78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5276 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5276  putative OHCU decarboxylase  100 
 
 		 165 aa  332  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1825  OHCU decarboxylase  58.6 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4866  putative OHCU decarboxylase  40 
 
 		 173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5166  putative OHCU decarboxylase  40 
 
 		 173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.3304  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4780  putative OHCU decarboxylase  40 
 
 		 173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.358879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5382  putative OHCU decarboxylase  39.38 
 
 		 172 aa  122  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.364924  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2069  hypothetical protein  50.97 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1332  OHCU decarboxylase  43.12 
 
 		 197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1407  putative OHCU decarboxylase  39.38 
 
 		 173 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1915  putative OHCU decarboxylase  36.09 
 
 		 188 aa  104  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000496427  normal  0.213147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6772  putative OHCU decarboxylase  33.73 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0114  OHCU decarboxylase  40.12 
 
 		 193 aa  99  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0720  Oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase  41.67 
 
 		 182 aa  98.6  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4739  OHCU decarboxylase  40 
 
 		 231 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5680  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  34.46 
 
 		 520 aa  94  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2781  OHCU decarboxylase  40.38 
 
 		 196 aa  93.2  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  hitchhiker  0.0000130828 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4869  putative OHCU decarboxylase  31.33 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  35.43 
 
 		 516 aa  92  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5938  OHCU decarboxylase  37.27 
 
 		 164 aa  87  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  36.2 
 
 		 825 aa  87  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3454  putative OHCU decarboxylase  36.97 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08270  OHCU decarboxylase  36.77 
 
 		 165 aa  84.3  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.836682  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3569  OHCU decarboxylase  36.25 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2536  OHCU decarboxylase  36.2 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.630582  normal  0.368039 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1144  putative urate oxidase, N-terminal  39.62 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2771  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  39.6 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107822  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2960  OHCU decarboxylase  40.49 
 
 		 169 aa  80.5  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3732  putative OHCU decarboxylase  33.94 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0938  putative urate oxidase, N-terminal  36.2 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456105  normal  0.914947 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02518  uricase-like protein  30.15 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1392  OHCU decarboxylase  29.01 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.165224  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2427  hypothetical protein  27.56 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6199  hypothetical protein  31.14 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  34.46 
 
 		 478 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1938  OHCU decarboxylase  28.14 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  0.0392315 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0837  OHCU decarboxylase  27.21 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.653813  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2121  hypothetical protein  28.66 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1780  OHCU decarboxylase  25.77 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3708  hypothetical protein  29.2 
 
 		 173 aa  51.6  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  32.17 
 
 		 471 aa  50.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5850  hypothetical protein  30.72 
 
 		 170 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107994  hitchhiker  0.000262716 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2600  hypothetical protein  31.25 
 
 		 179 aa  50.8  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.562153  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  36.27 
 
 		 478 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1344  OHCU decarboxylase  28.95 
 
 		 190 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  37.14 
 
 		 482 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2841  hypothetical protein  28.4 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2965  xanthine permease  32.21 
 
 		 640 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276589  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2261  hypothetical protein  31 
 
 		 174 aa  47.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.351618  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  30.09 
 
 		 475 aa  47.4  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  30.09 
 
 		 475 aa  47.4  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44840  hypothetical protein  29.92 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.165597 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4287  hypothetical protein  28.8 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  28.97 
 
 		 475 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1581  hypothetical protein  28.8 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.288278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3851  hypothetical protein  28 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750718  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1308  hypothetical protein  25.15 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029445 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21120  hypothetical protein  29.37 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.959154  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3613  hypothetical protein  28 
 
 		 171 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00378889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5814  hydroxyisourate hydrolase  38.98 
 
 		 279 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3212  OHCU decarboxylase  24.62 
 
 		 294 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3347  hypothetical protein  26.21 
 
 		 169 aa  44.3  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.943196  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3819  hypothetical protein  28.35 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0873335  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0215  OHCU decarboxylase  30.15 
 
 		 292 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.0296602 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5250  OHCU decarboxylase  36 
 
 		 289 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00421596 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2438  hypothetical protein  24.85 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0067  hypothetical protein  29.9 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6115  hypothetical protein  23.98 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5459  OHCU decarboxylase  24.31 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1962  hypothetical protein  23.98 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1986  hypothetical protein  23.98 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.523648 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5277  hypothetical protein  23.39 
 
 		 173 aa  41.2  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0399962 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1877  hypothetical protein  23.98 
 
 		 173 aa  41.2  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207641  normal  0.107277 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29775  predicted protein  33.7 
 
 		 194 aa  40.8  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2759  hypothetical protein  27.12 
 
 		 176 aa  40.8  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659678  normal  0.346788 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2068  hypothetical protein  25.15 
 
 		 174 aa  40.8  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  24.26 
 
 		 592 aa  40.8  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2887  OHCU decarboxylase  24.3 
 
 		 166 aa  40.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1150  hypothetical protein  33.08 
 
 		 180 aa  40.8  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.738978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>