187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0372 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0372  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  666    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1326  hypothetical protein  41.04 
 
 		 354 aa  250  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2944  hypothetical protein  38.22 
 
 		 368 aa  241  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.81591  decreased coverage  0.00297728 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  24.62 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0191  hypothetical protein  26.2 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  24.58 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0245  hypothetical protein  25.21 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0574  hypothetical protein  22.67 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.877456  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1711  hypothetical protein  25.15 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0751  hypothetical protein  25.15 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0445  hypothetical protein  22.65 
 
 		 393 aa  97.4  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000355219  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1671  hypothetical protein  21.87 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2217  hypothetical protein  28.73 
 
 		 351 aa  86.3  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253249  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  28.8 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  23.71 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  22.48 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  23.1 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  23.25 
 
 		 365 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  23.96 
 
 		 423 aa  65.9  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  25.97 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  23.79 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  22.47 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  24.76 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  21.58 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  22.64 
 
 		 384 aa  62.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  22.52 
 
 		 353 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  21.85 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  20 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  26.9 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0697  protein of unknown function UPF0118  22.89 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.612025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  20.18 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  20.74 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  24 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  22.99 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  22.03 
 
 		 381 aa  59.3  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  22.03 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  23.19 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  23.3 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  22.48 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  23.64 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0336  hypothetical protein  27.14 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000639163  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  23.44 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  23.82 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1111  protein of unknown function UPF0118  24.46 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  23.74 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0113  hypothetical protein  21.97 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0968389  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  24 
 
 		 355 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  24 
 
 		 355 aa  55.8  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  24 
 
 		 355 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  24 
 
 		 355 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  24 
 
 		 355 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  23.08 
 
 		 358 aa  55.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  22.36 
 
 		 352 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3181  hypothetical protein  25 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2612  protein of unknown function UPF0118  21.31 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.751344  normal  0.787744 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  25.38 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  22.69 
 
 		 353 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  23.11 
 
 		 355 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  23.11 
 
 		 355 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  25.96 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  25.94 
 
 		 367 aa  53.9  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  20.06 
 
 		 351 aa  53.9  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  24.59 
 
 		 363 aa  53.9  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  20.63 
 
 		 369 aa  53.5  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  22.55 
 
 		 355 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1276  acid membrane antigen A  25.29 
 
 		 347 aa  53.1  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  22.9 
 
 		 352 aa  53.1  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  22.36 
 
 		 352 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  20.23 
 
 		 387 aa  53.1  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  22.55 
 
 		 355 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  24.14 
 
 		 373 aa  52.8  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  22.59 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  22.22 
 
 		 370 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0398  protein of unknown function UPF0118  23.6 
 
 		 425 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0034127  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  22.85 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  22.85 
 
 		 398 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  22.85 
 
 		 353 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  23.18 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  26.19 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  22.06 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  24.44 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  26.19 
 
 		 376 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  21.5 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  22.67 
 
 		 355 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  26.19 
 
 		 376 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  24.44 
 
 		 355 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3372  sporulation integral membrane protein YtvI  21.69 
 
 		 353 aa  50.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  24.6 
 
 		 383 aa  50.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  20.83 
 
 		 353 aa  50.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  25 
 
 		 394 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  19.1 
 
 		 361 aa  50.4  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  25.48 
 
 		 418 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  21.56 
 
 		 360 aa  50.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  25.95 
 
 		 389 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  26.47 
 
 		 382 aa  50.1  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  19.51 
 
 		 391 aa  50.1  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  26.99 
 
 		 363 aa  50.1  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1973  hypothetical protein  27.33 
 
 		 382 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000012652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3480  protein of unknown function UPF0118  26.11 
 
 		 412 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>