233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0480 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0480  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
203 aa  412  1e-114  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.671352  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 
330 aa  78.6  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  37.17 
 
 
342 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  31.88 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  31.88 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  31.88 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  32.48 
 
 
389 aa  72.4  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  34.43 
 
 
321 aa  71.6  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  33.59 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  30.43 
 
 
351 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  33.06 
 
 
329 aa  68.2  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  35.96 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  39.18 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  32.11 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  35.14 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0186  cytochrome c oxidase subunit II  40.22 
 
 
172 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.721142  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  30.51 
 
 
311 aa  63.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  33.04 
 
 
318 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29.92 
 
 
316 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  28.68 
 
 
244 aa  62  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  36.73 
 
 
354 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  32.76 
 
 
211 aa  61.2  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  31.03 
 
 
337 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1936  cytochrome c oxidase subunit II  39 
 
 
243 aa  61.2  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.244228  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  30.17 
 
 
314 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  33.04 
 
 
288 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  29.77 
 
 
362 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  32.65 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  31.86 
 
 
337 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  31.86 
 
 
337 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2397  cytochrome c oxidase, subunit II  35.65 
 
 
177 aa  59.3  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  31.3 
 
 
367 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1944  cytochrome c oxidase, subunit II  35.42 
 
 
149 aa  59.3  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  32.43 
 
 
302 aa  58.9  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  27.21 
 
 
334 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  32.08 
 
 
338 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0761  cytochrome c oxidase subunit II  33.64 
 
 
146 aa  58.9  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.254887  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  30.65 
 
 
399 aa  58.9  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  31.63 
 
 
314 aa  58.5  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2667  cytochrome c oxidase, subunit II  37.11 
 
 
175 aa  58.2  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000731969  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  26.35 
 
 
408 aa  58.2  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  29.75 
 
 
362 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 
329 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  29.75 
 
 
362 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  28.17 
 
 
313 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
318 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  28.7 
 
 
301 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  35 
 
 
370 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3849  cytochrome c oxidase, subunit II  29.7 
 
 
235 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  29.13 
 
 
405 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  27.21 
 
 
310 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  32.04 
 
 
354 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  30.4 
 
 
426 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  33.93 
 
 
272 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.78 
 
 
311 aa  55.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  30.56 
 
 
334 aa  55.5  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  32.99 
 
 
324 aa  55.5  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  31.63 
 
 
352 aa  55.5  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  30.91 
 
 
344 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  33.33 
 
 
315 aa  55.5  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  31.37 
 
 
434 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  28.57 
 
 
336 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  29.52 
 
 
334 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  31.07 
 
 
352 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2971  cytochrome c oxidase, subunit II  34.74 
 
 
176 aa  54.3  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297195  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  31.65 
 
 
269 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  31.07 
 
 
352 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  32.65 
 
 
353 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1471  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  24.67 
 
 
401 aa  52.8  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2712  cytochrome c oxidase, subunit II  35.23 
 
 
180 aa  52.8  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  28.74 
 
 
155 aa  52.8  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1453  cytochrome c oxidase, subunit II  32.8 
 
 
299 aa  52.8  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0600133  normal  0.252589 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  31.52 
 
 
168 aa  52.4  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  31.63 
 
 
346 aa  52.4  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  31.48 
 
 
372 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  32.29 
 
 
371 aa  52  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  31.48 
 
 
372 aa  51.6  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  31.48 
 
 
381 aa  51.6  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  28.87 
 
 
322 aa  51.6  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  31.68 
 
 
339 aa  51.2  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2167  cytochrome c oxidase, subunit II  30.89 
 
 
316 aa  51.6  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.238577  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8116  cytochrome c oxidase subunit II  35.71 
 
 
187 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29.9 
 
 
355 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  29.07 
 
 
314 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  26.19 
 
 
353 aa  51.2  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  23.93 
 
 
377 aa  51.2  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  30.23 
 
 
273 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  27.05 
 
 
374 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 
370 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4071  cytochrome c oxidase, subunit II  31.31 
 
 
328 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  30.84 
 
 
243 aa  50.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  26.19 
 
 
359 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  30.43 
 
 
168 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  31.63 
 
 
336 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  28.42 
 
 
327 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  33.72 
 
 
162 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  27.59 
 
 
272 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  29.52 
 
 
320 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  32.26 
 
 
321 aa  50.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  29.52 
 
 
320 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>