More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5881 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
419 aa  853    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3221  glycosyl transferase, group 1  63.14 
 
 
417 aa  519  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  50.9 
 
 
392 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  43.2 
 
 
463 aa  332  8e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  43.22 
 
 
428 aa  330  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  42.69 
 
 
445 aa  313  4.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6558  glycosyl transferase group 1  46.6 
 
 
458 aa  310  4e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1920  glycosyl transferase, group 1  41.65 
 
 
481 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2941  glycosyl transferase group 1  39.95 
 
 
414 aa  306  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4468  glycosyl transferase group 1  41.22 
 
 
457 aa  301  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2794  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
404 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8511  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
418 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0190173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 
417 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0969  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 
395 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0289786  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 
409 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 
405 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
394 aa  96.3  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  27.3 
 
 
394 aa  93.6  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0334  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
411 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.145244 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 
406 aa  92  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 
405 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 
434 aa  90.1  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
405 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  27.22 
 
 
404 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 
381 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
411 aa  85.1  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
393 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.04 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
393 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 
408 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 
419 aa  80.1  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  31.09 
 
 
723 aa  79.7  0.00000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  23.4 
 
 
384 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  22.78 
 
 
373 aa  79.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
517 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
575 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
409 aa  77.4  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
395 aa  77  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0241  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 
371 aa  76.6  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.514608  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
820 aa  75.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  23.6 
 
 
395 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2253  hypothetical protein  22.69 
 
 
386 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0192058  hitchhiker  0.00258376 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.69 
 
 
385 aa  75.1  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  23.69 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
385 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.43 
 
 
383 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  23.95 
 
 
416 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  23.06 
 
 
416 aa  74.3  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 
410 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  23.28 
 
 
419 aa  74.3  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 
405 aa  74.3  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 
407 aa  74.3  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 
372 aa  73.9  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.51 
 
 
403 aa  72.4  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  26.06 
 
 
415 aa  72.8  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  24.42 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
404 aa  72.8  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  24.62 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
378 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0391  glycosyl transferase, group 1  23.34 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0999016  normal  0.0192466 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  25.64 
 
 
421 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  23.43 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
417 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
458 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.07 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
404 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0666  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000035657 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 
433 aa  70.5  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 
402 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  33.33 
 
 
564 aa  70.5  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  35.54 
 
 
416 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  24.6 
 
 
426 aa  69.7  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 
467 aa  70.1  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2570  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
409 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4075  glycosyl transferase, group 1  25.16 
 
 
744 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4414  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63782  normal  0.431195 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08660  glycosyltransferase  30.32 
 
 
484 aa  67.8  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
418 aa  67.8  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 
385 aa  67  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.49 
 
 
413 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.49 
 
 
413 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
425 aa  67  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  23.49 
 
 
413 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 
441 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
429 aa  67  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 
377 aa  66.6  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 
410 aa  66.6  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  23.86 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  26.73 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>