138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3278 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3278  Dyp-type peroxidase family protein  100 
 
 
413 aa  830    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1662  Dyp-type peroxidase family  71.31 
 
 
413 aa  535  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0431  Dyp-type peroxidase family protein  70.24 
 
 
412 aa  529  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1138  Tat-translocated enzyme  59.9 
 
 
423 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798761  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2104  Tat-translocated enzyme  59.9 
 
 
423 aa  491  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1260  Tat-translocated enzyme  59.9 
 
 
423 aa  490  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118013  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01021  hypothetical protein  59.41 
 
 
423 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2624  Dyp-type peroxidase family  59.41 
 
 
423 aa  486  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746302  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2874  Tat-translocated enzyme  60.29 
 
 
432 aa  484  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243637  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01028  hypothetical protein  59.41 
 
 
423 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1134  Tat-translocated enzyme  59.41 
 
 
423 aa  486  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0503262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2577  Dyp-type peroxidase family protein  59.41 
 
 
423 aa  486  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3369  twin-arginine translocation pathway signal:Tat-translocated enzyme:Dyp-type peroxidase  62.01 
 
 
440 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0100762  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3598  dyp-type peroxidase family protein  61.9 
 
 
440 aa  478  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1547  Dyp-type peroxidase family protein  60.05 
 
 
427 aa  479  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.844225  normal  0.133092 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3145  Dyp-type peroxidase family  59.07 
 
 
431 aa  481  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2782  Dyp-type peroxidase family  59.17 
 
 
437 aa  477  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2927  Dyp-type peroxidase family protein  61.52 
 
 
430 aa  471  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000039916  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2262  Dyp-type peroxidase family protein  56.42 
 
 
434 aa  464  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2042  Dyp-type peroxidase family protein  56.42 
 
 
434 aa  464  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.309874  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  59.43 
 
 
444 aa  463  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2364  Dyp-type peroxidase family protein  56.17 
 
 
434 aa  461  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124254  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1956  Tat-translocated enzyme  62.13 
 
 
442 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3857  Dyp-type peroxidase family protein  57.99 
 
 
444 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.722047  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1809  Dyp-type peroxidase family  56.78 
 
 
433 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64569 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2599  Tat-translocated enzyme  55.07 
 
 
447 aa  426  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1735  Dyp-type peroxidase family protein  54.01 
 
 
434 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117857  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  58.15 
 
 
422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  55.59 
 
 
416 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  51.94 
 
 
416 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  52.2 
 
 
523 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  51.07 
 
 
420 aa  357  2.9999999999999997e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4243  Tat-translocated enzyme  49.4 
 
 
419 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4329  Dyp-type peroxidase family protein  49.4 
 
 
419 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4622  Dyp-type peroxidase family protein  49.4 
 
 
419 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1916  Dyp-type peroxidase family  41.88 
 
 
420 aa  256  6e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3350  Dyp-type peroxidase family  42.53 
 
 
419 aa  255  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334772  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4289  Dyp-type peroxidase family  43.39 
 
 
441 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7007  Dyp-type peroxidase family protein  42.19 
 
 
484 aa  245  8e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.54132 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0190  Tat-translocated enzyme  42.33 
 
 
430 aa  245  9e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0695897 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5684  Dyp-type peroxidase family  41.12 
 
 
416 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242991  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2530  Dyp-type peroxidase family  39.3 
 
 
401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1950  Dyp-type peroxidase family protein  38.44 
 
 
451 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3951  Dyp-type peroxidase  38.46 
 
 
436 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116282  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4911  Dyp-type peroxidase family  40.63 
 
 
441 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4775  Dyp-type peroxidase family protein  38.54 
 
 
437 aa  226  8e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3900  Dyp-type peroxidase family  40.53 
 
 
435 aa  225  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0223253 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1834  Tat-translocated enzyme, Dyp-type peroxidase  36.5 
 
 
435 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231169  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4829  Dyp-type peroxidase family  37.03 
 
 
434 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641078  normal  0.0470559 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0231  Tat-translocated enzyme  38.48 
 
 
449 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1566  Dyp-type peroxidase family  38.71 
 
 
428 aa  218  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2354  Dyp-type peroxidase  39.05 
 
 
402 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25540  Tat-translocated enzyme  36.65 
 
 
460 aa  211  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2987  Dyp-type peroxidase family  39.69 
 
 
403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000449703  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1023  hypothetical protein  35.48 
 
 
401 aa  193  5e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0392  Dyp-type peroxidase family protein  35.28 
 
 
409 aa  189  8e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0402  Dyp-type peroxidase family protein  35.28 
 
 
409 aa  189  8e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4209  Dyp-type peroxidase family protein  37.5 
 
 
402 aa  186  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2157  Dyp-type peroxidase family protein  36.99 
 
 
398 aa  186  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923175  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3064  Dyp-type peroxidase family  37.5 
 
 
479 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000193803  normal  0.0168206 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1602  Dyp-type peroxidase  36 
 
 
394 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1626  Dyp-type peroxidase family protein  36 
 
 
394 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2591  Dyp-type peroxidase  36.77 
 
 
456 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3398  Dyp-type peroxidase  36.25 
 
 
408 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.528141  normal  0.50105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1572  Dyp-type peroxidase family protein  35.73 
 
 
394 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873877  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5006  Dyp-type peroxidase family  38.34 
 
 
414 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2498  twin-arginine translocation pathway signal  36.97 
 
 
442 aa  170  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.486253  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39250  Dyp-type peroxidase family  36.56 
 
 
404 aa  167  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.804187  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19120  Tat-translocated enzyme/Dyp-type peroxidase family  37.67 
 
 
470 aa  164  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178161  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2284  Dyp-type peroxidase family  38.01 
 
 
399 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11720  Dyp-type peroxidase family  34.97 
 
 
440 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0976142  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1777  Dyp-type peroxidase family  34.77 
 
 
419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2163  Dyp-type peroxidase family  32.23 
 
 
435 aa  146  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804223  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3579  Dyp-type peroxidase family  33.33 
 
 
401 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.519759  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2788  Dyp-type peroxidase family protein  33.51 
 
 
406 aa  140  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00338158  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3078  dyp-type peroxidase  33.17 
 
 
430 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2590  Dyp-type peroxidase family protein  32.56 
 
 
408 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.656112  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1171  Dyp-type peroxidase family  31.55 
 
 
413 aa  133  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.244092 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31010  Dyp-type peroxidase family  34.03 
 
 
414 aa  127  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.173938  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04140  Dyp-type peroxidase family  33.33 
 
 
440 aa  116  6e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0253494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2002  Dyp-type peroxidase family protein  30.17 
 
 
381 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117545  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3387  putative iron-dependent peroxidase  34.38 
 
 
124 aa  69.3  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218209  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0050  Dyp-type peroxidase family protein  27.62 
 
 
481 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2360  putative Dyp-type peroxidase  24.48 
 
 
301 aa  54.7  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00056138  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3258  Dyp-type peroxidase  24.7 
 
 
316 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0389  Dyp-type peroxidase  27.17 
 
 
307 aa  53.1  0.000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.442459  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5414  Dyp-type peroxidase family protein  28.74 
 
 
353 aa  50.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.872456  normal  0.0333574 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1591  Dyp-type peroxidase family  26.88 
 
 
346 aa  50.1  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0949  Dyp-type peroxidase family protein  26.5 
 
 
312 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1729  tyrA protein  29.73 
 
 
302 aa  47.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0847  Dyp-type peroxidase family protein  24.55 
 
 
311 aa  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3143  peroxidase  26.29 
 
 
470 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1403  Dyp-type peroxidase  28.16 
 
 
359 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6426  Dyp-type peroxidase family protein  28.16 
 
 
359 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.353753  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0864  Dyp-type peroxidase family protein  28.26 
 
 
314 aa  47.4  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.746492  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0670  melanin biosynthesis protein TyrA, putative  25 
 
 
311 aa  47  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3343  Dyp-type peroxidase family protein  29.37 
 
 
313 aa  47  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0610  Dyp-type peroxidase family protein  29.37 
 
 
313 aa  47  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4860  Dyp-type peroxidase family protein  33.73 
 
 
323 aa  46.6  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445339  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2976  iron-dependent peroxidase-like protein  25.35 
 
 
470 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.675029 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>