206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3349 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3349  Amidohydrolase 3  100 
 
 		 401 aa  786    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4824  amidohydrolase 3  69.29 
 
 		 413 aa  511  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0344  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  44.91 
 
 		 413 aa  287  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0274445  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  42.82 
 
 		 400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5235  cytosine deaminase  45.29 
 
 		 399 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5624  cytosine deaminase  45.29 
 
 		 399 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209755  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2388  cytosine deaminase  41.48 
 
 		 401 aa  275  8e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3228  cytosine deaminase  40.93 
 
 		 405 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00169195  normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2120  cytosine deaminase  43.15 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4606  cytosine deaminase  44.71 
 
 		 399 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0684595  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  40.11 
 
 		 405 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2101  hydrolase  42.36 
 
 		 399 aa  266  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0067  cytosine deaminase  42.94 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.811575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2348  cytosine deaminase  42.86 
 
 		 397 aa  263  4e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  0.523388 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3224  cytosine deaminase  43.52 
 
 		 399 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.717202  normal  0.270868 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4900  cytosine deaminase  42.82 
 
 		 394 aa  248  9e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.375518 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5340  cytosine deaminase  41.3 
 
 		 398 aa  249  9e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916996  normal  0.0339221 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0068  cytosine deaminase  43.02 
 
 		 394 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5450  cytosine deaminase  43.06 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.680262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5236  cytosine deaminase  43.3 
 
 		 394 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5623  cytosine deaminase  43.3 
 
 		 394 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  normal  0.0436616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3146  cytosine deaminase  38.4 
 
 		 398 aa  242  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4607  cytosine deaminase  43.3 
 
 		 394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0374534  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0416  cytosine deaminase  37.7 
 
 		 399 aa  239  9e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3184  cytosine deaminase  40.98 
 
 		 393 aa  236  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379917  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5791  cytosine deaminase  38.05 
 
 		 397 aa  229  5e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159101  hitchhiker  0.000445304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0538  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  39.09 
 
 		 399 aa  226  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000264228  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3225  cytosine deaminase  41.9 
 
 		 394 aa  222  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4847  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  38.44 
 
 		 376 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1451  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  36.73 
 
 		 395 aa  203  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.885919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3600  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  34.41 
 
 		 410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28020  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  35.73 
 
 		 414 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1703  Amidohydrolase 3  36.04 
 
 		 395 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152094  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1057  putative deaminase  36.98 
 
 		 462 aa  196  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1061  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  34.62 
 
 		 409 aa  190  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3622  amidohydrolase 3  35.28 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.495832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0624  putative deaminase  30.87 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.693266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4611  putative deaminase  30.68 
 
 		 413 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4229  putative deaminase  29.88 
 
 		 421 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4631  putative deaminase  31.14 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4331  putative deaminase  30.4 
 
 		 415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4389  putative deaminase  30.91 
 
 		 416 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4728  putative deaminase  30.91 
 
 		 414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4607  putative deaminase  30.91 
 
 		 416 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0096  putative deaminase  33.08 
 
 		 464 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00279  deaminase  34.31 
 
 		 460 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3282  Amidohydrolase 3  34.31 
 
 		 460 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4230  putative deaminase  30.91 
 
 		 416 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3299  putative deaminase  34.31 
 
 		 460 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00283  hypothetical protein  34.31 
 
 		 460 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4242  putative deaminase  30.61 
 
 		 416 aa  173  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.796555  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0342  putative deaminase  33.99 
 
 		 414 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0384  putative deaminase  33.99 
 
 		 414 aa  172  9e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4388  putative deaminase  29.38 
 
 		 421 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4727  putative deaminase  29.38 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4606  putative deaminase  29.63 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2198  putative deaminase  34.48 
 
 		 445 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4241  putative deaminase  29.38 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0389  putative deaminase  33.66 
 
 		 460 aa  169  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3140  putative deaminase  32.17 
 
 		 459 aa  169  7e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0354  putative deaminase  33.66 
 
 		 460 aa  169  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  27.25 
 
 		 409 aa  167  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7130  putative deaminase  30.37 
 
 		 445 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  30.41 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  32.77 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  28.93 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  29.5 
 
 		 411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.44 
 
 		 428 aa  131  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  32.02 
 
 		 413 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5704  Cytosine deaminase  33.82 
 
 		 436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  32.06 
 
 		 432 aa  126  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  30.1 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  28.22 
 
 		 426 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0410  cytosine deaminase  27.11 
 
 		 427 aa  123  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  28.13 
 
 		 424 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.65 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  27.11 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  27.11 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  29.09 
 
 		 422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  26.55 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3269  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.55 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1594  cytosine deaminase  29.88 
 
 		 423 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  27.11 
 
 		 427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  27.11 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00295  hypothetical protein  26.55 
 
 		 427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  28.86 
 
 		 418 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  28.86 
 
 		 418 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  28.86 
 
 		 418 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0603  cytosine deaminase  28.86 
 
 		 418 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281671  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0864  cytosine deaminase  28.86 
 
 		 418 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1831  cytosine deaminase  28.86 
 
 		 418 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226941  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1639  cytosine deaminase  28.27 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233761  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0828  cytosine deaminase  32.37 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5700  Cytosine deaminase  29.97 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  26.39 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4281  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.19 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1495  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.3 
 
 		 423 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55402  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0098  Amidohydrolase 3  28.78 
 
 		 427 aa  116  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.494742  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0763  Cytosine deaminase  27.74 
 
 		 417 aa  116  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.991086  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0237  cytosine deaminase  25.14 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>