More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0621 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  58.54 
 
 
898 aa  962    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0008  DNA mismatch repair protein MutS  50.94 
 
 
904 aa  785    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  43.45 
 
 
820 aa  684    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  58.33 
 
 
910 aa  966    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  58.54 
 
 
910 aa  962    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3599  DNA mismatch repair protein MutS  57.88 
 
 
908 aa  893    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1263  DNA mismatch repair protein MutS  58.18 
 
 
919 aa  931    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0902404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  49.04 
 
 
873 aa  682    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0030  DNA mismatch repair protein MutS  59.62 
 
 
915 aa  934    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355609 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  42.87 
 
 
891 aa  638    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6533  DNA mismatch repair protein MutS  71.24 
 
 
962 aa  1130    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948742  normal  0.317969 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  42.18 
 
 
804 aa  671    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0490  DNA mismatch repair protein MutS  59.46 
 
 
888 aa  968    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1218  DNA mismatch repair protein MutS  55.06 
 
 
875 aa  804    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.318661  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1299  DNA mismatch repair protein MutS  54.02 
 
 
914 aa  933    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.141225  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  79.53 
 
 
916 aa  1348    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  55.45 
 
 
876 aa  795    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2879  DNA mismatch repair protein MutS  54.95 
 
 
880 aa  801    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3541  DNA mismatch repair protein MutS  56.72 
 
 
929 aa  827    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0047  DNA mismatch repair protein MutS  59.41 
 
 
908 aa  941    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
905 aa  1768    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  79.13 
 
 
916 aa  1347    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0528  DNA mismatch repair protein MutS  62.13 
 
 
911 aa  988    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0799066  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3293  DNA mismatch repair protein MutS  49.09 
 
 
858 aa  710    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0310827  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  42.94 
 
 
804 aa  666    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  54.47 
 
 
877 aa  824    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0035  DNA mismatch repair protein MutS  62.56 
 
 
921 aa  965    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  60.32 
 
 
882 aa  984    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  49.83 
 
 
882 aa  657    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  80.16 
 
 
896 aa  1352    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0321  DNA mismatch repair protein MutS  60.33 
 
 
923 aa  987    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.784021  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  59.31 
 
 
907 aa  1001    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7101  DNA mismatch repair protein MutS  72.52 
 
 
929 aa  1130    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743761  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0513  DNA mismatch repair protein MutS  60.88 
 
 
907 aa  988    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0032  DNA mismatch repair protein MutS  59.96 
 
 
880 aa  946    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  55.4 
 
 
879 aa  837    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  51.14 
 
 
864 aa  712    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  56.64 
 
 
877 aa  834    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7642  DNA mismatch repair protein MutS  58.04 
 
 
910 aa  950    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.532158 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  57.94 
 
 
881 aa  956    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  58.9 
 
 
883 aa  956    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2326  DNA mismatch repair protein MutS  60.71 
 
 
925 aa  942    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160487 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  50.88 
 
 
904 aa  716    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3021  DNA mismatch repair protein MutS  54.21 
 
 
897 aa  795    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  55.73 
 
 
878 aa  826    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  43.03 
 
 
859 aa  626  1e-178  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  43.24 
 
 
868 aa  625  1e-177  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  43.44 
 
 
871 aa  617  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  44.75 
 
 
897 aa  617  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  42.76 
 
 
872 aa  618  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  41 
 
 
856 aa  616  1e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  41.89 
 
 
815 aa  613  9.999999999999999e-175  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  42.92 
 
 
880 aa  615  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  43.31 
 
 
854 aa  610  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  42.53 
 
 
855 aa  610  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  42.65 
 
 
855 aa  609  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  39.96 
 
 
869 aa  611  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  42.28 
 
 
869 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  41.74 
 
 
872 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  43.39 
 
 
854 aa  608  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  41.74 
 
 
870 aa  608  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  43 
 
 
884 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  43 
 
 
884 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  42.65 
 
 
855 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  38.67 
 
 
870 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  41.68 
 
 
870 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  42.91 
 
 
854 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  44.08 
 
 
859 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  45.57 
 
 
862 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  41.6 
 
 
860 aa  599  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  40.91 
 
 
872 aa  600  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  38.73 
 
 
873 aa  600  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  41.02 
 
 
859 aa  599  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  45.11 
 
 
878 aa  602  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  40.16 
 
 
871 aa  601  1e-170  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  40.04 
 
 
859 aa  599  1e-170  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  42.79 
 
 
852 aa  596  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  41.83 
 
 
881 aa  597  1e-169  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  41.75 
 
 
855 aa  596  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  41.11 
 
 
856 aa  598  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  42.49 
 
 
855 aa  598  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  41.11 
 
 
856 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  42.18 
 
 
855 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  40.49 
 
 
889 aa  595  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  42.18 
 
 
855 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  41.39 
 
 
861 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  40.76 
 
 
861 aa  595  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  42.18 
 
 
855 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  41.63 
 
 
861 aa  597  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  40.22 
 
 
863 aa  594  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  41.11 
 
 
856 aa  594  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  41.16 
 
 
858 aa  595  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  41.33 
 
 
856 aa  592  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  42.06 
 
 
855 aa  595  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  42.06 
 
 
855 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  40.58 
 
 
887 aa  593  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  41.59 
 
 
862 aa  594  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  41.28 
 
 
861 aa  595  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  40.66 
 
 
859 aa  593  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  39.64 
 
 
932 aa  591  1e-167  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>