More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8226 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8226  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 515 aa  1015    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198543  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6162  AMP-dependent synthetase and ligase  38.32 
 
 		 487 aa  273  5.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2687  putative long-chain-fatty-acid CoA ligase  39.34 
 
 		 503 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.714201 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  36.49 
 
 		 526 aa  270  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  35.5 
 
 		 506 aa  263  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  34.02 
 
 		 519 aa  259  8e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  34.02 
 
 		 519 aa  259  9e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  37.43 
 
 		 534 aa  257  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  34.99 
 
 		 506 aa  256  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 		 517 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 		 525 aa  256  7e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  33.85 
 
 		 539 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2245  AMP-dependent synthetase and ligase  38.24 
 
 		 519 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00923204  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3284  AMP-dependent synthetase and ligase  37.27 
 
 		 510 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  37.1 
 
 		 507 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2461  AMP-dependent synthetase and ligase  37.28 
 
 		 504 aa  254  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0631  malonyl-CoA synthase  32.66 
 
 		 507 aa  250  6e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  33.13 
 
 		 504 aa  249  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  35.16 
 
 		 565 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 		 515 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6175  AMP-dependent synthetase and ligase  36.85 
 
 		 537 aa  247  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  33.78 
 
 		 511 aa  247  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  35.53 
 
 		 517 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  34.5 
 
 		 506 aa  246  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  35.25 
 
 		 507 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  35.52 
 
 		 503 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  37.15 
 
 		 515 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  36.06 
 
 		 516 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0653  AMP-dependent synthetase and ligase  37.82 
 
 		 524 aa  243  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5134  acyl-CoA synthetase / AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 		 517 aa  243  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.93936 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  35.11 
 
 		 503 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2794  malonyl-CoA synthase  32.66 
 
 		 517 aa  242  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.71549  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  35.23 
 
 		 515 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 		 530 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  33.68 
 
 		 504 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 		 504 aa  240  5e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0632  AMP-dependent synthetase and ligase  36.97 
 
 		 532 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  36.27 
 
 		 518 aa  239  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  32.86 
 
 		 662 aa  239  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  35.95 
 
 		 506 aa  239  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  33.06 
 
 		 504 aa  239  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  33.33 
 
 		 536 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.65 
 
 		 525 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0700  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 		 505 aa  238  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.232219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  33.81 
 
 		 510 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.14 
 
 		 512 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  35.05 
 
 		 508 aa  238  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  35.57 
 
 		 530 aa  237  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 		 516 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4353  AMP-dependent synthetase and ligase  34.84 
 
 		 517 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  35.83 
 
 		 508 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  34.15 
 
 		 520 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4968  AMP-dependent synthetase and ligase  37.34 
 
 		 489 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.88 
 
 		 525 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 		 511 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 		 502 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  34.02 
 
 		 504 aa  233  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6394  AMP-dependent synthetase and ligase  34.34 
 
 		 517 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178832  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  36.04 
 
 		 520 aa  233  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  35.51 
 
 		 503 aa  232  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1293  malonyl-CoA synthase  35.17 
 
 		 510 aa  231  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112545 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  34.65 
 
 		 517 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  34.65 
 
 		 517 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  36.16 
 
 		 5154 aa  231  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  35.4 
 
 		 505 aa  231  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  34.42 
 
 		 509 aa  230  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2102  AMP-dependent synthetase and ligase  34.89 
 
 		 508 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0103698  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3834  malonyl-CoA synthase  33.6 
 
 		 504 aa  230  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610168  normal  0.151644 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4499  AMP-dependent synthetase and ligase  35.9 
 
 		 494 aa  230  6e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.927408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  32.26 
 
 		 495 aa  230  6e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4412  AMP-dependent synthetase and ligase  35.9 
 
 		 494 aa  230  6e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  34.93 
 
 		 501 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  33.95 
 
 		 511 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3271  AMP-dependent synthetase and ligase  36.64 
 
 		 508 aa  228  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2752  malonyl-CoA synthase  33.9 
 
 		 547 aa  229  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 		 512 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  34.9 
 
 		 518 aa  228  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2582  AMP-dependent synthetase and ligase  40.72 
 
 		 520 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1498  AMP-dependent synthetase and ligase  34.41 
 
 		 531 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1925  malonyl-CoA synthase  34.62 
 
 		 500 aa  228  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  33.93 
 
 		 505 aa  228  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  33.46 
 
 		 512 aa  228  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  36.53 
 
 		 519 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  36.46 
 
 		 520 aa  228  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.94 
 
 		 519 aa  227  4e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.43 
 
 		 530 aa  227  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.28 
 
 		 514 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 508 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  37.01 
 
 		 508 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7687  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  36.34 
 
 		 500 aa  226  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 		 500 aa  226  8e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  35.14 
 
 		 492 aa  226  8e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4793  AMP-dependent synthetase and ligase  35.55 
 
 		 494 aa  226  8e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  35.92 
 
 		 507 aa  226  9e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2819  acyl-CoA synthetase  34.13 
 
 		 529 aa  226  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.427573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  37.17 
 
 		 509 aa  225  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  36.46 
 
 		 508 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.28 
 
 		 503 aa  225  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  30.87 
 
 		 518 aa  226  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 		 521 aa  225  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>