More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0736 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0736  tyrosine kinase  100 
 
 
315 aa  640    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2732  tyrosine kinase  60.42 
 
 
303 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0677811 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2365  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  58.28 
 
 
306 aa  358  7e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1879  protein-tyrosine kinase  44.16 
 
 
299 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.503057  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0244  protein-tyrosine kinase  40.94 
 
 
309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1377  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  41.09 
 
 
300 aa  203  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2024  protein-tyrosine kinase  37.33 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.607078  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1793  hypothetical protein  39.19 
 
 
296 aa  189  5e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.677381  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0150  hypothetical protein  38.55 
 
 
289 aa  186  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.04 
 
 
225 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  33.01 
 
 
225 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  32.52 
 
 
225 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  30.1 
 
 
464 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  34.8 
 
 
719 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  34.8 
 
 
719 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  34.8 
 
 
719 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  34.8 
 
 
719 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  33.18 
 
 
496 aa  122  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  34.8 
 
 
719 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  31.55 
 
 
257 aa  122  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  31.07 
 
 
225 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  32.69 
 
 
724 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  30.58 
 
 
225 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  34.31 
 
 
720 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  32.59 
 
 
721 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  34.98 
 
 
790 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 
720 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  33.33 
 
 
720 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  33.33 
 
 
720 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  33.33 
 
 
720 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  33.33 
 
 
720 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  33.64 
 
 
734 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  33.33 
 
 
720 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  33.5 
 
 
454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  33.33 
 
 
720 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  32.84 
 
 
720 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5844  protein-tyrosine kinase  35.29 
 
 
780 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.39 
 
 
217 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  31.92 
 
 
745 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.78 
 
 
230 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.78 
 
 
230 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  29.9 
 
 
217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  30.58 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  30.1 
 
 
233 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  30.58 
 
 
233 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.92 
 
 
240 aa  113  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.56 
 
 
220 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.07 
 
 
234 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  36.93 
 
 
745 aa  112  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  32.66 
 
 
759 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  29.61 
 
 
233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0141  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.94 
 
 
228 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  29.61 
 
 
233 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0136  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.94 
 
 
228 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  32.09 
 
 
724 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  33.33 
 
 
740 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  27.8 
 
 
232 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  31.6 
 
 
802 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  32.39 
 
 
716 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  34.2 
 
 
753 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2153  capsular exopolysaccharide family  36.27 
 
 
713 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428306  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  31.55 
 
 
585 aa  110  4.0000000000000004e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  29.9 
 
 
474 aa  110  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4101  hypothetical protein  34.09 
 
 
722 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.965422  normal  0.2163 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  31.37 
 
 
779 aa  109  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  33.81 
 
 
246 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  33.33 
 
 
747 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  32.06 
 
 
667 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  31.37 
 
 
723 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  33.5 
 
 
221 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  33.16 
 
 
767 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  32.81 
 
 
746 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  33.66 
 
 
756 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  32.08 
 
 
721 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  34.38 
 
 
753 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  29.28 
 
 
790 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  30.39 
 
 
730 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  31.36 
 
 
615 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  31.25 
 
 
726 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  30.05 
 
 
509 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  32.68 
 
 
735 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.09 
 
 
736 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  33.65 
 
 
736 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  27.96 
 
 
730 aa  106  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  30.81 
 
 
239 aa  106  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  31.53 
 
 
723 aa  105  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  35.67 
 
 
739 aa  105  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.37 
 
 
720 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  31.55 
 
 
747 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  34.2 
 
 
734 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  32.32 
 
 
731 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 
743 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  31.55 
 
 
747 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  33.02 
 
 
722 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  34.2 
 
 
751 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  31.92 
 
 
472 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5359  protein-tyrosine kinase  35.03 
 
 
800 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  34.74 
 
 
508 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  32.52 
 
 
755 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0800  hypothetical protein  33.67 
 
 
721 aa  102  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>