More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1897 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1300  NADH dehydrogenase (quinone)  80 
 
 		 410 aa  685    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.823444  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1897  NADH dehydrogenase subunit D  100 
 
 		 405 aa  823    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.412503  normal  0.283556 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1081  NADH dehydrogenase subunit D  53.79 
 
 		 404 aa  429  1e-119  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.152309  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0428  NADH dehydrogenase subunit D  50.53 
 
 		 424 aa  381  1e-104  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.366275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2045  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  46.72 
 
 		 406 aa  352  1e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0264179 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0331  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  45.38 
 
 		 407 aa  347  3e-94  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.925888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1790  NADH dehydrogenase (quinone)  46.17 
 
 		 407 aa  339  7e-92  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.442089  normal  0.696133 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2272  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  44.09 
 
 		 406 aa  338  9e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.242862 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1634  NADH dehydrogenase subunit D  45.12 
 
 		 402 aa  332  8e-90  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0659  NADH dehydrogenase subunit D  43.27 
 
 		 402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0279  NADH dehydrogenase  43.08 
 
 		 378 aa  323  3e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000160652 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2120  NADH dehydrogenase subunit D  44.33 
 
 		 407 aa  322  8e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0514  NADH dehydrogenase subunit D  43.01 
 
 		 405 aa  308  9e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  41.33 
 
 		 373 aa  295  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.8 
 
 		 441 aa  280  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  38.85 
 
 		 366 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  39.22 
 
 		 793 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.86 
 
 		 404 aa  272  7e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  39.06 
 
 		 791 aa  270  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  38.54 
 
 		 367 aa  269  5e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.76 
 
 		 400 aa  270  5e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.54 
 
 		 390 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  38.06 
 
 		 366 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  37.47 
 
 		 401 aa  266  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.21 
 
 		 392 aa  266  5e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  38.64 
 
 		 367 aa  265  1e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1294  F420H2 dehydrogenase subunit D  37.7 
 
 		 374 aa  265  1e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.196635  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  38.64 
 
 		 367 aa  265  1e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3823  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  38.28 
 
 		 580 aa  264  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.203539  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  38.8 
 
 		 792 aa  263  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  37.85 
 
 		 393 aa  263  3e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  36.65 
 
 		 366 aa  263  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  37.88 
 
 		 393 aa  263  4e-69  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  37.53 
 
 		 392 aa  263  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  39.06 
 
 		 787 aa  262  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  37.96 
 
 		 367 aa  262  8.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  37.86 
 
 		 367 aa  262  8.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4518  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.48 
 
 		 415 aa  261  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1221  NADH dehydrogenase subunit D  37.5 
 
 		 367 aa  261  1e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.240217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  37.17 
 
 		 366 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  37.17 
 
 		 366 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  37.17 
 
 		 366 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  36.79 
 
 		 397 aa  262  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0375  NADH dehydrogenase (quinone)  39.09 
 
 		 375 aa  261  2e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  37.85 
 
 		 390 aa  260  4e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  36.91 
 
 		 366 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  36.91 
 
 		 366 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1596  NADH dehydrogenase (quinone)  36.39 
 
 		 406 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  36.91 
 
 		 366 aa  259  6e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  36.91 
 
 		 366 aa  259  7e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  36.65 
 
 		 366 aa  259  9e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1602  NADH dehydrogenase subunit D  37.5 
 
 		 368 aa  258  1e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  37.76 
 
 		 389 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  36.65 
 
 		 366 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  37.5 
 
 		 389 aa  257  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1125  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  37.24 
 
 		 593 aa  257  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.64928  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2300  NADH dehydrogenase subunit D  35.64 
 
 		 403 aa  257  3e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  37.05 
 
 		 417 aa  256  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  37.82 
 
 		 390 aa  256  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  37.05 
 
 		 417 aa  256  7e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  37.05 
 
 		 417 aa  256  7e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  36.56 
 
 		 417 aa  256  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  37.05 
 
 		 417 aa  256  7e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  37.05 
 
 		 417 aa  256  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  37.05 
 
 		 417 aa  256  7e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  37.05 
 
 		 417 aa  256  7e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  37.05 
 
 		 417 aa  256  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2884  NADH dehydrogenase subunit D  37.69 
 
 		 416 aa  255  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736243  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2985  NADH dehydrogenase subunit D  36.27 
 
 		 406 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0128464  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  37.47 
 
 		 379 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  37.47 
 
 		 379 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1442  NADH dehydrogenase subunit D  36.68 
 
 		 408 aa  255  1.0000000000000001e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.331272  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1308  NADH dehydrogenase subunit D  36.1 
 
 		 418 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.72 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3409  F420H2 dehydrogenase subunit D  36.9 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.170957  normal  0.90197 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2414  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  35.25 
 
 		 593 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0246987  normal  0.2214 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  36.56 
 
 		 417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  35.6 
 
 		 366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2574  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  37.21 
 
 		 379 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.677679  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  36.69 
 
 		 388 aa  253  3e-66  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  36.32 
 
 		 417 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  36.56 
 
 		 417 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1118  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  36.72 
 
 		 592 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.374283  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  37.79 
 
 		 402 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0746  NADH dehydrogenase (quinone)  35.84 
 
 		 399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  36.32 
 
 		 417 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  36.32 
 
 		 417 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  35.94 
 
 		 794 aa  253  5.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  37.5 
 
 		 390 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1885  NADH dehydrogenase subunit D  37.18 
 
 		 402 aa  252  7e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.634993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4129  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.18 
 
 		 396 aa  252  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2575  NADH dehydrogenase subunit D  36.08 
 
 		 401 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0392469  normal  0.134645 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1286  NADH dehydrogenase (quinone)  39.02 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.511189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4393  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.92 
 
 		 396 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0182447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  36.72 
 
 		 794 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  36.98 
 
 		 374 aa  250  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  36.98 
 
 		 374 aa  250  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  36.08 
 
 		 417 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_004310  BR0805  NADH dehydrogenase subunit D  36.9 
 
 		 396 aa  250  4e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0798929  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  36.34 
 
 		 406 aa  250  4e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>