More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6050 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  761    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5845  peptide chain release factor 2  96.26 
 
 		 321 aa  634  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3166  peptide chain release factor 2  88.47 
 
 		 321 aa  589  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2982  peptide chain release factor 2  87.23 
 
 		 321 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.186364  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3208  peptide chain release factor 2  87.23 
 
 		 321 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  73.94 
 
 		 376 aa  578  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  72.87 
 
 		 376 aa  570  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5077  peptide chain release factor 2  89.1 
 
 		 321 aa  570  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30933  normal  0.0341665 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  71.73 
 
 		 375 aa  561  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  73.14 
 
 		 376 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1305  peptide chain release factor 2  74.86 
 
 		 376 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  73.61 
 
 		 344 aa  533  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  69.33 
 
 		 376 aa  525  1e-148  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  68.27 
 
 		 375 aa  518  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  67.29 
 
 		 376 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0961  peptide chain release factor 2  74.63 
 
 		 342 aa  510  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  hitchhiker  0.00626958 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  64.8 
 
 		 375 aa  502  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  66.13 
 
 		 375 aa  502  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  75.85 
 
 		 322 aa  493  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2265  peptide chain release factor 2  71.03 
 
 		 321 aa  481  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  73.29 
 
 		 322 aa  479  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4671  peptide chain release factor 2  68.94 
 
 		 322 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4200  peptide chain release factor 2  65.94 
 
 		 323 aa  455  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2977  peptide chain release factor 2  61.35 
 
 		 375 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1623  peptide chain release factor 2  61.35 
 
 		 375 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622299  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2040  peptide chain release factor 2  66.56 
 
 		 322 aa  448  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2575  peptide chain release factor 2  62.87 
 
 		 367 aa  449  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1856  peptide chain release factor 2  60.54 
 
 		 375 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  59.84 
 
 		 375 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1715  peptide chain release factor 2  66.77 
 
 		 322 aa  441  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.833664  normal  0.278616 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1825  peptide chain release factor 2  65.84 
 
 		 322 aa  441  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  59.19 
 
 		 402 aa  441  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3006  peptide chain release factor 2  67.39 
 
 		 322 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.743846  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2445  peptide chain release factor 2  66.77 
 
 		 322 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.689282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0868  peptide chain release factor 2  57.03 
 
 		 374 aa  427  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  64.63 
 
 		 323 aa  423  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2851  peptide chain release factor 2  64.91 
 
 		 322 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2533  peptide chain release factor 2  58.92 
 
 		 375 aa  421  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  55.33 
 
 		 372 aa  391  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  53.59 
 
 		 379 aa  392  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  54.23 
 
 		 365 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  54.23 
 
 		 365 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  55.33 
 
 		 349 aa  385  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  54.23 
 
 		 365 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  55.03 
 
 		 349 aa  386  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  54.23 
 
 		 365 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  53.22 
 
 		 371 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  53.94 
 
 		 365 aa  383  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  52.59 
 
 		 367 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  53.8 
 
 		 364 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  51.94 
 
 		 365 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  54.41 
 
 		 382 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  52.59 
 
 		 367 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  52.77 
 
 		 365 aa  378  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  51.39 
 
 		 365 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  52.63 
 
 		 354 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  51.67 
 
 		 365 aa  378  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16510  putative peptide chain release factor 2  55.29 
 
 		 332 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  52.3 
 
 		 367 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3371  peptide chain release factor 2  54.71 
 
 		 378 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  52.6 
 
 		 367 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  52.31 
 
 		 367 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  52.01 
 
 		 459 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  52.77 
 
 		 365 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  52.77 
 
 		 365 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  55.49 
 
 		 325 aa  376  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  52.6 
 
 		 367 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  52.06 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  52.63 
 
 		 365 aa  374  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  53.85 
 
 		 364 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1299  peptide chain release factor 2  60.82 
 
 		 321 aa  373  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0921443  normal  0.567483 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  51.4 
 
 		 372 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  51.46 
 
 		 417 aa  368  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  51.75 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  50.88 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  51.75 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  51.27 
 
 		 406 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  51.75 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  51.75 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2248  hypothetical protein  51.73 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  51.96 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3791  hypothetical protein  50.58 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2773  peptide chain release factor 2  51.17 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0604  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  50.28 
 
 		 365 aa  367  1e-100  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0705  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  48.01 
 
 		 366 aa  367  1e-100  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1069  peptide chain release factor 2  52.34 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2758  peptide chain release factor 2  51.73 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  53.55 
 
 		 354 aa  363  2e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  51.02 
 
 		 349 aa  363  3e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  49.73 
 
 		 380 aa  363  4e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  52.26 
 
 		 374 aa  362  5.0000000000000005e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  55.8 
 
 		 326 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  55.21 
 
 		 340 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  52.37 
 
 		 364 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  49.45 
 
 		 380 aa  362  8e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  54.63 
 
 		 375 aa  361  1e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  50.91 
 
 		 369 aa  361  1e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  49.18 
 
 		 380 aa  360  3e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1310  peptide chain release factor 2  53.05 
 
 		 329 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.496606  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  53.08 
 
 		 383 aa  360  3e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>