More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0476 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2674  quinoprotein ethanol dehydrogenase  70.99 
 
 
631 aa  869    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1339  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  53.57 
 
 
587 aa  640    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38566  normal  0.435914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1540  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  53.57 
 
 
587 aa  640    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3312  quinoprotein alcohol dehydrogenase  69.21 
 
 
623 aa  883    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4873  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  53.25 
 
 
587 aa  635    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.0810929 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3129  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  70.99 
 
 
631 aa  869    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957958  normal  0.28425 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0693  Pyrrolo-quinoline quinone  56.68 
 
 
579 aa  637    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804984  normal  0.410128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3089  Pyrrolo-quinoline quinone  70.99 
 
 
631 aa  869    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1957  Pyrrolo-quinoline quinone  70.16 
 
 
620 aa  879    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0809644  normal  0.548455 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38860  quinoprotein alcohol dehydrogenase  69.21 
 
 
623 aa  876    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0476  quinoprotein alcohol dehydrogenase  100 
 
 
618 aa  1264    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0260666 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2817  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  55.57 
 
 
602 aa  650    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2409  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  54.71 
 
 
589 aa  632  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13814  normal  0.848808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3624  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  53.77 
 
 
579 aa  630  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214303  hitchhiker  0.00920421 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1023  Pyrrolo-quinoline quinone  54.42 
 
 
593 aa  624  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3124  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  50.88 
 
 
595 aa  618  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0497789  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2679  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  50.88 
 
 
595 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1963  Pyrrolo-quinoline quinone  50.72 
 
 
591 aa  616  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0160229  normal  0.256272 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3084  Pyrrolo-quinoline quinone  50.56 
 
 
595 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2729  Pyrrolo-quinoline quinone  50.96 
 
 
602 aa  604  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556411  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1784  Pyrrolo-quinoline quinone  52.98 
 
 
580 aa  600  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0473  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  52.75 
 
 
580 aa  600  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0101481 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2673  quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  51.09 
 
 
588 aa  592  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0513715  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1887  quinoprotein alcohol dehydrogenase  50.41 
 
 
587 aa  594  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186722  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2255  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  49.76 
 
 
588 aa  594  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217629  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1811  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  51.7 
 
 
582 aa  591  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177841 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1855  Pyrrolo-quinoline quinone  49.76 
 
 
587 aa  587  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.668201  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2100  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  51.69 
 
 
584 aa  578  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6242  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  51.43 
 
 
597 aa  577  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0726  Pyrrolo-quinoline quinone  52.21 
 
 
549 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0623502 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2494  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  51.35 
 
 
584 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295659  normal  0.19306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5964  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  38.4 
 
 
554 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206262  normal  0.383589 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5155  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  36.61 
 
 
573 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.843195 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0306  putative alcohol dehydrogenase  36.92 
 
 
575 aa  345  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100044  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3242  Pyrrolo-quinoline quinone  36.61 
 
 
573 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00434002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5126  Pyrrolo-quinoline quinone  36.61 
 
 
573 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5895  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  37.09 
 
 
575 aa  333  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136104  normal  0.867214 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6162  Pyrrolo-quinoline quinone  36.75 
 
 
575 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114811  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7192  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  36.28 
 
 
575 aa  331  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.426546  normal  0.582027 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  38.03 
 
 
570 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1591  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  36.05 
 
 
583 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.890828  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3639  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  37.13 
 
 
566 aa  327  4.0000000000000003e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347084  normal  0.430241 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0379  Pyrrolo-quinoline quinone  38.47 
 
 
727 aa  327  5e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5972  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  36.3 
 
 
575 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0151209 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3352  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  38.57 
 
 
707 aa  325  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32899  normal  0.291074 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2870  Pyrrolo-quinoline quinone  37.52 
 
 
705 aa  323  6e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489222  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  37.31 
 
 
726 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0341  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  35.12 
 
 
562 aa  312  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.409253  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0877  alcohol dehydrogenase large subunit  37.39 
 
 
720 aa  309  9e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0299  methanol dehydrogenase protein, large subunit, putative  36.17 
 
 
619 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0065801  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2451  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  35.28 
 
 
576 aa  306  9.000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1461  Pyrrolo-quinoline quinone  36.9 
 
 
718 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153207  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0363  putative alcohol dehydrogenase precursor  34.9 
 
 
572 aa  301  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3106  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  37.12 
 
 
606 aa  301  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5302  Pyrrolo-quinoline quinone  35.3 
 
 
721 aa  300  7e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178096  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3040  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  38.06 
 
 
608 aa  299  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.520136  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5018  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  37.1 
 
 
697 aa  299  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4160  Pyrrolo-quinoline quinone:cytochrome c, class I  35.15 
 
 
718 aa  297  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110436  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3601  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  36.97 
 
 
724 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2017  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  33.28 
 
 
592 aa  296  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.115973  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6351  Pyrrolo-quinoline quinone  37.33 
 
 
604 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.346402  normal  0.871662 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0700  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  35.91 
 
 
613 aa  295  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5136  Pyrrolo-quinoline quinone  35.44 
 
 
709 aa  293  5e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.388908  normal  0.506379 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0721  Pyrrolo-quinoline quinone  34.58 
 
 
702 aa  293  6e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760072 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0427  Pyrrolo-quinoline quinone  34.92 
 
 
706 aa  293  6e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.196079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3110  Pyrrolo-quinoline quinone  37.61 
 
 
726 aa  293  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5502  putative alcohol dehydrogenase  34.07 
 
 
712 aa  293  8e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210225  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4972  Pyrrolo-quinoline quinone  36.67 
 
 
608 aa  293  8e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.779778  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2355  Pyrrolo-quinoline quinone  37.08 
 
 
730 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0680369  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3387  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  36.2 
 
 
601 aa  291  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6478  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  36.18 
 
 
606 aa  290  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.975384  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0262  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  33.33 
 
 
737 aa  290  6e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0206165  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1781  Pyrrolo-quinoline quinone  36.2 
 
 
601 aa  289  9e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.981644  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1001  Pyrrolo-quinoline quinone  35.73 
 
 
698 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.132908 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1306  Pyrrolo-quinoline quinone  33.83 
 
 
738 aa  287  5e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0575142 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2427  methanol dehydrogenase-like protein (xoxF)  35.51 
 
 
605 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0410852  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5968  methanol dehydrogenase large subunit  35.19 
 
 
601 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366255  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4686  Pyrrolo-quinoline quinone  36.61 
 
 
607 aa  284  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.829526 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2790  Pyrrolo-quinoline quinone  35.33 
 
 
615 aa  282  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3393  putative methanol dehydrogenase protein, large subunit  36.07 
 
 
606 aa  280  5e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.078697  normal  0.0119159 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1587  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  36.89 
 
 
601 aa  280  8e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3937  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  34.78 
 
 
580 aa  279  9e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.79845 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0779  methanol dehydrogenase protein, large subunit  34.75 
 
 
601 aa  278  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0879687  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2578  putative PQQ dehydrogenase protein  36.2 
 
 
600 aa  277  4e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0476  quinoprotein glucose dehydrogenase  34 
 
 
600 aa  276  5e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2260  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  33.38 
 
 
601 aa  277  5e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  36.2 
 
 
600 aa  277  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0020  Pyrrolo-quinoline quinone  35.12 
 
 
600 aa  276  7e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3943  Pyrrolo-quinoline quinone  35.33 
 
 
601 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237421  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1945  Pyrrolo-quinoline quinone  35.56 
 
 
600 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.188003  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5444  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  34.56 
 
 
599 aa  273  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2994  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  34.84 
 
 
613 aa  273  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0170734 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4210  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.96 
 
 
627 aa  272  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719388  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0099  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  35.63 
 
 
605 aa  272  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.850532  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4632  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  36.99 
 
 
626 aa  272  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.271906 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4518  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  36.9 
 
 
626 aa  272  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.966685  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4150  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  36.9 
 
 
626 aa  272  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383489  normal  0.812853 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0421  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  33.95 
 
 
590 aa  270  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2344  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  36.7 
 
 
611 aa  270  5e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5752  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.02 
 
 
599 aa  270  7e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0649397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>