More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0667 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0667  ribonuclease HI  100 
 
 		 151 aa  312  9.999999999999999e-85  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.652902  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0844  ribonuclease H  46 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0182  ribonuclease H  49.66 
 
 		 157 aa  148  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08950  Ribonuclease H  46.81 
 
 		 269 aa  148  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0761  ribonuclease H  51.05 
 
 		 146 aa  147  5e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02469  ribonuclease H  48.61 
 
 		 150 aa  147  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.79431  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4573  Ribonuclease H  52.45 
 
 		 159 aa  146  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1362  ribonuclease H  48.61 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0263  ribonuclease H  51.06 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.988009  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1297  ribonuclease H  49.28 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2653  ribonuclease H  52.82 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal  0.0661742 
 
 
-
 
NC_002978  WD0304  ribonuclease H  51.8 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0206259  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  49.65 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  50.36 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  49.28 
 
 		 160 aa  141  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2289  Ribonuclease H  51.43 
 
 		 152 aa  141  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124048  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  46.9 
 
 		 151 aa  140  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1973  ribonuclease H  51.41 
 
 		 148 aa  139  9e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1745  ribonuclease H  51.41 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.134383 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  44.67 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  48.59 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0502  ribonuclease H  46.31 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  48.59 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  49.64 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  44.97 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  49.62 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  50.72 
 
 		 154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  48.25 
 
 		 154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1024  ribonuclease H  47.52 
 
 		 154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226266  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  48.59 
 
 		 148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  48.25 
 
 		 151 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  46 
 
 		 147 aa  137  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  49.64 
 
 		 150 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1338  ribonuclease H  48.87 
 
 		 143 aa  136  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  45.58 
 
 		 145 aa  135  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  51.11 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  49.65 
 
 		 161 aa  135  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  46.31 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0841  ribonuclease H  47.52 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2573  ribonuclease H  47.65 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0063199  hitchhiker  0.000000590654 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  47.3 
 
 		 146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  46.53 
 
 		 143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  47.59 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1334  ribonuclease H  48.12 
 
 		 143 aa  134  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  50.75 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  48.97 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  47.86 
 
 		 147 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  47.86 
 
 		 147 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  47.86 
 
 		 147 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  46.62 
 
 		 148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  47.14 
 
 		 150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  46.62 
 
 		 148 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  46.62 
 
 		 148 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  46.62 
 
 		 148 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  46.62 
 
 		 148 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  46.62 
 
 		 148 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  46.62 
 
 		 148 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  48.23 
 
 		 147 aa  133  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2690  ribonuclease H  49.29 
 
 		 146 aa  133  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2071  ribonuclease H  44.14 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  46.9 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  48.28 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  48.57 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  48.89 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  46.9 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0154  ribonuclease H  43.62 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  45.21 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  45.52 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1616  ribonuclease H  45.58 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000113365  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2570  ribonuclease HI  42.57 
 
 		 160 aa  131  3e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000396954  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  48.28 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0593  ribonuclease H  47.18 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0867  ribonuclease H  42.95 
 
 		 175 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  47.06 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2281  ribonuclease H  49.28 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  47.1 
 
 		 164 aa  131  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  46.9 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  45.65 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  47.14 
 
 		 147 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  45.93 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  47.14 
 
 		 147 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4895  ribonuclease H  47.18 
 
 		 148 aa  130  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  48.28 
 
 		 151 aa  130  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  47.45 
 
 		 154 aa  130  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  44.44 
 
 		 148 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2115  ribonuclease H  45.89 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.111638  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  44.44 
 
 		 148 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2340  ribonuclease H  49.3 
 
 		 149 aa  130  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0409  ribonuclease H  47.86 
 
 		 155 aa  130  7.999999999999999e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1134  ribonuclease H  49.28 
 
 		 150 aa  130  7.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.326698  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0246  ribonuclease H  43.62 
 
 		 149 aa  130  9e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2435  Ribonuclease H  47.45 
 
 		 235 aa  129  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000684172  hitchhiker  0.00771463 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0301  ribonuclease H  44.22 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0293  ribonuclease H  44.22 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358682  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2527  ribonuclease H  42.95 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832874  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  47.01 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0286  ribonuclease H  44.22 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0307  ribonuclease H  44.22 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0142891  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0288  ribonuclease H  44.22 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.170302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  46.43 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>