More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4763 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 327 aa  633  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  69.57 
 
 		 326 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.44 
 
 		 326 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.109225  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.31 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.13 
 
 		 323 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62 
 
 		 325 aa  368  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26218  normal  0.0546823 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.89 
 
 		 322 aa  311  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.3137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2568  ABC transporter permease  54.9 
 
 		 328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577987  normal  0.256762 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.2 
 
 		 324 aa  296  4e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.366309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7557  putative dipeptide ABC transporter (permease protein)  48.23 
 
 		 323 aa  296  5e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.2 
 
 		 323 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.12 
 
 		 325 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.15877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4328  putative ABC transporter, permease protein  48.9 
 
 		 325 aa  291  9e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.51 
 
 		 325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0648374  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1040  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.83 
 
 		 325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.314534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.77 
 
 		 340 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.66 
 
 		 340 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3132  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.13 
 
 		 340 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.56 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1650  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.64 
 
 		 323 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.83 
 
 		 323 aa  276  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.929546  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.37 
 
 		 340 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00450006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2013  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.62 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.59 
 
 		 323 aa  266  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.259028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.94 
 
 		 336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.144815  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.34 
 
 		 323 aa  259  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.372701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.77 
 
 		 322 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0636999  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0562  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.97 
 
 		 322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618484  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.32 
 
 		 327 aa  252  6e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3967  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.56 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.979958  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.56 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.892452  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0785  peptide ABC transporter, permease protein  41.23 
 
 		 332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.334762  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  42.01 
 
 		 336 aa  241  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.9 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  42.31 
 
 		 336 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  42.31 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  43.49 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.35 
 
 		 329 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.637959  normal  0.0297418 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.77 
 
 		 328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 		 336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5137  putative peptide ABC transporter protein, permease protein  46.23 
 
 		 339 aa  239  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417349 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0736  peptide ABC transporter, permease protein  40.72 
 
 		 327 aa  239  5e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.52 
 
 		 309 aa  239  5e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.01 
 
 		 336 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.01 
 
 		 336 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  42.01 
 
 		 336 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7182  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  43.71 
 
 		 329 aa  238  9e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0141  peptide/opine/nickel ABC transporter inner membrane protein  44.38 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.71 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.97 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  39.44 
 
 		 339 aa  237  3e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  39.55 
 
 		 321 aa  236  4e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  41.89 
 
 		 336 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1564  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  44.34 
 
 		 326 aa  235  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.07 
 
 		 329 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.487916  normal  0.350225 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3081  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.16 
 
 		 322 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.957751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  39.87 
 
 		 321 aa  235  9e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.3 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  41.89 
 
 		 336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.63 
 
 		 333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.88 
 
 		 334 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.54 
 
 		 328 aa  232  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.14 
 
 		 313 aa  232  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.3 
 
 		 334 aa  232  7.000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.68 
 
 		 332 aa  232  8.000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474892  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  43.39 
 
 		 306 aa  231  9e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  43.39 
 
 		 306 aa  231  9e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  40.95 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.46 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4610  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.39 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.32 
 
 		 321 aa  231  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.07 
 
 		 334 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4392  oligopeptide ABC transporter permease  43.69 
 
 		 306 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4732  oligopeptide ABC transporter permease protein  43.69 
 
 		 306 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.61 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19900  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  44.37 
 
 		 348 aa  229  6e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00317245  hitchhiker  0.000399681 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.58 
 
 		 320 aa  228  7e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663455  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0244  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  42.9 
 
 		 336 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  38.94 
 
 		 339 aa  228  7e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0438  dipeptide ABC transporter, permease protein  42.9 
 
 		 336 aa  228  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0257  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  42.9 
 
 		 336 aa  228  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0183254  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  41.49 
 
 		 336 aa  228  9e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  38.64 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  38.64 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  38.94 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  38.64 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  38.64 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  38.64 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1978  putative ABC transporter  44.34 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  38.94 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.94 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  38.64 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  38.64 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  38.94 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  38.64 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  38.94 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.8 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  38.64 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  38.94 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  38.64 
 
 		 381 aa  227  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>