231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4271 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  100 
 
 
192 aa  390  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  82.11 
 
 
192 aa  329  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  80.53 
 
 
192 aa  328  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  80.53 
 
 
192 aa  327  8e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  82.16 
 
 
192 aa  325  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  82.16 
 
 
192 aa  324  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  81.25 
 
 
192 aa  324  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  81.25 
 
 
192 aa  324  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  80.75 
 
 
192 aa  323  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  80.21 
 
 
192 aa  321  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  78.95 
 
 
192 aa  320  7e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  76.84 
 
 
192 aa  308  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  75.79 
 
 
192 aa  305  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  75.68 
 
 
192 aa  304  5.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  77.72 
 
 
189 aa  303  7e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  75.26 
 
 
201 aa  294  5e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  76.09 
 
 
194 aa  293  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  72.4 
 
 
199 aa  289  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  72.4 
 
 
198 aa  287  7e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  74.46 
 
 
201 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  74.33 
 
 
192 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  72.97 
 
 
202 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  70.97 
 
 
194 aa  282  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  74.73 
 
 
201 aa  281  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  77.49 
 
 
189 aa  281  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  70.16 
 
 
196 aa  281  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  71.96 
 
 
201 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  68.68 
 
 
191 aa  267  5.9999999999999995e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  69.4 
 
 
193 aa  264  5.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  69.4 
 
 
193 aa  263  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  66.49 
 
 
209 aa  261  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.14 
 
 
202 aa  261  4.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  64.06 
 
 
235 aa  261  6e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.49 
 
 
190 aa  261  6e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.41 
 
 
200 aa  260  8e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.3 
 
 
207 aa  259  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  63.54 
 
 
192 aa  259  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.59 
 
 
195 aa  258  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  67.21 
 
 
192 aa  258  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  67.03 
 
 
196 aa  255  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.85 
 
 
196 aa  252  3e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.76 
 
 
192 aa  248  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  57.56 
 
 
194 aa  203  1e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  52.94 
 
 
210 aa  201  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  50.27 
 
 
202 aa  198  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  47.06 
 
 
228 aa  187  8e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.66 
 
 
217 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  43.68 
 
 
216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  41.34 
 
 
190 aa  157  8e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40.22 
 
 
191 aa  154  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  37.43 
 
 
201 aa  150  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40.96 
 
 
212 aa  148  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  37.84 
 
 
191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  36.41 
 
 
195 aa  140  8e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  37.43 
 
 
214 aa  137  7e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.46 
 
 
214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2585  hypothetical protein  31.18 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2630  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.18 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544935  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2624  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.18 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3017  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.09 
 
 
209 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271489  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.11 
 
 
202 aa  87.8  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  35.82 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  30 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.6 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  30.22 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.99 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  28.57 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.57 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  28.12 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  29.76 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.59 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  29.48 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.18 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.57 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6526  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00474121  normal  0.101119 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  31.93 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  30.43 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  28.57 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  28.81 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.88 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.62 
 
 
196 aa  72  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.88 
 
 
197 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.34 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.26 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.48 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.34 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  30.32 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.88 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  27.54 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1869  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.72 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0138584  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8777  peroxidase family protein  29.93 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  37.66 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  29.12 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  25.97 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.85 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  28.16 
 
 
219 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  31.58 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  28.16 
 
 
186 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.68 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>