.73 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4894  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2990  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.05 
 
 		 265 aa  62  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  25.31 
 
 		 267 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  28.33 
 
 		 260 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5376  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  26.45 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1276  alpha/beta hydrolase fold  25.16 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0327  alpha/beta hydrolase  27.85 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0934  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.570173  hitchhiker  0.00160688 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  24.23 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  23.71 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  27.27 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0712  alpha/beta hydrolase fold protein  27.62 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0185  Alpha/beta hydrolase  25.08 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  26.67 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0919  alpha/beta hydrolase fold  20 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.495242  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>