228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6583 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  100 
 
 		 517 aa  1050    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  60.95 
 
 		 508 aa  638    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  63.51 
 
 		 508 aa  658    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6599  galactarate dehydratase  93.86 
 
 		 516 aa  951    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1862  galactarate dehydratase  66.54 
 
 		 538 aa  693    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0179  galactarate dehydratase  69.94 
 
 		 507 aa  723    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  61.34 
 
 		 513 aa  633  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  59.77 
 
 		 523 aa  631  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  59.88 
 
 		 513 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  59.69 
 
 		 513 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  59.49 
 
 		 513 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  58.48 
 
 		 523 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  57.79 
 
 		 533 aa  606  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  56.47 
 
 		 508 aa  598  1e-170  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  59.02 
 
 		 507 aa  600  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  57.5 
 
 		 509 aa  597  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  58.17 
 
 		 515 aa  597  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  58.24 
 
 		 508 aa  594  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  57.99 
 
 		 523 aa  590  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  55.95 
 
 		 508 aa  587  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  58.12 
 
 		 507 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  55.36 
 
 		 508 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  57 
 
 		 513 aa  569  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3898  uronate isomerase  55.99 
 
 		 510 aa  564  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.90307  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6103  D-galactarate dehydratase  55.34 
 
 		 510 aa  561  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  54.06 
 
 		 514 aa  552  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  53.47 
 
 		 514 aa  553  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  54 
 
 		 509 aa  548  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  53.66 
 
 		 514 aa  548  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  54.17 
 
 		 525 aa  542  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0724  Altronate dehydratase  53.16 
 
 		 515 aa  545  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3576  Altronate dehydratase  53.71 
 
 		 510 aa  541  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  55.84 
 
 		 512 aa  540  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  53.06 
 
 		 519 aa  533  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  54.79 
 
 		 507 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  54.79 
 
 		 507 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2347  galactarate dehydratase  52.05 
 
 		 509 aa  533  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1952  Galactarate dehydratase  52.35 
 
 		 507 aa  533  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  54.6 
 
 		 507 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  55.58 
 
 		 501 aa  534  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  53.71 
 
 		 500 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4262  galactarate dehydratase  52.16 
 
 		 507 aa  530  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.892671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  51.95 
 
 		 508 aa  526  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4278  Altronate dehydratase  51.27 
 
 		 507 aa  527  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569461  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  53.52 
 
 		 500 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2082  galactarate dehydratase  52.44 
 
 		 509 aa  522  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.315134  normal  0.334548 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  54.01 
 
 		 511 aa  523  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  53.63 
 
 		 500 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  52.36 
 
 		 507 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  52.36 
 
 		 507 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  53.56 
 
 		 500 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  53.36 
 
 		 500 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  50.87 
 
 		 510 aa  496  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  51.12 
 
 		 533 aa  494  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0495  Altronate dehydratase  49.12 
 
 		 509 aa  491  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  46.29 
 
 		 526 aa  469  1.0000000000000001e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  48.13 
 
 		 508 aa  468  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6490  (D)-galactarate dehydrogenase  40.53 
 
 		 513 aa  335  9e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3265  galactarate dehydratase  41.96 
 
 		 530 aa  333  4e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.133789 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1218  galactarate dehydratase  39.96 
 
 		 518 aa  333  6e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0502126  normal  0.0293032 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  36.79 
 
 		 505 aa  332  1e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0806  galactarate dehydratase  38.72 
 
 		 524 aa  331  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1998  galactarate dehydratase  40.44 
 
 		 520 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257982  normal  0.434412 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0840  galactarate dehydratase  38.99 
 
 		 524 aa  327  3e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2484  galactarate dehydratase  38.89 
 
 		 533 aa  326  5e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000132334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05250  D-galactarate dehydratase  40.77 
 
 		 517 aa  325  9e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3318  galactarate dehydratase  39.63 
 
 		 523 aa  324  3e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1778  galactarate dehydratase  41.09 
 
 		 534 aa  323  4e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479447  normal  0.643906 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4442  galactarate dehydratase  39.63 
 
 		 523 aa  323  4e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.648393 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02993  (D)-galactarate dehydrogenase  39.43 
 
 		 523 aa  323  5e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02944  hypothetical protein  39.43 
 
 		 523 aa  323  5e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0572  galactarate dehydratase  39.63 
 
 		 523 aa  323  5e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0577  galactarate dehydratase  39.63 
 
 		 523 aa  323  6e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3425  galactarate dehydratase  39.43 
 
 		 523 aa  323  6e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3398  galactarate dehydratase  38.23 
 
 		 524 aa  322  7e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3608  galactarate dehydratase  39.55 
 
 		 523 aa  322  7e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3558  galactarate dehydratase  37.83 
 
 		 524 aa  320  3e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4684  galactarate dehydratase  41.3 
 
 		 516 aa  320  5e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.360454  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  34.81 
 
 		 493 aa  316  5e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3442  galactarate dehydratase  39.2 
 
 		 523 aa  316  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3550  galactarate dehydratase  39.2 
 
 		 523 aa  316  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0864027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3444  galactarate dehydratase  39.2 
 
 		 523 aa  316  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3513  galactarate dehydratase  39.2 
 
 		 523 aa  316  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3570  galactarate dehydratase  38.88 
 
 		 523 aa  316  6e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.631935 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0830  D-galactarate dehydratase  38.1 
 
 		 533 aa  316  7e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1597  galactarate dehydratase  37.28 
 
 		 532 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  38.24 
 
 		 514 aa  314  2.9999999999999996e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0256  galactarate dehydratase  38.68 
 
 		 521 aa  311  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4865  galactarate dehydratase  36.12 
 
 		 529 aa  312  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0784645  normal  0.0391217 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2595  galactarate dehydratase  38.72 
 
 		 518 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.865762  normal  0.097428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1721  galactarate dehydratase  37.96 
 
 		 529 aa  310  5.9999999999999995e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0799571  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1575  Altronate dehydratase  36.85 
 
 		 498 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0800  Altronate dehydratase  36.59 
 
 		 512 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6382  galactarate dehydratase  36.74 
 
 		 530 aa  307  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.695023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2315  galactarate dehydratase  38.54 
 
 		 517 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3100  galactarate dehydratase  38.06 
 
 		 517 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3104  galactarate dehydratase  36.88 
 
 		 548 aa  306  6e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2816  galactarate dehydratase  38.91 
 
 		 517 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0628742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3601  D-galactarate dehydratase, putative  38.74 
 
 		 517 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.271934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1138  galactarate dehydratase  39.21 
 
 		 523 aa  304  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>