More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1684 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 472 aa  971    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  57.27 
 
 		 506 aa  559  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  54.47 
 
 		 495 aa  549  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  51.72 
 
 		 496 aa  518  1e-146  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  49.67 
 
 		 489 aa  461  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  50.11 
 
 		 495 aa  456  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  50.33 
 
 		 491 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  49.02 
 
 		 487 aa  450  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  46.32 
 
 		 512 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  48.45 
 
 		 609 aa  422  1e-117  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  45.45 
 
 		 513 aa  409  1e-113  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  44.35 
 
 		 578 aa  402  1e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  43.93 
 
 		 573 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  40.6 
 
 		 559 aa  396  1e-109  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  43.54 
 
 		 579 aa  397  1e-109  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  43.37 
 
 		 569 aa  394  1e-108  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  43.72 
 
 		 573 aa  394  1e-108  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  42.71 
 
 		 581 aa  382  1e-105  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  41.14 
 
 		 582 aa  370  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  40.21 
 
 		 561 aa  363  5.0000000000000005e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  42.25 
 
 		 608 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  38.53 
 
 		 458 aa  279  7e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  38.37 
 
 		 727 aa  279  8e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  37.94 
 
 		 471 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  37.75 
 
 		 453 aa  269  7e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  35.44 
 
 		 441 aa  268  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  35.78 
 
 		 445 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  36.62 
 
 		 471 aa  263  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  35.03 
 
 		 459 aa  261  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  35.71 
 
 		 492 aa  259  8e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  32.13 
 
 		 447 aa  253  5.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  37.96 
 
 		 465 aa  250  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  35.9 
 
 		 442 aa  249  5e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  32.28 
 
 		 436 aa  232  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  43.01 
 
 		 470 aa  230  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  33.47 
 
 		 776 aa  228  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  44.84 
 
 		 467 aa  226  8e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  32.74 
 
 		 706 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  32.24 
 
 		 519 aa  216  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  31.71 
 
 		 530 aa  210  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  30.98 
 
 		 523 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  31.24 
 
 		 441 aa  203  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.18 
 
 		 464 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  30.79 
 
 		 474 aa  195  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  31 
 
 		 479 aa  196  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  29.96 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  30.68 
 
 		 471 aa  189  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  37.16 
 
 		 588 aa  188  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  31.75 
 
 		 486 aa  187  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  31.18 
 
 		 481 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  29.67 
 
 		 463 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  39.59 
 
 		 543 aa  173  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 		 514 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  24.46 
 
 		 514 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 		 514 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  23.63 
 
 		 533 aa  96.7  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1392  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.62 
 
 		 317 aa  94.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2269  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.25 
 
 		 345 aa  86.7  8e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.17 
 
 		 308 aa  86.3  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.96 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00116324  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.07 
 
 		 336 aa  82.4  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.41 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1762  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.9 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.114768 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3175  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.02 
 
 		 337 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1976  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.07 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2100  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.58 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.58 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2133  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.58 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1959  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.58 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1937  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.58 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2166  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.58 
 
 		 337 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3318  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.94 
 
 		 333 aa  76.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.34 
 
 		 330 aa  76.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5046  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.67 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2030  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.33 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0829  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.97 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1830  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.11 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  36.11 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  36.49 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.02 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1230  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.83 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0359079 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  29.19 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.64 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.321552  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0892  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0260  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.95 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.58 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.989174  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2135  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.58 
 
 		 323 aa  73.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4556  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.81 
 
 		 337 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  31.33 
 
 		 496 aa  72.8  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.31 
 
 		 318 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3397  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.58 
 
 		 337 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2177  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.6 
 
 		 339 aa  73.2  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.697668  normal  0.807394 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0240  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.34 
 
 		 330 aa  72  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4536  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.69 
 
 		 337 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.792195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2266  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.64 
 
 		 329 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00162832  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  29.05 
 
 		 333 aa  72  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  28.9 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  23.61 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  28.35 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>