84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0478 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0478  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 346 aa  682    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4511  von Willebrand factor type A  58.42 
 
 		 355 aa  309  4e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0819187  normal  0.539104 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8033  von Willebrand factor type A  55.85 
 
 		 353 aa  306  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4143  von Willebrand factor type A  57.71 
 
 		 355 aa  305  7e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4625  von Willebrand factor type A  57.35 
 
 		 354 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4203  von Willebrand factor type A  59.49 
 
 		 359 aa  279  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163235  normal  0.353652 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1914  von Willebrand factor, type A  50.18 
 
 		 333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0786  MxaC protein, putative  48.88 
 
 		 327 aa  239  5e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363815  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3000  von Willebrand factor, type A  53.02 
 
 		 335 aa  233  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0367852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2037  von Willebrand factor, type A  40.51 
 
 		 333 aa  189  7e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.519738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1528  MxaC protein, putative  40.51 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517778  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1898  von Willebrand factor, type A  39.49 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1893  MxaC protein, putative  37.68 
 
 		 353 aa  169  7e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0919467 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1822  von Willebrand factor, type A  38.93 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0690  von Willebrand factor, type A  34.22 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3050  von Willebrand factor type A  33.55 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4030  von Willebrand factor, type A  36.13 
 
 		 330 aa  149  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3275  MxaC protein, putative  31.47 
 
 		 342 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0556596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2418  putative MxaC-like protein  30.85 
 
 		 328 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3804  von Willebrand factor type A  31.44 
 
 		 332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  27.65 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  22.63 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  28.31 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  28.71 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  27.4 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  27.1 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  24.9 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  30.87 
 
 		 335 aa  54.3  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  29.06 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  31.67 
 
 		 349 aa  53.9  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  30.81 
 
 		 344 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  29.63 
 
 		 331 aa  53.5  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  35.51 
 
 		 325 aa  53.1  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  30.81 
 
 		 344 aa  53.1  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  34.33 
 
 		 328 aa  53.1  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  29.09 
 
 		 373 aa  52.8  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  31.4 
 
 		 334 aa  52.8  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  28.15 
 
 		 339 aa  52.8  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  27.95 
 
 		 327 aa  52  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  36.57 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  33.9 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  29.5 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  35.82 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  25.39 
 
 		 336 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 334 aa  50.4  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  31.88 
 
 		 339 aa  50.1  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  29.81 
 
 		 320 aa  50.1  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  28.15 
 
 		 328 aa  49.7  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0051  von Willebrand factor type A  28.19 
 
 		 325 aa  49.3  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  29.94 
 
 		 342 aa  49.3  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  25.55 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  25.55 
 
 		 335 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  29.71 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  31.06 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 345 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  25.55 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2991  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.65 
 
 		 364 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603006  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0656  von Willebrand factor, type A  24.59 
 
 		 309 aa  47.4  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  29.33 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  29.82 
 
 		 334 aa  47  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0197  von Willebrand factor, type A  34.11 
 
 		 795 aa  46.6  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.48931  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  28.99 
 
 		 329 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  26.14 
 
 		 318 aa  46.2  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  23.84 
 
 		 359 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  29.25 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  27.92 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  27.46 
 
 		 334 aa  45.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 340 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 533 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  28.99 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  36.11 
 
 		 282 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  28.26 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1204  von Willebrand factor type A  38.46 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2138  hypothetical protein  33.04 
 
 		 337 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401823  decreased coverage  0.00313955 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 340 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0187  von Willebrand factor type A  28.67 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  31.94 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  29.85 
 
 		 315 aa  43.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  32.31 
 
 		 327 aa  43.1  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  27.34 
 
 		 339 aa  43.1  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  28.77 
 
 		 338 aa  42.7  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.89 
 
 		 338 aa  42.4  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  26.79 
 
 		 339 aa  42.7  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>