More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0954 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0954  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
494 aa  988    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000813647 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0106  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  74.8 
 
 
484 aa  724    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4464  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.54 
 
 
501 aa  622  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3984  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.14 
 
 
519 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.950119 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4353  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.67 
 
 
519 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.807247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.46 
 
 
482 aa  597  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.341636 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0999  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.27 
 
 
527 aa  593  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.431733  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3323  DEAD/DEAH box helicase domain protein  77.48 
 
 
465 aa  585  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.469232  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0938  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  64.73 
 
 
482 aa  579  1e-164  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.556655  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1773  DEAD/DEAH box helicase-like  69.25 
 
 
477 aa  580  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0933  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  64.52 
 
 
482 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2249  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.56 
 
 
498 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3974  putative ATP-dependent RNA helicase  71.85 
 
 
478 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2985  DEAD/DEAH box helicase  60.08 
 
 
516 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0305282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2833  DEAD/DEAH box helicase-like  60.91 
 
 
503 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.900807  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2463  DEAD/DEAH box helicase-like  60.16 
 
 
500 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4759  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  72.16 
 
 
537 aa  550  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346691 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2755  DEAD/DEAH box helicase domain protein  72.01 
 
 
472 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0813357  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3252  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.13 
 
 
504 aa  546  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0717985  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1913  DEAD/DEAH box helicase domain protein  67.75 
 
 
505 aa  541  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2321  DEAD/DEAH box helicase-like  60.2 
 
 
487 aa  541  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2431  ATP-dependent RNA helicase  57.31 
 
 
516 aa  541  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2120  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.7 
 
 
521 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308058  decreased coverage  0.00839171 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1478  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.24 
 
 
499 aa  536  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142934  hitchhiker  0.00960181 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0608  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  67.83 
 
 
462 aa  530  1e-149  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.166251  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1657  DEAD/DEAH box helicase  73.64 
 
 
483 aa  529  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0121598  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.82 
 
 
507 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.173393  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1195  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.68 
 
 
516 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2536  ATP-dependent helicase, DEAD-box  60.68 
 
 
518 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314913  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1333  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.98 
 
 
493 aa  475  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218178  normal  0.0904092 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0856  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.04 
 
 
503 aa  473  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0104833  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1200  DEAD/DEAH box helicase-like  63.27 
 
 
644 aa  469  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.994083  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1324  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.48 
 
 
498 aa  470  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.695587  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2746  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.11 
 
 
678 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633229  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2718  DEAD/DEAH box helicase  57.86 
 
 
799 aa  462  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.370248  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1809  DEAD/DEAH box helicase-like  54.43 
 
 
493 aa  461  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.36 
 
 
555 aa  461  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.131298 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1051  DEAD/DEAH box helicase-like protein  53.95 
 
 
458 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0480198  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1292  DEAD/DEAH box helicase-like  54.25 
 
 
464 aa  429  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0140  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.76 
 
 
448 aa  419  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.398154  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.26 
 
 
489 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.33 
 
 
486 aa  363  3e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0203924  hitchhiker  0.000949009 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1148  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.15 
 
 
489 aa  363  4e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  50.4 
 
 
559 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  50.4 
 
 
481 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  50.4 
 
 
482 aa  362  8e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.4 
 
 
482 aa  362  8e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  50.4 
 
 
482 aa  362  8e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  50.4 
 
 
482 aa  362  8e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.4 
 
 
482 aa  362  8e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2082  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.34 
 
 
482 aa  362  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.162291 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.4 
 
 
571 aa  362  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.08 
 
 
509 aa  360  5e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.81 
 
 
511 aa  359  7e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.81 
 
 
497 aa  359  7e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.42 
 
 
487 aa  358  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3295  putative ATP-dependent RNA helicase 2  48.98 
 
 
491 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.81 
 
 
520 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0312074 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1704  DEAD/DEAH box helicase-like  50.81 
 
 
520 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2316  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.81 
 
 
520 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  50.94 
 
 
527 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2155  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.81 
 
 
504 aa  355  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659506  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1516  DEAD/DEAH box helicase-like  48.14 
 
 
492 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1053  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.43 
 
 
484 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3028  DEAD/DEAH box helicase-like  44.35 
 
 
506 aa  353  4e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.287974  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.2 
 
 
484 aa  352  5.9999999999999994e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0617  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50 
 
 
479 aa  349  7e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.028654 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0631  putative ATP-dependent RNA helicase 2  48.92 
 
 
494 aa  348  1e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640854  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0899  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  48.93 
 
 
537 aa  348  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.1 
 
 
463 aa  344  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.89 
 
 
493 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73004  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.23 
 
 
403 aa  343  2.9999999999999997e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0287382 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2582  DEAD/DEAH box helicase-like protein  42.94 
 
 
556 aa  343  5e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.36 
 
 
491 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2409  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.53 
 
 
493 aa  342  8e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.92601 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5070  ATP-dependent RNA helicase rhlE, putative  42.74 
 
 
629 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.38 
 
 
477 aa  341  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0458  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  43.6 
 
 
629 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.51 
 
 
525 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.51 
 
 
526 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.51 
 
 
525 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.51 
 
 
515 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2211  ATP-dependent RNA helicase protein  48 
 
 
495 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2108  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.68 
 
 
418 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.76 
 
 
454 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1257  DEAD/DEAH box helicase-like protein  44.37 
 
 
460 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.41988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2449  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.17 
 
 
485 aa  336  5.999999999999999e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727769  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2687  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.33 
 
 
533 aa  336  7e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.915441  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.55 
 
 
494 aa  335  7e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0544  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.7 
 
 
418 aa  335  1e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4192  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.74 
 
 
474 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000619  ATP-dependent RNA helicase RhlE  47.81 
 
 
522 aa  335  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.24 
 
 
550 aa  334  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1799  DEAD/DEAH box helicase-like  47.15 
 
 
472 aa  334  2e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0528  putative ATP-dependent RNA helicase  40 
 
 
635 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.358611  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  44.35 
 
 
469 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  48 
 
 
445 aa  333  3e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0954  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.46 
 
 
515 aa  334  3e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.846245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1098  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.46 
 
 
515 aa  334  3e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05560  ATP-dependent RNA helicase  39.65 
 
 
639 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978664  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>