More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4041 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4609  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  55.24 
 
 
842 aa  967    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.303865 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2384  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  56.9 
 
 
832 aa  1013    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4041  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  100 
 
 
837 aa  1739    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3632  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.95 
 
 
826 aa  643    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.934008 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4818  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  56.95 
 
 
833 aa  999    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4298  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  58 
 
 
832 aa  1031    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192425  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5046  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.67 
 
 
820 aa  596  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0984554  normal  0.0303559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4058  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  25.68 
 
 
818 aa  164  9e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.150838  normal  0.84095 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0600  putative acyl-CoA transferase  25.07 
 
 
745 aa  129  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206759  normal  0.170635 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7334  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.26 
 
 
393 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6841  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  26.36 
 
 
417 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3774  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  23.95 
 
 
811 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199117  normal  0.974632 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3835  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  23.64 
 
 
811 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3762  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  23.64 
 
 
811 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3563  Formyl-CoA transferase  27.11 
 
 
399 aa  119  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0683  Formyl-CoA transferase  28.7 
 
 
416 aa  118  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521571  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2275  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  25.24 
 
 
401 aa  118  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.559073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1959  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.57 
 
 
369 aa  117  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166829  normal  0.79155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  27.39 
 
 
729 aa  117  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.014296  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5571  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  24.39 
 
 
415 aa  115  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6129  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35 
 
 
418 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6960  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  27.65 
 
 
383 aa  115  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5985  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.68 
 
 
383 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2605  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  25.3 
 
 
400 aa  114  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0482771 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6281  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  27.95 
 
 
383 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6417  Formyl-CoA transferase  35 
 
 
418 aa  114  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.478883  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3255  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  26.1 
 
 
340 aa  114  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.449136  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4617  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  27.39 
 
 
388 aa  114  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0456  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  25.95 
 
 
396 aa  114  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5656  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  26.4 
 
 
786 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3227  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  26.01 
 
 
410 aa  114  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4518  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  25.7 
 
 
385 aa  114  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2714  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  25.97 
 
 
396 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4167  Alpha-methylacyl-CoA racemase  25.39 
 
 
387 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1122  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.19 
 
 
386 aa  113  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.444821  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0893  acyl-CoA transferases/carnitine dehydratase-like protein  23.68 
 
 
722 aa  112  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0910891  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6612  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.1 
 
 
383 aa  111  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6581  acyl-CoA transferase/carnitine dehydratase  26.74 
 
 
385 aa  111  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377335  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_003296  RS03121  hypothetical protein  35.92 
 
 
383 aa  111  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6249  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35 
 
 
393 aa  111  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3685  pyruvate carboxyltransferase  26.77 
 
 
744 aa  111  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0437  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.27 
 
 
392 aa  110  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5625  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  26.25 
 
 
415 aa  110  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.344287  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1099  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.2 
 
 
392 aa  110  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325379  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5761  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.34 
 
 
393 aa  110  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.878418  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3138  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.18 
 
 
392 aa  110  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0937  Formyl-CoA transferase  25.13 
 
 
407 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5366  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  26.16 
 
 
786 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2060  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.31 
 
 
384 aa  109  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.216731  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4307  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.56 
 
 
396 aa  110  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5277  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  26.16 
 
 
786 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1851  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.59 
 
 
404 aa  108  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.990249  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0458  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  25.13 
 
 
429 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5109  putative L-carnitine dehydrogenase  25.93 
 
 
408 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367445  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0807  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.77 
 
 
412 aa  109  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6300  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  24.14 
 
 
399 aa  108  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3087  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  25.23 
 
 
411 aa  108  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2731  Alpha-methylacyl-CoA racemase  28.6 
 
 
389 aa  108  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5552  putative formyl-coenzyme A transferase  36.12 
 
 
429 aa  108  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6900  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  27.59 
 
 
395 aa  108  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2971  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.25 
 
 
419 aa  108  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315436  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2908  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  26 
 
 
411 aa  108  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1266  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.58 
 
 
436 aa  108  5e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3771  Formyl-CoA transferase  32.2 
 
 
395 aa  108  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.531066  normal  0.292423 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0206  Formyl-CoA transferase  23.72 
 
 
393 aa  108  6e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.640391 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0428  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  27.63 
 
 
392 aa  107  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4272  Formyl-CoA transferase  31.31 
 
 
393 aa  107  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.329604  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8312  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.13 
 
 
425 aa  107  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0250341  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1744  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.8 
 
 
402 aa  107  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0300334  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2763  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.5 
 
 
399 aa  107  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2948  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  27.99 
 
 
387 aa  107  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0880  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  25.68 
 
 
392 aa  106  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2489  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.78 
 
 
402 aa  106  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.487747  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5437  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  27.14 
 
 
377 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0266  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.03 
 
 
440 aa  107  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.888625  normal  0.0449851 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1329  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.83 
 
 
423 aa  107  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.94269  normal  0.646992 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3535  putative L-carnitine dehydratase  28.47 
 
 
427 aa  107  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3594  hypothetical protein  31.33 
 
 
439 aa  107  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903396  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2368  putative L-carnitine dehydratase/bile acid- inducible protein F  28.9 
 
 
435 aa  107  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891999  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0706  Alpha-methylacyl-CoA racemase  29.66 
 
 
395 aa  107  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848354  normal  0.893078 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0899  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.01 
 
 
407 aa  107  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1835  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.1 
 
 
409 aa  107  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1603  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.78 
 
 
347 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0977519  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3636  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  27.51 
 
 
367 aa  107  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1602  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  24.91 
 
 
849 aa  106  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2229  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  25.23 
 
 
396 aa  106  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.135907  normal  0.368689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4160  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.09 
 
 
407 aa  106  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2333  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  23.93 
 
 
779 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.571725 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0845  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.5 
 
 
431 aa  106  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0637303 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3513  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  27.37 
 
 
387 aa  106  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.590077  normal  0.347473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1389  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  26.89 
 
 
411 aa  106  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.853054  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2013  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  23.54 
 
 
415 aa  105  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226026  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6317  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.57 
 
 
392 aa  105  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136735  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5748  Formyl-CoA transferase  25.06 
 
 
397 aa  105  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0909  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.33 
 
 
479 aa  105  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.756109  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2211  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.89 
 
 
426 aa  105  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.859864 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5950  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  24.87 
 
 
386 aa  105  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.12278  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0265  Alpha-methylacyl-CoA racemase  33.33 
 
 
408 aa  105  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125421  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3677  hypothetical protein  35.38 
 
 
390 aa  105  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0288524  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0058  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  25.68 
 
 
398 aa  105  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>