287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0102 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0102  outer membrane related peptidoglycan-associated lipoprotein  100 
 
 		 214 aa  419  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207037  normal  0.26967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1793  OmpA/MotB  42.94 
 
 		 156 aa  98.2  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.557894 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2800  OmpA/MotB domain-containing protein  52.46 
 
 		 177 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.705658  normal  0.415796 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2055  OmpA/MotB domain-containing protein  52.38 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0263919  normal  0.321427 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1878  OmpA/MotB domain protein  52.38 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2987  OmpA/MotB domain-containing protein  52.08 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.221024  normal  0.129145 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3940  OmpA/MotB domain-containing protein  51.02 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0125128  normal  0.230028 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  50 
 
 		 531 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  47.96 
 
 		 532 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  48.98 
 
 		 532 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  48.98 
 
 		 532 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  50 
 
 		 535 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  50 
 
 		 535 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  48.42 
 
 		 517 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  48.42 
 
 		 525 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  48.42 
 
 		 525 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  47.96 
 
 		 532 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  46.88 
 
 		 538 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  48.42 
 
 		 517 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  48.42 
 
 		 525 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  48.42 
 
 		 517 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3709  OmpA/MotB domain protein  46.94 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  47.37 
 
 		 525 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  46.88 
 
 		 544 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  47.37 
 
 		 525 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  47.92 
 
 		 557 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2357  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.96 
 
 		 842 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131798  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4148  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.24 
 
 		 560 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3552  OmpA/MotB  47.92 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237192  normal  0.244916 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2121  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  53.73 
 
 		 823 aa  62.4  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.475646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  35.9 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  31.62 
 
 		 586 aa  59.7  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  33.56 
 
 		 558 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  35.53 
 
 		 533 aa  57.4  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1412  OmpA/MotB domain-containing protein  39.6 
 
 		 321 aa  57  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.166227  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  41.33 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  38.67 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  32.05 
 
 		 374 aa  55.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  38.67 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  34.52 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  32.38 
 
 		 334 aa  55.5  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  33.33 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  33.64 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  34.21 
 
 		 537 aa  55.1  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  29.91 
 
 		 537 aa  55.1  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  30.4 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  32.89 
 
 		 533 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  37.66 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  35.9 
 
 		 261 aa  54.3  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1973  OmpA/MotB domain-containing protein  35.44 
 
 		 311 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  30.4 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  30.4 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  27.93 
 
 		 510 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  31.43 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  30 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  33.66 
 
 		 364 aa  53.1  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  40.26 
 
 		 270 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  30.59 
 
 		 594 aa  53.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  30 
 
 		 261 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  31.43 
 
 		 247 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  31.43 
 
 		 240 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  34.02 
 
 		 321 aa  52.8  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  31.43 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  31.43 
 
 		 236 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1976  OmpA/MotB domain protein  36.49 
 
 		 331 aa  52  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0825703  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  32.1 
 
 		 330 aa  52.4  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  31.91 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  35.53 
 
 		 670 aa  52  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0131  OmpA family protein  29.45 
 
 		 542 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  29.06 
 
 		 525 aa  52  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  34.97 
 
 		 229 aa  52  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  36.25 
 
 		 331 aa  52  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1604  OmpA family protein  34.95 
 
 		 558 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395642  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0155  OmpA family protein  34.95 
 
 		 558 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  30.4 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  27.83 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  27.83 
 
 		 427 aa  51.6  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  34.83 
 
 		 260 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  31.58 
 
 		 653 aa  51.6  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  28.95 
 
 		 631 aa  51.2  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  42.67 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  37.97 
 
 		 543 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  30.4 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  40.54 
 
 		 386 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  34.02 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  26.67 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  31.58 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  40.54 
 
 		 386 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  32.11 
 
 		 1313 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  29.2 
 
 		 641 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2585  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 310 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 		 409 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  30.4 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3415  OmpA/MotB domain-containing protein  29.47 
 
 		 420 aa  50.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  33.59 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  29.6 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.19 
 
 		 542 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  31.25 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4535  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  36.44 
 
 		 169 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  34.83 
 
 		 712 aa  50.1  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>