66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1290 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3564  Carbohydrate-selective porin OprB  99.78 
 
 		 486 aa  916    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1290  Carbohydrate-selective porin OprB  100 
 
 		 492 aa  1000    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1436  Carbohydrate-selective porin OprB  93.1 
 
 		 481 aa  905    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3682  Carbohydrate-selective porin OprB  94.43 
 
 		 486 aa  899    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3373  carbohydrate-selective porin OprB  94.22 
 
 		 486 aa  898    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.389462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1274  carbohydrate-selective porin OprB  91.26 
 
 		 494 aa  909    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3871  Carbohydrate-selective porin OprB  61.84 
 
 		 484 aa  579  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0231495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3489  carbohydrate-selective porin OprB  61.62 
 
 		 493 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3797  Carbohydrate-selective porin OprB  61.62 
 
 		 484 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1366  Carbohydrate-selective porin OprB  29.56 
 
 		 461 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10870  hypothetical protein  29.82 
 
 		 434 aa  187  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00009778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0997  hypothetical protein  29.66 
 
 		 452 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1190  Carbohydrate-selective porin OprB  30.54 
 
 		 501 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1331  carbohydrate-selective porin OprB  29.26 
 
 		 510 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901069  hitchhiker  0.00588319 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5528  Carbohydrate-selective porin OprB  23.67 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703948  hitchhiker  0.0000405618 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2023  Carbohydrate-selective porin protein  24.88 
 
 		 477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0980968  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5080  Carbohydrate-selective porin  25.64 
 
 		 449 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66418  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5314  Carbohydrate-selective porin  23.72 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385247  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00490  regulator of pathogenicity factors  26.28 
 
 		 425 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3053  hypothetical protein  30.09 
 
 		 253 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0310931  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01615  regulator of pathogenicity factors  25.28 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00130056  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2033  Carbohydrate-selective porin OprB  24.23 
 
 		 417 aa  83.2  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3835  Carbohydrate-selective porin OprB  24.63 
 
 		 456 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.899229 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4912  Carbohydrate-selective porin OprB  24.63 
 
 		 456 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00363735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1115  Carbohydrate-selective porin OprB  23.21 
 
 		 476 aa  74.3  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.967056  normal  0.588415 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1632  putative porin B precursor outer (glucose porin) transmembrane protein  24.49 
 
 		 456 aa  72  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6851  hypothetical protein  25.82 
 
 		 208 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979562  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7680  porin B  22.28 
 
 		 464 aa  72.4  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00131365  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2771  carbohydrate-selective porin OprB  24.64 
 
 		 534 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2998  Carbohydrate-selective porin OprB  24.11 
 
 		 534 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1117  carbohydrate-selective porin OprB  21.98 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00415727  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23030  glucose/carbohydrate outer membrane porin OprB precursor  22.04 
 
 		 454 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0211738 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34960  glucose-sensitive porin  22.04 
 
 		 452 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000209451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2950  glucose-sensitive porin  21.8 
 
 		 452 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.393124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1943  outer membrane porin OprB precursor  21.8 
 
 		 454 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1296  porin B  20.74 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.329329  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2894  Carbohydrate-selective porin OprB  22.88 
 
 		 509 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3953  carbohydrate-selective porin OprB  23.45 
 
 		 488 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268403  normal  0.112791 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3558  carbohydrate-selective porin OprB  23.8 
 
 		 534 aa  59.3  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4205  carbohydrate-selective porin OprB  21.95 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2969  carbohydrate-selective porin OprB  23.6 
 
 		 480 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1821  Carbohydrate-selective porin OprB  21.56 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2351  carbohydrate-selective porin OprB  24.93 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.348926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2957  carbohydrate-selective porin OprB  24.43 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  normal  0.40455 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4737  Carbohydrate-selective porin OprB  23.47 
 
 		 502 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0100904  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3570  carbohydrate-selective porin OprB  24.08 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4576  carbohydrate-selective porin OprB  23.79 
 
 		 453 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2869  Carbohydrate-selective porin OprB  22.28 
 
 		 490 aa  54.7  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.206481 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1017  carbohydrate-selective porin OprB  21.88 
 
 		 447 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.134295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2204  carbohydrate-selective porin OprB  23.8 
 
 		 422 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1597  carbohydrate-selective porin OprB  23.02 
 
 		 480 aa  53.5  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0966255  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0854  Carbohydrate-selective porin OprB  22.28 
 
 		 485 aa  53.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.648225 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4004  carbohydrate-selective porin OprB  22.64 
 
 		 483 aa  53.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.208066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4200  Carbohydrate-selective porin OprB  23.28 
 
 		 482 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1057  carbohydrate-selective porin OprB  21.63 
 
 		 447 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1019  porin B  21.63 
 
 		 447 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1384  carbohydrate-selective porin OprB  24.59 
 
 		 490 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2711  carbohydrate-selective porin OprB  23.28 
 
 		 417 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.695739  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4227  carbohydrate-selective porin OprB  23.16 
 
 		 498 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796044  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5436  carbohydrate-selective porin, OprB family  31.58 
 
 		 446 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.390026  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0904  Carbohydrate-selective porin OprB  21.88 
 
 		 481 aa  47.8  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0673705 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4831  Carbohydrate-selective porin OprB  22.12 
 
 		 507 aa  47.4  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0156749  normal  0.100608 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1380  Carbohydrate-selective porin OprB  22.94 
 
 		 522 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.768391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1659  Carbohydrate-selective porin OprB  24.11 
 
 		 490 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2528  Carbohydrate-selective porin OprB  23.51 
 
 		 502 aa  45.8  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.310329 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5422  carbohydrate-selective porin OprB  22.66 
 
 		 493 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585602  normal  0.389505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>