More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1556 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  100 
 
 		 422 aa  822    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0083  major facilitator superfamily transporter  68.83 
 
 		 423 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0613  major facilitator superfamily transporter  69.14 
 
 		 422 aa  494  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0039  major facilitator superfamily transporter  67.41 
 
 		 420 aa  490  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19043 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0059  major facilitator transporter  67.45 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0055  major facilitator superfamily MFS_1  67.07 
 
 		 415 aa  471  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.628299  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2012  major facilitator transporter  63.97 
 
 		 421 aa  448  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147119 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  52.75 
 
 		 420 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  52.03 
 
 		 440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  47.56 
 
 		 411 aa  339  5e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  46.02 
 
 		 417 aa  327  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  45.91 
 
 		 420 aa  322  8e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  43.88 
 
 		 411 aa  314  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1885  major facilitator transporter  47.47 
 
 		 402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2519  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 414 aa  196  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  33.84 
 
 		 394 aa  176  6e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 396 aa  171  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4393  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 403 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2034  major facilitator superfamily MFS_1  34.69 
 
 		 419 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1566  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 405 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3708  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 405 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0689  major facilitator superfamily permease  33.58 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  25.26 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  25.26 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  25.09 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  22.92 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 449 aa  76.3  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  23.65 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  23.65 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  23.76 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  23.76 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  23.4 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  23.4 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  23.4 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  25.27 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0600  fosmidomycin resistance protein  23.39 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0539  fosmidomycin resistance protein  23.39 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0541  fosmidomycin resistance protein  24.37 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.404971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0546  fosmidomycin resistance protein  23.39 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.268965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0556  fosmidomycin resistance protein  23.39 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.809506 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  25.89 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0751  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3645  major facilitator transporter  28.94 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  27.84 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3531  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 		 437 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6429  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.64 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  32.64 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  24.91 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  24.81 
 
 		 401 aa  67  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  29.03 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 412 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  28.12 
 
 		 390 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1326  major facilitator transporter  23.87 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686197  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1603  major facilitator superfamily MFS_1  21.87 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1365  major facilitator transporter  23.87 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 449 aa  63.2  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2568  major facilitator superfamily MFS_1  31.95 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0290  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3799  fosmidomycin resistance protein  29.11 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1702  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 473 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254486  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2458  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  24.37 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  26.64 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3913  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>