61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5874 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5874  cytochrome c class I  100 
 
 		 180 aa  361  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362058  normal  0.18158 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  82.35 
 
 		 185 aa  268  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3665  cytochrome c, class I  70.7 
 
 		 194 aa  229  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  62.28 
 
 		 179 aa  228  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3340  cytochrome c, class I  70.06 
 
 		 194 aa  226  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7231  cytochrome c class I  58.42 
 
 		 200 aa  220  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  60.74 
 
 		 180 aa  202  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  66.67 
 
 		 195 aa  202  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6593  cytochrome c, class I  65.85 
 
 		 174 aa  198  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1239  cytochrome c, class I  65.85 
 
 		 174 aa  198  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  60.81 
 
 		 181 aa  189  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6197  cytochrome c class I  68.97 
 
 		 174 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3677  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  51.92 
 
 		 252 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1517  putative cytochrome  55.1 
 
 		 260 aa  162  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3042  cytochrome c, class I  53.29 
 
 		 259 aa  161  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  50 
 
 		 342 aa  161  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3211  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  49.67 
 
 		 206 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0147  cytochrome c, class I  55.19 
 
 		 222 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0912  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  62.91 
 
 		 202 aa  160  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.68088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4162  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  50.65 
 
 		 225 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2087  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  52.11 
 
 		 180 aa  159  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  48.77 
 
 		 171 aa  156  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4956  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  49.33 
 
 		 251 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  43.59 
 
 		 382 aa  147  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4251  putative cytochrome  49.01 
 
 		 242 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460774  normal  0.218955 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4367  cytochrome c, class I  47.74 
 
 		 243 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3912  hypothetical protein  48.3 
 
 		 211 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.411473 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1094  cytochrome c, class I  41.21 
 
 		 188 aa  141  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0341  putative cytochrome c, class I precursor  45.93 
 
 		 186 aa  140  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  43.14 
 
 		 209 aa  134  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2868  cytochrome c class I  46.54 
 
 		 187 aa  130  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2734  cytochrome c class I  43.83 
 
 		 200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  hitchhiker  0.0000919605 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2987  cytochrome c, class I  40 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  41.76 
 
 		 344 aa  124  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2437  diheme cytochrome c SoxD  43.5 
 
 		 355 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1590  cytochrome c class I  45.86 
 
 		 344 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2285  cytochrome c, class I  42.6 
 
 		 346 aa  118  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00711214  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  43.04 
 
 		 404 aa  117  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1666  cytochrome c class I  43.2 
 
 		 344 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185876  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3783  cytochrome c class I  43.75 
 
 		 355 aa  115  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  39.26 
 
 		 382 aa  114  7.999999999999999e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  38.2 
 
 		 348 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  40.76 
 
 		 360 aa  111  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3444  hypothetical protein  40.76 
 
 		 182 aa  110  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3203  Mo-co oxidoreductase dimerization domain protein  40.76 
 
 		 182 aa  110  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.595677  hitchhiker  0.0000523602 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0586  hypothetical protein  37.5 
 
 		 239 aa  99  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.649014  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0157  hypothetical protein  40.48 
 
 		 331 aa  90.9  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000097536  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1569  cytochrome c, class I  32.38 
 
 		 141 aa  54.3  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  32.43 
 
 		 678 aa  53.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2891  cytochrome c, class I  32.58 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0317  cytochrome c, class I  35 
 
 		 285 aa  47.4  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00320646 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3241  extracellular solute-binding protein  29.36 
 
 		 415 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0294244  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5127  extracellular solute-binding protein  29.36 
 
 		 415 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5154  extracellular solute-binding protein  29.36 
 
 		 401 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  29.66 
 
 		 318 aa  43.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0952  cytochrome c, class I  37.97 
 
 		 192 aa  42.4  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000198815  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7193  cytochrome c class I  29.41 
 
 		 409 aa  41.6  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  0.500209 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1739  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 146 aa  41.6  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 330 aa  41.2  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5973  cytochrome c class I  31.13 
 
 		 412 aa  41.2  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1140  cytochrome c, mono- and diheme variant  23.58 
 
 		 269 aa  40.8  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000421025  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>