67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0803 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0803  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 415 aa  785    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4177  major facilitator transporter  54.94 
 
 		 405 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3245  major facilitator transporter  54.99 
 
 		 411 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178164  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3980  major facilitator transporter  55.33 
 
 		 411 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3142  hypothetical protein  55.11 
 
 		 400 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856051  normal  0.126426 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3349  major facilitator transporter  49.11 
 
 		 406 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4993  major facilitator transporter  46.46 
 
 		 399 aa  280  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.691753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4836  major facilitator superfamily MFS_1  46.81 
 
 		 423 aa  280  5e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0503623 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5027  major facilitator superfamily MFS_1  44.06 
 
 		 414 aa  249  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.163656 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2043  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 405 aa  234  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1135  major facilitator transporter  37.78 
 
 		 388 aa  202  9e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5067  MFS superfamily transporter  40.16 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2156  major facilitator transporter  39.84 
 
 		 391 aa  191  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000582511 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3400  hypothetical protein  39.5 
 
 		 393 aa  190  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3632  major facilitator superfamily transporter  37.76 
 
 		 391 aa  186  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0641  major facilitator transporter  38.98 
 
 		 408 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0618  major facilitator superfamily MFS_1  39.84 
 
 		 391 aa  183  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2330  major facilitator transporter  38.33 
 
 		 386 aa  176  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.077775  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2542  major facilitator superfamily MFS_1  38.13 
 
 		 400 aa  170  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1044  major facilitator transporter  37.04 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122672 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1751  major facilitator superfamily MFS_1  37.98 
 
 		 401 aa  162  7e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1673  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 		 391 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2491  major facilitator family transporter  31.42 
 
 		 420 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 		 417 aa  149  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2536  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 414 aa  139  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1564  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 432 aa  113  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 429 aa  112  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 415 aa  89.7  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.41 
 
 		 437 aa  53.5  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0450  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 410 aa  51.6  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0280887  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  27.24 
 
 		 437 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21441  predicted protein  25.68 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389719  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 455 aa  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1024  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.204165  normal  0.764355 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  32.35 
 
 		 433 aa  47.8  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  28.39 
 
 		 436 aa  47.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 451 aa  47.4  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3283  MFS family transporter  25.07 
 
 		 450 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170295  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0689  transport protein of the major facilitator  35.54 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 411 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 433 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15140  3-hydroxyphenylpropionic acid transporter  36.89 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1985  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  27.54 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.884683 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0675  hypothetical protein  25.85 
 
 		 427 aa  44.7  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04481  monocarboxylate transporter (Eurofung)  28.08 
 
 		 510 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.129733  normal  0.497069 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  26.13 
 
 		 428 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 457 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 457 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 457 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 430 aa  43.9  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1770  major facilitator superfamily protein  35.45 
 
 		 433 aa  43.5  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.778177  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0692  hypothetical protein  26.67 
 
 		 427 aa  43.5  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3698  putative sialic acid transporter  30.83 
 
 		 496 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3529  putative sialic acid transporter  30.83 
 
 		 496 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3531  putative sialic acid transporter  30.83 
 
 		 496 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3636  putative sialic acid transporter  30.83 
 
 		 496 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3601  putative sialic acid transporter  30.83 
 
 		 496 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2763  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 		 374 aa  43.1  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.640372  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 		 429 aa  43.1  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11030  Sugar (and other) transporter  28.65 
 
 		 472 aa  43.1  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.267916  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  30.66 
 
 		 441 aa  43.1  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>