More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8462 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6982  phthalate 4,5-dioxygenase  70.44 
 
 
438 aa  665    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2268  Rieske (2Fe-2S) protein  79.2 
 
 
452 aa  771    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0946291  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  69.04 
 
 
440 aa  664    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  80.86 
 
 
452 aa  776    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
448 aa  930    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1175  Phthalate 4,5-dioxygenase  78.76 
 
 
452 aa  772    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.769494  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  60.41 
 
 
437 aa  567  1e-160  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2133  twin-arginine translocation pathway signal  55.51 
 
 
484 aa  501  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.395399  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3201  phthalate 4,5-dioxygenase  37.76 
 
 
436 aa  260  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5781  Rieske (2Fe-2S) region  38.56 
 
 
417 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3537  aromatic acid dioxygenase alpha subunit  34.05 
 
 
440 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5548  putative Phthalate 4,5-dioxygenase subunit alpha  33.64 
 
 
439 aa  223  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2370  putative phthalate 4,5-dioxygenase oxygenase subunit (OhpA2)  33.73 
 
 
440 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000399664  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0574  phthalate 4,5-dioxygenase  34.25 
 
 
406 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105836  normal  0.217979 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  34.51 
 
 
431 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.021682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3529  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.22 
 
 
433 aa  203  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551503  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4882  phthalate 4,5-dioxygenase  34.4 
 
 
422 aa  203  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3532  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.84 
 
 
446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048657  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7254  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.44 
 
 
430 aa  196  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0555  phthalate 4,5-dioxygenase  33.17 
 
 
470 aa  193  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547165  normal  0.18525 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.68 
 
 
410 aa  192  9e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4805  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.58 
 
 
443 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495821  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1910  phthalate 4,5-dioxygenase, oxygenase subunit  33.49 
 
 
438 aa  190  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.578876  normal  0.581965 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2779  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.55 
 
 
443 aa  187  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4958  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.55 
 
 
443 aa  187  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.879177  normal  0.275764 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.31 
 
 
449 aa  186  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2928  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.43 
 
 
445 aa  186  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.149906  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4297  phthalate 4,5-dioxygenase  32.27 
 
 
392 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5678  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.34 
 
 
408 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000120872  normal  0.0293014 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.34 
 
 
408 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00683325  hitchhiker  0.00740172 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1044  phthalate 4,5-dioxygenase  30.05 
 
 
454 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.714091 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4881  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.3 
 
 
434 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4627  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.68 
 
 
417 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1473  Rieske (2Fe-2S) region  31.67 
 
 
398 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.826795  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4795  phthalate 4,5-dioxygenase  30.65 
 
 
412 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6324  phthalate 4,5-dioxygenase  30.27 
 
 
437 aa  161  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.17 
 
 
519 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1001  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.85 
 
 
380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.85 
 
 
358 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.5 
 
 
327 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.07 
 
 
364 aa  99.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  29.7 
 
 
334 aa  99  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  36.81 
 
 
356 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  29.5 
 
 
315 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.37 
 
 
450 aa  94.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  32.53 
 
 
345 aa  93.6  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  30.73 
 
 
380 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.52 
 
 
356 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643695  normal  0.0193847 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.52 
 
 
356 aa  89.7  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3570  Rieske (2Fe-2S) region  25.71 
 
 
355 aa  89.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0161982  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0595  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.14 
 
 
355 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0958903  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.14 
 
 
355 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1336  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.14 
 
 
355 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2494  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.14 
 
 
355 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1234  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.14 
 
 
355 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  24.22 
 
 
363 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50613  Tic55 component of chloroplast import machinery  31.5 
 
 
498 aa  89  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1307  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.14 
 
 
355 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992701  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5591  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.34 
 
 
356 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3658  Rieske (2Fe-2S) region  25.07 
 
 
356 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0319  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.14 
 
 
355 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.07 
 
 
356 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.25 
 
 
367 aa  88.2  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.22 
 
 
321 aa  87.4  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1501  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.14 
 
 
355 aa  87.8  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.22 
 
 
324 aa  87.4  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.46 
 
 
364 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.24 
 
 
356 aa  87  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1105  Rieske (2Fe-2S) protein  24.38 
 
 
358 aa  86.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.080608  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.53 
 
 
338 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  35.77 
 
 
376 aa  86.3  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.53 
 
 
362 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0547  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.73 
 
 
324 aa  84.7  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000394367  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0576  Rieske (2Fe-2S) region  39.29 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0622  putative Rieske (2Fe-2S) protein  39.13 
 
 
314 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0948094 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  26.53 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  30.46 
 
 
492 aa  82.8  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1056  Rieske (2Fe-2S) region  38.84 
 
 
499 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144994  hitchhiker  0.000116875 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4233  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.5 
 
 
362 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  31.47 
 
 
359 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.19 
 
 
353 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5126  vanillate monooxygenase  27.63 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1872  Rieske (2Fe-2S) protein  32.56 
 
 
356 aa  81.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.62 
 
 
450 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.62 
 
 
450 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2500  Rieske (2Fe-2S) region  38.26 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.455012 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0418  Rieske (2Fe-2S) protein  27.19 
 
 
353 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.842278  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  32.17 
 
 
355 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4419  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  32.03 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1535  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.88 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  30.96 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.09 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0436  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.21 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  32.54 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4642  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.82 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.0329483 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  42.06 
 
 
352 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4510  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.82 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0741  Rieske (2Fe-2S) protein  31.22 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0606248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1541  vanillate monooxygenase  30.06 
 
 
423 aa  80.1  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00031597  hitchhiker  0.00167065 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
352 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>