51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0617 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0617  ribonuclease H-related protein  100 
 
 		 210 aa  438  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0129838 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2542  putative ribonuclease H1  54.76 
 
 		 215 aa  230  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1954  ribonuclease H-related protein  51.94 
 
 		 211 aa  223  2e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5118  ribonuclease H-related protein  51.69 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2423  double-stranded RNA/RNA-DNA hybrid binding protein-like protein  50.71 
 
 		 212 aa  206  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214407  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03160  ribonuclease H-related protein  46.6 
 
 		 212 aa  201  6e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1213  ribonuclease H  49.77 
 
 		 216 aa  187  8e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3161  hypothetical protein  43.06 
 
 		 211 aa  102  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.593749  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1682  ribonuclease H  32.04 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240069  unclonable  0.00000212508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0066  putative ribonuclease HI  32.3 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0792726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1491  putative ribonuclease HI  32.73 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3175  ribonuclease H  30.92 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.983549  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1701  ribonuclease HI  26.46 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1523  ribonuclease H  30.06 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0758  ribonuclease H  31.84 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1820  ribonuclease H  50 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1484  ribonuclease H  29.31 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000443868  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  29.84 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1097  ribonuclease H  30.82 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1622  ribonuclease H  30 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0319  ribonuclease H1, putative  24.6 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2757  ribonuclease H  30.73 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.107855  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0082  ribonuclease H  59.52 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000796029  decreased coverage  0.0000638977 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3186  ribonuclease H  33.33 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4709  ribonuclease H  32.69 
 
 		 236 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00291  ribonuclease H-related protein  45.83 
 
 		 97 aa  52.4  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0096  RNase H  48.84 
 
 		 251 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638062 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1189  ribonuclease H  28.78 
 
 		 245 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.842568 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03470  ribonuclease H, putative  40.3 
 
 		 321 aa  48.5  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  40 
 
 		 376 aa  48.5  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2944  ribonuclease H-related protein  46 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.78167e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  32.48 
 
 		 145 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08950  Ribonuclease H  41.25 
 
 		 269 aa  45.1  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09202  conserved hypothetical protein  42.86 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2924  ribonuclease H  32.23 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  50 
 
 		 163 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  42.19 
 
 		 156 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  29.91 
 
 		 154 aa  43.1  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  37.62 
 
 		 159 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000408734  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  29.91 
 
 		 154 aa  43.1  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3543  hypothetical protein  42.22 
 
 		 321 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0291623  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2115  ribonuclease H  39.44 
 
 		 146 aa  43.5  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.111638  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  27.59 
 
 		 149 aa  42.7  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0675  RNase HI  44.19 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00564267  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1373  Ribonuclease H  34.81 
 
 		 154 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000016883  hitchhiker  0.00000157044 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05188  ribonuclease H, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07180)  36.36 
 
 		 463 aa  42  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484152  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl475  ribonuclease HI  30.69 
 
 		 206 aa  42  0.006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0667  ribonuclease HI  29.91 
 
 		 151 aa  41.6  0.008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.652902  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  39.68 
 
 		 151 aa  41.6  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2399  ribonuclease H  47.17 
 
 		 157 aa  41.2  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1511  ribonuclease H  37.84 
 
 		 302 aa  41.2  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182171  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>