More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3170 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  78.15 
 
 
443 aa  717    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  76.76 
 
 
468 aa  741    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  87.08 
 
 
471 aa  848    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  76.76 
 
 
468 aa  741    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
477 aa  971    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  56.99 
 
 
477 aa  504  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  56.49 
 
 
464 aa  494  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  55.19 
 
 
459 aa  494  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  53.7 
 
 
464 aa  482  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  54.61 
 
 
473 aa  475  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  54.64 
 
 
464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  53.44 
 
 
480 aa  448  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  46.77 
 
 
487 aa  380  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  44.47 
 
 
457 aa  358  9.999999999999999e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  41.12 
 
 
470 aa  348  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  39.22 
 
 
463 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  35.67 
 
 
465 aa  300  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  39.25 
 
 
486 aa  297  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  36.91 
 
 
483 aa  290  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 
466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 
496 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 
474 aa  187  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 
472 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 
473 aa  180  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 
460 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 
460 aa  170  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  30.52 
 
 
466 aa  169  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  31.04 
 
 
462 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  32.68 
 
 
430 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 
462 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 
473 aa  166  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
456 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 
454 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
456 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 
464 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 
453 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 
463 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  29.48 
 
 
465 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  30.38 
 
 
457 aa  162  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 
462 aa  160  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 
460 aa  159  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 
472 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 
456 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  31.12 
 
 
430 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 
430 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  30.5 
 
 
437 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 
436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  29.74 
 
 
466 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
430 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  32.25 
 
 
430 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 
460 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  32.25 
 
 
430 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  31.13 
 
 
466 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  30.75 
 
 
430 aa  150  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 
460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  30.44 
 
 
486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  32.49 
 
 
433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 
482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  32 
 
 
430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 
443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 
433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 
437 aa  147  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 
437 aa  147  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0699  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 
456 aa  146  6e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  27.84 
 
 
460 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 
430 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  27.43 
 
 
466 aa  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  31.04 
 
 
433 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2458  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 
442 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 
434 aa  145  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 
433 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  27.38 
 
 
480 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 
433 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 
433 aa  144  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 
435 aa  144  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  30.4 
 
 
432 aa  143  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  30.37 
 
 
438 aa  142  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 
435 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  29.5 
 
 
439 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 
435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1461  putative oxidoreductase  30.62 
 
 
454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5183  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 
430 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  29.98 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 
433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 
435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5273  oxidoreductase, putative  29.9 
 
 
430 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194713  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 
430 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 
435 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 
435 aa  140  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 
435 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  29.5 
 
 
439 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 
435 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  31.76 
 
 
426 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 
426 aa  139  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  31.76 
 
 
426 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 
472 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.76 
 
 
426 aa  139  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
470 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 
466 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  28.89 
 
 
425 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>