85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8770 on replicon NC_011893
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011893  Mnod_8770  response regulator receiver protein  100 
 
 		 138 aa  279  7.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.997367  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1433  response regulator receiver protein  83.33 
 
 		 138 aa  238  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0093  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  30.17 
 
 		 812 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.24 
 
 		 943 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3745  response regulator receiver domain-containing protein  30.08 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0861  response regulator receiver protein  27.19 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0503153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0388  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.43 
 
 		 793 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.7 
 
 		 743 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1998  response regulator receiver protein  29.27 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000230643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2289  response regulator receiver protein  28.91 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  32.29 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  29.27 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  30.08 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.24 
 
 		 949 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4683  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  28.24 
 
 		 949 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1727  response regulator receiver  28.23 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0248964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2334  response regulator receiver  29.31 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0685092  normal  0.85818 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4749  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 		 781 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.872225  normal  0.641352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2613  response regulator receiver protein  29.31 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4170  response regulator receiver  32.69 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  30 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4539  response regulator receiver protein  32.69 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4331  response regulator receiver protein  30 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.095217 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4830  response regulator receiver protein  27.87 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.071515 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 		 522 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 		 1631 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1391  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405222  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3015  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.72 
 
 		 762 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3624  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.69 
 
 		 689 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.800994 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 		 807 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3325  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1267  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 542 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2719  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0959171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 		 1651 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4296  response regulator receiver  34.41 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  29.67 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 		 927 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2946  response regulator receiver  29.55 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 		 705 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 		 1036 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5217  response regulator receiver protein  28.1 
 
 		 118 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0686971  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 		 905 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 122 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1394  two component AraC family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 523 aa  41.6  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042226  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5952  response regulator receiver protein  28.1 
 
 		 118 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0493294  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.89 
 
 		 661 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 		 789 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0976  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351318  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3584  sensory box histidine kinase/response regulator  30.43 
 
 		 646 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6214  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.64 
 
 		 772 aa  41.2  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.459564 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2375  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 		 766 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0043  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0842812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3474  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.790484 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0906  response regulator receiver protein  25 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4515  response regulator receiver domain-containing protein  28.93 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.403365  normal  0.643653 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3276  response regulator receiver  28.81 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4356  response regulator receiver  28.93 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00220083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3600  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4630  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.6 
 
 		 845 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2716  response regulator  26.56 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2450  PAS  28.57 
 
 		 676 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154072 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  28.46 
 
 		 646 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3596  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.81 
 
 		 926 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 		 789 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 		 789 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  32.5 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1143  response regulator receiver domain-containing protein  28.93 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6764  putative two-component response regulator  29.35 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2816  response regulator receiver protein  25.98 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101903  normal  0.104606 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2750  response regulator receiver protein  27.05 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000684047  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3746  chemotaxis response regulator  28.8 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.193057  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 		 588 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0474386 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 		 589 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5111  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 		 589 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0781  response regulator receiver domain-containing protein  28.93 
 
 		 119 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.394955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3331  response regulator receiver protein  24.3 
 
 		 124 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>