More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0236 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0236  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 351 aa  701    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0432  helix-turn-helix domain-containing protein  83.28 
 
 		 307 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0214  AraC family transcriptional regulator  73.68 
 
 		 304 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0224  AraC family transcriptional regulator  73.68 
 
 		 304 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0204  AraC family transcriptional regulator  73.76 
 
 		 273 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0988  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 310 aa  275  9e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0224549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2203  Helix-turn-helix, AraC domain protein  47.25 
 
 		 311 aa  242  9e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263082  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2735  Helix-turn-helix, AraC domain protein  45.13 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.395  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2893  Helix-turn-helix, AraC domain protein  44.95 
 
 		 309 aa  209  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2438  Helix-turn-helix, AraC domain protein  34.02 
 
 		 362 aa  119  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170886  normal  0.130727 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  32.23 
 
 		 1396 aa  65.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  36.54 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  32.17 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  32.17 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  37.84 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03191  transcription regulator protein  42.74 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 306 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  48.75 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  35 
 
 		 1343 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1692  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000028699  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5359  transcriptional regulator, AraC family  37.27 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3152  transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0294751  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 276 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3231  transcriptional regulator, AraC family  26.92 
 
 		 250 aa  57  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 276 aa  57  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  35.96 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  44.87 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  36.45 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  34.17 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  35.05 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 290 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4246  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 273 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 259 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 316 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 290 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 260 aa  55.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 290 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 290 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 283 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 290 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 287 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2556  AraC-like transcriptional regulator  38.27 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496188  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 129 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 257 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2107  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  34.95 
 
 		 291 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  34.02 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 283 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4299  transcriptional regulator, AraC family  37.84 
 
 		 144 aa  53.9  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  42.47 
 
 		 262 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  42.47 
 
 		 262 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0659  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 290 aa  53.5  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 291 aa  53.5  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  44.93 
 
 		 160 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 313 aa  53.1  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 326 aa  53.1  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 134 aa  52.8  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 250 aa  52.8  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0117  AraC family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0679  transcriptional regulator, AraC family  29.75 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00764856  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  35 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  42.39 
 
 		 303 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  28.07 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1235  transcriptional regulator, AraC family  39.06 
 
 		 282 aa  51.6  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  26.52 
 
 		 1366 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  30.63 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  34.21 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 353 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2703  transcription activator, effector binding  34.91 
 
 		 326 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3595  Ada regulatory protein  27.54 
 
 		 368 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  32.56 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 322 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2780  transcriptional regulator, AraC family  40.74 
 
 		 285 aa  50.8  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0531003  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 300 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  32.56 
 
 		 300 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 300 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 300 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  31.4 
 
 		 300 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 300 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 292 aa  50.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>