145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2465 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2465  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 345 aa  679    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1259  protein of unknown function UPF0118  59.05 
 
 		 345 aa  396  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.324845  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2612  protein of unknown function UPF0118  34.12 
 
 		 363 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.751344  normal  0.787744 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0113  hypothetical protein  29.2 
 
 		 346 aa  158  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0968389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1366  hypothetical protein  27.59 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  25.89 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  25.08 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  24.01 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  25.61 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  25.89 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  22.83 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0862  hypothetical protein  26.44 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0445  hypothetical protein  22.54 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000355219  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  24.15 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  22.73 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  22.65 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  28.28 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1144  protein of unknown function UPF0118  26.4 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.158987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2097  protein of unknown function UPF0118  24.44 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.987772  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  26.29 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  31.09 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  26.59 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  21.17 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0738  acid membrane antigen A  24.7 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.444287  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  23.32 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  23.89 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3764  protein of unknown function UPF0118  23.94 
 
 		 376 aa  57  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0574  hypothetical protein  21.85 
 
 		 321 aa  57  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.877456  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  25.15 
 
 		 353 aa  57  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0336  hypothetical protein  21.25 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000639163  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  28.91 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4118  hypothetical protein  24.73 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00655828  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3672  hypothetical protein  29.81 
 
 		 396 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00326083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  23.6 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4193  hypothetical protein  24.73 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.662681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4349  hypothetical protein  24.73 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  25.86 
 
 		 383 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  28.06 
 
 		 365 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  26.26 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4237  protein of unknown function UPF0118  27.78 
 
 		 350 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  25.58 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  29.57 
 
 		 384 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  29.44 
 
 		 345 aa  52.8  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  24.39 
 
 		 394 aa  52.8  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1677  hypothetical protein  28.49 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.696772  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  28.3 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0472  acid membrane antigen A  25.22 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3044  hypothetical protein  27.31 
 
 		 398 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11122  hypothetical protein  24.09 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  24.46 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  21.25 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2679  hypothetical protein  29.68 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  21.01 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  23.68 
 
 		 334 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3486  hypothetical protein  22.88 
 
 		 375 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  20.11 
 
 		 353 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2741  hypothetical protein  23.92 
 
 		 369 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  27.52 
 
 		 415 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1326  hypothetical protein  22.39 
 
 		 354 aa  50.4  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1581  protein of unknown function UPF0118  26.29 
 
 		 341 aa  50.8  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0769558 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  24.48 
 
 		 346 aa  50.4  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  20.96 
 
 		 355 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5011  protein of unknown function UPF0118  23.48 
 
 		 359 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.022243  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  22.83 
 
 		 349 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1843  hypothetical protein  24.71 
 
 		 383 aa  50.1  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2944  hypothetical protein  21.43 
 
 		 368 aa  49.7  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.81591  decreased coverage  0.00297728 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1671  hypothetical protein  25.34 
 
 		 334 aa  49.7  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  25.21 
 
 		 361 aa  49.7  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  20.12 
 
 		 354 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1564  putative transmembrane transport protein  26.29 
 
 		 406 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0215  hypothetical protein  26.29 
 
 		 406 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  25.82 
 
 		 367 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3181  hypothetical protein  24.04 
 
 		 419 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  26.57 
 
 		 353 aa  49.3  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  29.25 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  21.19 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1300  protein of unknown function UPF0118  29.75 
 
 		 345 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316018  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  27.93 
 
 		 397 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1711  hypothetical protein  27.78 
 
 		 336 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  20.45 
 
 		 353 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1881  hypothetical protein  29.31 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000322257  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4645  hypothetical protein  40 
 
 		 396 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  23.22 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  23.22 
 
 		 352 aa  48.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0751  hypothetical protein  22.15 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2069  hypothetical protein  42.59 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0264155 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  21.96 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06643  hypothetical protein  26.18 
 
 		 365 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4551  hypothetical protein  23.78 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0235388 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  20.4 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  26.77 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  29.27 
 
 		 358 aa  47.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  21.94 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2819  hypothetical protein  24 
 
 		 369 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2910  hypothetical protein  24.64 
 
 		 369 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0191  hypothetical protein  26.98 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  25.4 
 
 		 355 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1738  putative inner membrane protein  21.07 
 
 		 367 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2597  putative inner membrane protein  21.21 
 
 		 365 aa  47.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1844  putative inner membrane protein  21.07 
 
 		 367 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>