231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0133 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0133  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 180 aa  363  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333661  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2672  phosphoglycerate mutase  81.98 
 
 		 176 aa  286  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0137  phosphoglycerate mutase  54.97 
 
 		 184 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1396  Phosphoglycerate mutase  39.43 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0105349  normal  0.20859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1676  Phosphoglycerate mutase  38.86 
 
 		 203 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  0.436187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2243  phosphoglycerate mutase  39.67 
 
 		 195 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1401  phosphoglycerate mutase  39.43 
 
 		 225 aa  89  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118835 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2210  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  47.62 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  39.32 
 
 		 440 aa  62.4  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  35.85 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  35.85 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0209  phosphoglycerate mutase family protein  26.83 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155223 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32.24 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1977  Phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00635412  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46353  predicted protein  27.87 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92911  predicted protein  30 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.846353  normal  0.142563 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.17 
 
 		 382 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  42 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  29.94 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  28.22 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 		 237 aa  52.8  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 411 aa  52  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  41.77 
 
 		 209 aa  52  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  33.61 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1844  phosphoglycerate mutase  35.16 
 
 		 226 aa  52  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000187954  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  29.1 
 
 		 207 aa  51.6  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  45.59 
 
 		 213 aa  51.6  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0268  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 230 aa  51.2  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  45.33 
 
 		 208 aa  51.2  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 207 aa  51.2  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0564  phosphoglycerate mutase  35.51 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  39.56 
 
 		 224 aa  51.2  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 240 aa  51.2  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  39 
 
 		 203 aa  51.2  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  24.87 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1822  phosphoglycerate mutase family protein  22.94 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.125465  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0783  phosphoglycerate mutase family protein  33.68 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  37.11 
 
 		 217 aa  50.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  43.21 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0055  Phosphoglycerate mutase  34.44 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0249484  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13280  fructose-2,6-bisphosphatase  38.3 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  44.58 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  38.55 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  28.57 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  39.56 
 
 		 224 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1876  phosphoglycerate mutase family protein  25.93 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  39.08 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0772  phosphoglycerate mutase  30.18 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1571  phosphoglycerate mutase family protein; fructose-2,6-bisphosphatase  25.93 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  33.77 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1795  phosphoglycerate mutase family protein  27.1 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  27.22 
 
 		 209 aa  48.5  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  39.36 
 
 		 214 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4770  Phosphoglycerate mutase  36.49 
 
 		 168 aa  48.5  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.12947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  26.54 
 
 		 196 aa  48.1  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 229 aa  48.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  24.34 
 
 		 203 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1619  phosphoglycerate mutase family protein  27.1 
 
 		 191 aa  47.8  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391089  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1745  phosphoglycerate mutase family protein  27.1 
 
 		 191 aa  47.8  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  37.66 
 
 		 189 aa  47.8  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1435  phosphoglycerate mutase  27.17 
 
 		 193 aa  47.8  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1761  phosphoglycerate mutase family protein  25.93 
 
 		 191 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 227 aa  47.8  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.37 
 
 		 442 aa  47.8  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  23.81 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0041  phosphoglycerate mutase  38.2 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  23.81 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  23.81 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  23.81 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4034  phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 223 aa  47  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  28.75 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  34.62 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  23.81 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  30.68 
 
 		 210 aa  47  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  37.35 
 
 		 223 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 		 228 aa  47  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  39.71 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1580  phosphoglycerate mutase family protein; fructose-2,6-bisphosphatase  28.75 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000315491  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3089  phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 		 252 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351305 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  28.3 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1875  phosphoglycerate mutase family protein  32.93 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4362  Phosphoglycerate mutase  38.82 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.05 
 
 		 369 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.18 
 
 		 378 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  32.45 
 
 		 391 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  36.08 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  42.19 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3655  Phosphoglycerate mutase  36.47 
 
 		 374 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  38.96 
 
 		 370 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>